抗病毒反应干扰素信号转导的长非编码 RNA 上调子; LUARIS

长非编码 RNA 32
长链RNA32

HGNC 批准的基因符号：LUARIS

细胞遗传学位置：7p13 基因组坐标（GRCh38）：7:43,508,728-43,522,542（来自 NCBI）

▼ 说明

LUARIS 是一种长非编码 RNA（lncRNA），通过控制干扰素刺激的基因表达来促进抗病毒反应（Nishitsuji et al., 2016）。

▼ 克隆与表达

Nishitsuji 等人使用 cDNA 微阵列分析来鉴定参与永生化人肝细胞（HuS 细胞）先天免疫反应的 lncRNA（2016）鉴定了 LUARIS，他们将其称为 lncRNA32。 lncRNA32 转录物包含 2,964 个核苷酸。定量 RT-PCR 分析检测到 14 种人体组织中 lncRNA32 存在差异表达，其中睾丸、卵巢、大脑和肾脏的水平最高。

▼ 测绘

西辻等人（2016）指出，LUARIS 基因对应到染色体 7p13。它在反义方向上与 HECW1 基因（610384）的内含子 21 和 22 以及外显子 22 重叠。

▼ 基因功能

西辻等人（2016）发现，在用聚（I:C）刺激的野生型 HuS 细胞中，lncRNA32 表达下调，但在用聚（I:C）刺激的 IRF3（603734）敲除型 HuS 细胞中则没有下调。尽管用聚（I:C）进行预处理，但 lncRNA32 的敲低会降低脑心肌炎病毒（EMCV）感染的 HuS 细胞的活力。定量 RT-PCR 和 Northern 印迹分析表明，干扰素 β（IFNB；147640）处理可抑制 HuS 细胞中 lncRNA32 的表达。在存在或不存在 IFNB 的情况下，lncRNA32 的敲低会降低 EMCV 感染后 HuS 细胞的活力，并且 lncRNA32 的异位表达会降低感染后的 EMCV 水平。 HuS 细胞中 lncRNA32 的沉默降低了许多干扰素刺激的基因和趋化因子的表达，包括 IRF7 和 IP10（CXCL10; 147310），而 lncRNA32 的过度表达则增加了其中一些基因的表达。在从含有人原代肝细胞的 PLAU（191840）转基因/SCID 小鼠分离的 PXB 细胞和 THP-1 巨噬细胞中，IFNB 处理后，lncRNA32 的表达降低。 RNA Pull-down 测定和免疫沉淀分析表明，lncRNA32 与异质核核糖核蛋白 U（hnRNPU；602869）和 ATF2（123811）相互作用。 IFNB处理或敲低hnRNPU均可降低lncRNA32表达，但IFNB处理对hnRNPU敲低细胞中的lncRNA32表达没有影响，表明IFNB处理导致的lncRNA32表达降低是hnRNPU依赖性的。 IFNB 处理导致的 lncRNA32 表达减少并不是由 hnRNPU 表达的变化引起的，并且 hnRNPU 敲低细胞中 lncRNA32 的过度表达挽救了 IP10 的表达。 RNA免疫沉淀分析表明，lncRNA32与DNA结合蛋白ATF2相互作用，并且lncRNA32的3-prime半片段特异性结合重组ATF2。在 lncRNA32 过表达细胞中敲低 ATF2 会降低多个 lncRNA32 调节基因的水平。作者在 IRF7 变体 A 的内含子 1 中鉴定出 ATF2 结合 cAMP 响应元件。染色质免疫沉淀分析证实 ATF2 存在于 IRF7 变体 A 的内含子 1 上，并且 lncRNA32 的沉默会损害 ATF2 结合。敲除研究表明，lncRNA32 有助于原代人肝细胞中的抗乙型肝炎病毒和抗丙型肝炎病毒反应。西辻等人（2016）提出lncRNA32通过控制干扰素刺激的基因表达来正向调节抗病毒反应。