转录激活阻遏物; TASOR
- 序列相似性家族208,成员A; FAM208A
- RB1 相关蛋白,140-KD; RAP140
- 转基因激活抑制蛋白; TASOR
- 3 号染色体开放解读码组 63; C3ORF63
- KIAA1105
HGNC 批准的基因符号:TASOR
细胞遗传学定位:3p14.3 基因组坐标(GRCh38):3:56,620,132-56,683,265(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Kikuno 等人通过对从按大小分级的成人脑 cDNA 文库获得的克隆进行测序,(1999) 获得了部分 FAM208A 克隆,他们将其命名为 KIAA1105。 RT-PCR ELISA 在所有成人和胎儿组织中检测到中度 KIAA1105 表达,但脾脏除外,脾脏显示低表达。 在所有接受检查的成人大脑区域中也检测到中等程度的 KIAA1105 表达。
Li 等人使用 RB1(614041) 的 C 末端片段作为胎儿脑 cDNA 文库的酵母 2 杂交筛选中的诱饵,然后进行巢式 PCR(2000) 克隆了全长 FAM208A,他们将其称为 RAP140。 推导的 1,233 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 140 kD。 RAP140 具有形成不连续卷曲螺旋的 α 螺旋,以及 C 端肌节蛋白样结构域。 亮氨酸和丝氨酸分别占蛋白质的近30%和20%。 RAP140 还具有多个糖基化和磷酸化位点,预计是一种核蛋白。 Northern 印迹分析在所有 8 个检查的组织中检测到 9.5 和 7.5 kb 的 RAP140 转录物的中度表达。
▼ 基因功能
查索夫尼卡洛娃等人(2015) 在近单倍体 KBM7 细胞中使用非致死性正向遗传筛选来寻找人类细胞中表观遗传抑制所需的基因。 作者鉴定了 HUSH(人类沉默中枢)复合物,包含 3 种蛋白质:TASOR、MPP8(611626) 和 periphilin(608150)。 该复合体在果蝇中不存在,但在鱼类和人类中是保守的。 HUSH 成分的缺失导致内源基因组位点和整合到异染色质的逆转录病毒中 lys9(H3K9me3) 上的组蛋白 3 三甲基化减少。 查索夫尼卡洛娃等人(2015) 得出的结论是,他们的结果表明 HUSH 复合物被招募到富含 H3K9me3 的基因组位点,其中需要随后招募甲基转移酶 SETDB1(604396),以进一步沉积 H3K9me3 以维持转录沉默。
为了对参与 L1 逆转录转座控制的基因进行全基因组调查(参见 LRE1, 151626),Liu 等人(2018) 在 2 个不同的人类细胞系中使用 CRISPR-Cas9 筛选策略,并鉴定出促进或限制 L1 逆转录转座的功能多样的基因。 这些基因通常与人类疾病相关,它们在转录或转录后水平上控制 L1 生命周期,其方式可能依赖于内源性 L1 核苷酸序列,强调了 L1 调控的复杂性。 作者进一步研究了蛋白质 MORC2(616661) 以及 HUSH 复合体亚基 MPP8 和 TASOR 对 L1 的限制。 HUSH 和 MORC2 可以选择性地结合位于转录允许的常染色质环境中的进化上年轻的全长 L1,并促进 H3K9me3 的沉积以实现转录沉默。 这些沉默事件通常发生在转录活性基因的内含子内,并以 HUSH、MORC2 和 L1 依赖性方式导致宿主基因表达下调。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Li 等人(2000) 将 FAM208A 基因定位到染色体 3p14.1-p13。
Hartz(2015) 根据 FAM208A 序列(GenBank AB029028) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 FAM208A 基因对应到染色体 3p14.3。