交联蛋白1; ITSN1
- ITSN
- SH3 结构域蛋白 1A;SH3D1A
- SRC 同源性 3 域包含蛋白
- SH3P17
HGNC 批准的基因符号:ITSN1
细胞遗传学位置:21q22.11 基因组坐标(GRCh38):21:33,642,501-33,899,861(来自 NCBI)
▼ 说明
Intersectin-1 是一种进化上保守的多结构域蛋白,在网格蛋白相关的内吞作用中发挥作用,并作为 MAPK 信号通路的介质(Tsyba et al., 2004)。
▼ 克隆与表达
Chen 和 Antonarakis(1997) 使用外显子捕获来识别人类 21 号染色体上的基因部分。数据库的 BLAST 搜索显示,1 个捕获序列与 GenBank 条目中包含 Src 同源 3(SH3) 结构域的基因 SH3D1A(以前被 Sparks 等人称为 SH3P17)的一个区域相同(1996)。
Pucharcos 等人通过 Alu 剪接 PCR 进行(1999) 捕获了 2 个外显子,随后鉴定了 ITSN 基因的全长 cDNA。该基因有可能通过选择性剪接编码至少 2 种不同的蛋白质亚型(ITSN-L 和 ITSN-S)。Intersectin 在果蝇、青蛙和哺乳动物中存在高度相似性,表明其在高等真核生物中具有保守作用。在人类和小鼠测试的所有成人和胎儿组织中均检测到了 ITSN mRNA,其中较长的亚型存在于大脑中。对发育中的小鼠大脑进行的原位杂交研究表明,ITSN 在增殖和分化神经元中都有表达。普查科斯等人(1999) 使用公共数据库中保存的 21 号染色体序列确定了 ITSN 的基因组结构。该蛋白含有几个已知的基序,这些基序表明 ITSN 参与网格蛋白介导的内吞作用和突触小泡再循环。Intersectin 在小鼠大脑中的表达模式、其推测的功能以及其在唐氏综合症患者大脑中的过度表达表明,intersectin 可能以基因剂量依赖性方式导致唐氏综合症的某些异常。
普查科斯等人(2000) 通过蛋白质印迹分析确定,ITSN1 的短亚型和长亚型分别编码 138-kD 和 195-kD 蛋白质,正如预测的那样。免疫荧光显微镜显示 ITSN1 和 ITSN2(604464) 在整个细胞质中都有稀疏的点状表达,其中 ITSN1 具有更明显的核周模式和高尔基样结构中的浓度。
齐巴等人(2004) 指出 ITSN1 具有复杂的域结构。两种 ITSN1 同工型均具有 2 个 N 末端 Eps15(600051) 同源(EH) 结构域,随后是卷曲螺旋结构域和 5 个 Src(190090) 同源 3(SH3) 结构域。此外,长同工型的 C 端延伸包含 Dbl(311030) 同源(DH) 或 RhoGEF(参见 601855)结构域、血小板-白细胞C 激酶底物(173570) 同源(PH) 结构域和推定的钙相互作用结构域。齐巴等人(2004) 确定了另外 8 个影响小鼠和人类 ITSN1 转录本的选择性剪接事件。这些剪接事件减少了 EH 结构域间距,在第一个 SH3 结构域中引入插入,删除 DH 结构域,或产生在多个点截断开放解读码组的移码。齐巴等人。
▼ 基因功能
普查科斯等人(2000)发现ITSN2亚型或ITSN1的过度表达会导致转铁蛋白摄取的抑制和网格蛋白介导的内吞作用的阻断。
神经元树突棘的形态变化被认为是由肌节蛋白聚合的动态调节引起的。Irie 和 Yamaguchi(2002) 发现 EphB2 受体酪氨酸激酶(600997) 与 intersectin-1 物理结合,并与肌节蛋白调节蛋白 N-WASP(605056) 合作,进而激活 Rho 家族 GTPase Cdc42(116952) 和脊柱形态发生。
他等人(2007) 表明哺乳动物 Wnk1(605232) 和 Wnk4(601844) 与 Itn1 相互作用,并且这些相互作用对于刺激 Romk1(KCNJ1; 600359) 内吞作用至关重要。Wnk1 和 Wnk4 刺激 Romk1 内吞作用需要它们富含脯氨酸的基序,但不需要它们的激酶活性。假性醛固酮增多症 II(PHA2B;614491) 引起的 Wnk4 突变增强了 Wnk4 与 Itn1 和 Romk1 的相互作用,导致 Romk1 的内吞作用增加。
▼ 基因结构
齐巴等人(2004)确定ITSN1基因包含41个外显子。外显子 1 是非编码的,起始子蛋氨酸位于外显子 2 中。
▼ 测绘
通过杂交和 PCR,Chen 和 Antonarakis(1997) 将 SH3D1A 基因定位到 21q22.1-q22.2 内 DNA 标记 D21S319 和 D21S65 之间的 YAC 和粘粒。