木糖基转移酶2; XYLT2
- XT2
- UDP-D-木糖:蛋白聚糖核心蛋白 β-D-木糖基转移酶 2
HGNC 批准的基因符号:XYLT2
细胞遗传学位置:17q21.33 基因组坐标(GRCh38):17:50,346,126-50,361,185(来自 NCBI)
▼ 说明
有关木糖基转移酶的背景信息,请参见 XYLT1(608124)。
▼ 克隆与表达
Gotting 等人使用基于 XT1 胰蛋白酶肽序列的简并引物(2000) 通过胎盘 cDNA 文库的 PCR 和 RACE 克隆了 XT2。推导的 865 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 97 kD。XT2 具有潜在的 II 型跨膜区、富含脯氨酸的序列和 3 个潜在的 N-糖基化位点。XT2 与 XT1 具有约 55% 的氨基酸同一性,包括具有超过 80% 同一性的序列。将 XT1 和 XT2 蛋白与来自大鼠肝脏的 Xt1 和 Xt2 进行比对,揭示了蛋白中央和 C 末端区域的高度保守序列。RT-PCR 检测到所有检查组织中 XT2 的表达,其中肾脏和胰腺的丰度最高。
▼ 基因结构
戈廷等人(2000) 确定 XYLT2 基因包含 11 个外显子,跨度为 15 kb。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Gotting 等人(2000) 将 XYLT2 基因定位到染色体 17q21.3-q22。
▼ 分子遗传学
弹性假黄瘤
Schon 等人基于弹力假黄瘤(PXE; 264800) 中蛋白多糖代谢的改变,表明该途径中的酶在疾病严重程度中充当遗传辅助因子(2006) 提出 XYLT 基因 XYLT1(608124) 和 XYLT2 作为该辅助因子作用的候选基因。他们利用变性高效液相色谱对65名德国PXE患者的这2个基因的所有外显子进行了筛查,并分析了变异对临床特征的影响。他们鉴定出了 XYLT 基因的 22 个变异。XYLT1(608124.0001) 中从 ala115 到 ser 的错义突变与较高的血清 XT 活性相关(p = 0.005)。XYLT2 基因(608125. 0001) 在诊断时 30 岁以下的患者中发生频率明显更高;所有具有这种变异的 PXE 患者都会出现皮肤损伤,而野生型患者的这一比例仅为 75%。XYLT2 基因的其他变异被发现在器官受累程度较高的患者中更为常见。
脊椎病综合征
Munns 等人对来自 2 个不相关家庭的 3 名患有骨脆性、听力障碍、心房间隔缺损和学习困难(脊椎眼综合征;605822)的患者进行了研究(2015) 分别鉴定了 1 bp 重复(608125.0002) 和 1 bp 缺失(608125.0003) 的纯合性。这些突变在每个家族中随疾病而分离,但在公共变异数据库中并未发现。
▼ 等位基因变异体(3 个选定示例):
.0001 PSEUDOXANTHOMA ELASTICUM,XYLT2 严重程度修饰剂
,THR801ARG
舍恩等人(2006) 发现 XYLT2 中的氨基酸替换 thr801 为 arg(T801R) 在诊断时 30 岁以下的弹力假黄瘤(PXE; 264800) 患者中发生频率显着更高(43% vs 26%; p = 0.04);与只有 75% 的野生型患者相比,所有具有这种变异的 PXE 患者都会出现皮肤损伤(p = 0.002)。这种变异在器官受累的患者中也更常见(p = 0.02)。氨基酸取代源自 XYLT2 外显子 11 中的 2402C-G 颠换。
.0002 颈椎病综合征
XYLT2,1-BP DUP,692C
Munns 等人在 2 名患有脊椎眼综合征(SOS; 605822) 的欧洲澳大利亚血统兄弟中(2015) 在 XYLT2 基因的外显子 3 中发现了 1 bp 重复(c.692dupC, NM_022167.3),导致移码,预计会导致提前终止密码子(Val232GlyfsTer54) 并消除催化结构域。在内部外显子组数据库或 1000 基因组计划、dbSNP(版本 132)、外显子组变异服务器或 ExAC 数据库中未发现未受影响父母中杂合性存在的重复。患者血清和血浆的循环 XylT 活性显着降低,对患者成纤维细胞的研究证实,与对照成纤维细胞相比,蛋白聚糖组装存在显着缺陷。此外,
.0003 脊柱关节综合症
XYLT2,1-BP DEL,NT520
Munns 等人对一名患有脊椎眼综合征(SOS; 605822) 的 19 岁男性进行了研究(2015) 鉴定了 XYLT2 基因外显子 2 中 1 bp 缺失(c.520del, NM_022167.3) 的纯合性,导致移码,预计会导致提前终止密码子(Ala174ProfsTer35) 和催化结构域的消除。在他未受影响的表亲父母中,该缺失以杂合性存在。