PET100 细胞色素 c 氧化酶伴侣; PET100

  • PET100,酿酒酵母,
  • 19 号染色体开放解读码组 79 的同源物;C19ORF79

HGNC 批准基因符号:PET100

细胞遗传学定位:19p13.2 基因组坐标(GRCh38):19:7,629,793-7,631,956(来自 NCBI)

▼ 说明

PET100 基因编码参与线粒体复合物 IV 生物发生的蛋白质(Lim 等人总结,2014)。

▼ 克隆与表达

Szklarczyk 等人使用数据库分析和蛋白质分析来鉴定酵母细胞色素 C 氧化酶(COX) 组装蛋白的人类直系同源物,然后对心脏 cDNA 文库进行 PCR(2012)克隆PET100。小鼠心脏 Pet100 定位于线粒体。

▼ 基因功能

斯克拉奇克等人(2012) 表明表位标记的 PET100 与来自转染 HEK293 细胞的 COX 组装蛋白 COX17(604813) 和 COX IV 亚基 COX7A2(123996) 共纯化。

Lim 等人使用免疫荧光法(2014) 表明 PET100 定位于人成纤维细胞的线粒体内膜。PET100 蛋白组装成 300 kD 的复合物,该复合物会随着时间的推移而积累,并且依赖于线粒体膜电位。该复合物不同于内源复合物 IV。

▼ 测绘

Hartz(2012) 根据 PET100 序列(GenBank AK124717) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 PET100 基因定位到染色体 19p13.2。

▼ 分子遗传学

Lim 等人在来自 6 个家族的 8 名患有线粒体复合物 IV 缺陷核型 12(MC4DN12; 619055) 的患者中(2014) 鉴定了 PET100 基因中的纯合突变(M1?; 614770.0001),预计会废除翻译起始密码子。该突变是通过纯合性作图结合候选区域的靶向测序发现的,与所有家族中的疾病分离。另外 81 名被转介进行 OXPHOS 缺陷分析的黎巴嫩人中,有两人也被发现携带纯合子 M1?突变。所有患者均为居住在澳大利亚的黎巴嫩裔,其中 6 个家庭已知为近亲。研究结果与该人群的创始人效应一致,并且该突变估计至少有 520 岁了。体外功能研究表明,突变体 PET100 不会被导入线粒体,并且无法组装成 300 kD 复合物。研究结果表明 N 末端对于线粒体定位至关重要。尽管亚基已翻译,但患者成纤维细胞显示复合体 IV 全酶显着损失,表明存在组装缺陷。患者细胞中野生型基因的过度表达恢复了 COX2 水平和复杂的 IV 组装。研究结果表明,PET100 在复杂 IV 组装的中间阶段发挥作用。尽管子单元已翻译,但表明存在组装缺陷。患者细胞中野生型基因的过度表达恢复了 COX2 水平和复杂的 IV 组装。研究结果表明,PET100 在复杂 IV 组装的中间阶段发挥作用。尽管子单元已翻译,但表明存在组装缺陷。患者细胞中野生型基因的过度表达恢复了 COX2 水平和复杂的 IV 组装。研究结果表明,PET100 在复杂 IV 组装的中间阶段发挥作用。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):

.0001 线粒体复合物 IV 缺陷,核类型 12
PET100,MET1?

Lim 等人在来自 6 个家族的 8 名患者中发现了线粒体复合物 IV 缺陷核型 12(MC4DN12; 619055),其表型与 Leigh 综合征一致(见 256000)(2014) 鉴定了 PET100 基因外显子 1 中的纯合 c.3G-C 颠换,预计会消除翻译起始密码子(met1-to-?;M1?)。该突变是通过纯合性作图结合候选区域的靶向测序发现的,与所有家族中的疾病分离。在 dbSNP(版本 132)或 1000 基因组计划数据库中未找到它。另外 81 名被转介进行 OXPHOS 缺陷分析的黎巴嫩人中,有两人也被发现携带纯合子 M1?突变。所有患者都是居住在澳大利亚的黎巴嫩裔,其中6个家庭是近亲。研究结果与该人群的创始人效应一致,并且该突变估计至少有 520 岁了。该突变可能会导致在残基 10(met10) 处的下一个甲硫氨酸处开始翻译,从而产生突变蛋白 1_9del。体外功能研究表明,突变体 1_9del 不会被导入线粒体,并且无法组装成 300 kD 复合物。研究结果表明 N 末端对于线粒体定位至关重要。尽管亚基已翻译,但患者成纤维细胞显示复合体 IV 全酶显着损失,表明存在组装缺陷。患者细胞中野生型基因的过度表达恢复了 COX2 水平和复杂的 IV 组装。据估计,这种突变至少有 520 年的历史。该突变可能会导致在残基 10(met10) 处的下一个甲硫氨酸处开始翻译,从而产生突变蛋白 1_9del。体外功能研究表明,突变体 1_9del 不会被导入线粒体,并且无法组装成 300 kD 复合物。研究结果表明 N 末端对于线粒体定位至关重要。尽管亚基已翻译,但患者成纤维细胞显示复合体 IV 全酶显着损失,表明存在组装缺陷。患者细胞中野生型基因的过度表达恢复了 COX2 水平和复杂的 IV 组装。据估计,这种突变至少有 520 年的历史。该突变可能会导致在残基 10(met10) 处的下一个甲硫氨酸处开始翻译,从而产生突变蛋白 1_9del。体外功能研究表明,突变体 1_9del 不会被导入线粒体,并且无法组装成 300 kD 复合物。研究结果表明 N 末端对于线粒体定位至关重要。尽管亚基已翻译,但患者成纤维细胞显示复合体 IV 全酶显着损失,表明存在组装缺陷。患者细胞中野生型基因的过度表达恢复了 COX2 水平和复杂的 IV 组装。体外功能研究表明,突变体 1_9del 不会被导入线粒体,并且无法组装成 300 kD 复合物。研究结果表明 N 末端对于线粒体定位至关重要。尽管亚基已翻译,但患者成纤维细胞显示复合体 IV 全酶显着损失,表明存在组装缺陷。患者细胞中野生型基因的过度表达恢复了 COX2 水平和复杂的 IV 组装。体外功能研究表明,突变体 1_9del 不会被导入线粒体,并且无法组装成 300 kD 复合物。研究结果表明 N 末端对于线粒体定位至关重要。尽管亚基已翻译,但患者成纤维细胞显示复合体 IV 全酶显着损失,表明存在组装缺陷。患者细胞中野生型基因的过度表达恢复了 COX2 水平和复杂的 IV 组装。

.0002 线粒体复合物 IV 缺陷,核类型 12
PET100,GLN48TER

Olahova 等人在一名由近亲英国巴基斯坦人父母所生的新生女孩中发现,该女孩患有线粒体复合物 IV 缺陷核型 12(MC4DN12; 619055)(2015) 鉴定了 PET100 基因中的纯合 c.142C-T 转换(c.142C-T, NM_001171155.1),导致 gln48 到 ter(Q48X) 替换。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,与家族中的疾病分离。患者成纤维细胞和骨骼肌表现出孤立的复合物 IV 活性受损,COX 组装存在严重缺陷,复合物 IV 蛋白的稳态水平降低,完全组装的复合物 IV 数量减少。