磷脂酰肌醇转移蛋白,膜相关,3; PITPNM3
PYK2 N 端结构域相互作用受体 1;NIR1
非典型趋化因子受体 6; ACKR6
HGNC 批准的基因符号:PITPNM3
细胞遗传学位置:17p13.2-p13.1 基因组坐标(GRCh38):17:6,451,263-6,556,555(来自 NCBI)
▼ 说明
PITPNM3 属于膜相关磷脂酰肌醇转移结构域蛋白家族,与果蝇视网膜变性 B(rdgB) 蛋白具有同源性(Ocaka 等,2005)。
▼ 克隆与表达
Lev 等人通过对脑 cDNA 文库进行酵母 2 杂交分析(1999) 克隆了 PITPNM3,他们将其称为 NIR1。推导的 974 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 108 kD。PITPNM3 与其他 PITPNM 家族成员具有相同的结构特征,包括 N 端酸性钙结合区、6 个跨膜结构域和保守的 C 端结构域,但它缺少 N 端磷脂酰肌醇(PI) 转移结构域。Northern 印迹分析仅在大脑、脾脏和卵巢中检测到 7.5-kb PITPNM3 转录物。对成年大鼠大脑的免疫组织化学分析发现,Pitpnm3 在锥体层 V 内的细胞体、视上核和视前区中部显着表达。在视网膜中,Pitpnm3在神经节细胞层、内节以及内外丛状层中表达。
▼ 基因结构
奥卡卡等人(2005) 确定 PITPNM3 基因包含 20 个外显子,跨度约为 101 kb。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Lev 等人(1999) 将 PITPNM3 基因定位到染色体 17p13.1。Ocaka 等人使用辐射杂交分析和 FISH(2005) 将 PITPNM3 基因定位到染色体 17p13。
▼ 基因功能
列夫等人(1999) 发现 PITPNM3 的酸性结构域结合钙,C 端结构域结合 PYK2(601212)。对共表达 PITPNM3 和 PYK2 的细胞的 PITPNM3 或 PYK2 免疫沉淀分析表明,两种蛋白均被酪氨酸磷酸化,表明 PITPNM3 是 PYK2 底物。
▼ 分子遗传学
在 2 个多代瑞典家庭中,染色体 17p13(CORD5; 600977) 患有视锥细胞营养不良,其中 1 个是 Balciuniene 等人之前报道的一个家庭(1995),科恩等人(2007) 对候选基因 PITPNM3 进行了测序,并鉴定了错义突变(608921.0001) 的杂合性,该突变在两个家族中与疾病分离。
关联待确认
Bakhoum 等人通过对一名白内障手术后出现自身免疫性视网膜病变(AIR) 的 85 岁男性进行全外显子组测序,发现了这种情况(2018) 鉴定了 PITPNM3 基因(c.2579T-C; I860T) 中错义突变的杂合性。作者认为,在 ExAC 数据库中以较低频率(3/105,948) 发现的 PITPNM3 变异可能使患者倾向于 AIR。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 锥杆营养不良 5
PITPNM3,GLN626HIS
在 2 个患有视锥细胞营养不良的多代瑞典家庭的受影响成员中(CORD5; 600977),其中 1 个家庭是 Balciuniene 等人先前报道的一个家庭(1995),科恩等人(2007) 鉴定了 PITPNM3 基因外显子 14 中 1878G-C 颠换的杂合性,导致保守残基处的 gln626-to-his(Q626H) 取代。在 322 条种族匹配的对照染色体或 140 名患有常染色体显性或隐性视网膜色素变性的个体中未发现该突变(参见 180100)。