ARAF 原癌基因、丝氨酸/苏氨酸激酶; ARAF

  • V-RAF 鼠肉瘤 3611 病毒癌基因同源物 1;ARAF1
  • 癌基因 ARAF1
  • RAFA1
  • 癌基因 PKS2

HGNC 批准的基因符号:ARAF

细胞遗传学定位:Xp11.3 基因组坐标(GRCh38):X:47,561,205-47,571,908(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

Mark 等人通过降低严格性筛选胎儿肝脏 cDNA 文库中的 v-raf 相关序列(1986) 在预期的 RAF1(164760) 之外还发现了一个序列。他们将这个序列称为 PKS(大概是“蛋白激酶序列”),显示出与 RAF1 71% 的核苷酸同源性。预测的激酶结构域的氨基酸序列与v-raf的序列非常相似,表明PKS可能编码具有丝氨酸/苏氨酸激酶活性的多肽。马克等人(1986) 发现,从 2 名伴有异常蛋白血症的血管免疫母细胞淋巴结病患者分离的外周血单核细胞中,PKS mRNA(2.7 kb) 的表达升高,这是一种在 B 细胞淋巴增殖激活后产生自身抗体的疾病。

Huebner 等人通过使用 v-raf 癌基因探针筛选小鼠 cDNA 文库(1986)还分离出了一种与raf相关的转化cDNA,A-raf,它代表了一个不同于RAF1的基因。作为分析这种 RAF1 相关 cDNA 的第一步,他们分离了人类 ARAF cDNA,并用它来绘制小鼠和人类的基因图谱。

贝克等人(1987)从 2,453 个核苷酸的 cDNA 序列中推导出人类 ARAF1 癌基因的完整 606 个氨基酸序列。

尤里耶夫等人(2000) 指出 ARAF 包含一个 N 端调节结构域和一个 C 端催化结构域。调节域包含 RAS(HRAS; 190020) 结合域和富含半胱氨酸的域。对分级大鼠肝脏的免疫组织化学分析和免疫电子显微镜显示,Araf 的一部分定位于线粒体。

▼ 基因功能

由于其激酶结构域与 RAF1 具有 80% 的同源性,Huebner 等人(1986)推测ARAF1基因产物可能具有丝氨酸/苏氨酸特异性激酶活性。

RAF 原癌基因编码细胞质蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶,在细胞生长和发育中发挥关键作用。小鼠中的 Araf1 主要在泌尿生殖组织中表达(Lee 等,1994)。

Pelkmans 和 Zerial(2005) 探讨了一些激酶在小窝动力学中的作用。利用 RNAi,他们确定了小凹循环不同步骤的功能。第一步,ARAF1(一种参与有丝分裂信号传导的丝氨酸/苏氨酸激酶)的沉默导致除了特征性的点状图案外,还产生横向移动的弥漫性 CAV1(601047)-GFP 染色。作者认为,在缺乏 ARAF1 的情况下,凹状涂层稳定性较差或组装效率低下。他们的观察揭示了小窝转移的新原理,并表明小窝的动态特性及其转移能力受到在多个水平上运作的不同激酶的调节。

Yuryev 等人使用 HeLa 细胞的酵母 2 杂交分析(2000) 表明 ARAF 的 N 末端调节域与假定的线粒体蛋白 TOM(PPRF6; 613979) 和 TIM44(TIMM44; 605058) 相互作用。

▼ 基因结构

李等人(1994)证明人类的 ARAF1 基因包含 16 个外显子,由至少 10,776 个核苷酸编码。

▼ 测绘

休布纳等人(1986) 使用人类 ARAF cDNA 绘制了小鼠和人类的基因图谱。在中国仓鼠-小鼠杂交细胞中,小鼠基因与X染色体共分离。在人类中,2 个孤立分离的基因座(命名为 ARAF1 和 ARAF2)分别对应到 X 和 7 号染色体(Huebner 等人(1986)并未最终证明 7 号染色体上的 ARAF2 基因座被转录,实际上 ARAF2 基因座(现在称为 ARAF2P)已被证明是一个假基因(Lee 等人,1994)。)小鼠的单个 X 连锁 ARAF 基因座和人的 ARAF1 基因座在几种小鼠和人类细胞系中活跃转录。通过原位杂交,Huebner 等人(1986) 将 ARAF1 基因对应到 Xp21-q11,大多数谷物位于 Xp13-p11。Popescu 和 Mark(1989) 通过原位杂交将该基因定位到 Xp11.4-p11.2。

阿夫纳等人(1987) 发现小鼠中的 A-raf 癌基因位于 X 染色体上,距离 Hprt 基因近端 10 至 17 cM。该定位被认为与人类着丝粒和 Xp21 之间的 X 染色体短臂上存在 ARAF 癌基因相一致。