锌指蛋白 91; ZNF91
HGNC 批准的基因符号:ZNF91
细胞遗传学位置:19p12 基因组坐标(GRCh38):19:23,305,004-23,395,471(来自 NCBI)
▼ 说明
ZNF91 基因编码 KRAB(Kruppel 相关框)亚家族的锌指蛋白(Bellefroid 等,1991 和 Bellefroid 等,1993)。
▼ 基因家族
据估计,人类基因组包含 300 至 700 个锌指蛋白(ZNF) 基因。ZNF 与核酸结合,执行许多关键功能,其中最重要的是调节转录。C2H2 ZNF 家族的特征是大约 28 个氨基酸的重复锌指基序,使用 2 个半胱氨酸残基和 2 个组氨酸残基螯合锌离子。这些 ZNF 中的绝大多数被归类为 Kruppel 样,因为它们包含保守的 6 个氨基酸 H/C 连接,即连接连续指状重复的区域。大约三分之一的 Kruppel 样 ZNF 在其 N 端非指区域包含一个保守的、大约 75 个氨基酸的基序,称为 Kruppel 相关框(KRAB)(Bellefroid 等,1991)。KRAB 由 2 个模块组成,即 A 框和 B 框(Bellefroid 等人总结,1993)。
▼ 克隆与表达
Bellefroid 等人通过筛选源自人未分化胚胎癌细胞系的 cDNA 文库,其中包含 ZNF85(603899) N 端非指区域的编码序列(该区域跨越 KRAB 结构域)(1991) 分离出编码 11 种不同 KRAB 锌指蛋白的 cDNA,其中包括 ZNF91,他们将其称为 HTF10。
贝尔弗洛伊德等人(1993)分离出全长人畸胎癌细胞ZNF91 cDNA。它编码一个预测的 1,182 个氨基酸的蛋白质,包含 N 端 KRAB 结构域,其中包括 KRAB A 和 KRAB B 模块,以及由类似 Kruppel 的 H/C 连接序列分隔的 35 个连续指状重复序列。KRAB 结构域和指簇通过 92 个氨基酸的间隔元件连接,该间隔元件在 KRAB 锌指蛋白的子集中是保守的;作者指出,该间隔区定义了 ZNF91 亚家族。通过 PCR,Bellefroid 等人(1993) 鉴定了代表另外 2 种 ZNF91 mRNA 亚型的 cDNA,其中一种编码缺乏 KRAB B 模块的推导蛋白,另一种编码缺乏 KRAB A 和 KRAB B 模块的蛋白质。Northern 印迹分析在所有测试的人体组织中检测到 4.4 kb ZNF91 转录物,
▼ 基因功能
雅各布斯等人(2014) 报道,ZNF91 和 ZNF93(603975),2 个灵长类特异性 KRAB 锌指基因,在 2 个不同的逆转录转座子家族 SINE-VNTR-Alu(SVA) 和长散布核元件 1(LINE1) 开始在人类祖先基因组中遗传后不久,迅速进化以抑制它们。ZNF91 在 8 到 1200 万年前经历了一系列结构变化,使其能够抑制 SVA 元素。ZNF93 较早进化来抑制灵长类 L1 谱系,直到大约 1250 万年前,逆转录转座子的 L1PA3 亚家族通过去除 ZNF93 结合位点而逃脱了 ZNF93 的限制。
▼ 基因结构
贝尔弗洛伊德等人(1993)确定ZNF91的每个KRAB模块由单独的外显子编码,并且锌指结构域由单个外显子编码。
▼ 测绘
通过体细胞杂交分析和 FISH,Bellefroid 等人(1993) 将 ZNF91 基因定位到染色体 19p13.1-p12。他们发现ZNF91基因家族的大多数成员都聚集在这个区域。