坚果中线癌家族成员 1; NUTM1
- 睾丸中的核蛋白; NUT
此条目中代表的其他实体:
包含 NUT/BRD4 融合基因
HGNC 批准的基因符号:NUTM1
细胞遗传学定位:15q14 基因组坐标(GRCh38):15:34,343,315-34,357,735(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
通过分析 15 号染色体上涉及 t(15;19) 易位的区域,然后进行 EST 数据库分析和 RT-PCR,French 等人(2003) 克隆 NUT。 推导的 1,127 个氨基酸蛋白质的计算分子量约为 120 kD。 对几种正常人体组织的 Northern 印迹分析仅在睾丸中检测到 3.6 kb 的转录物。
▼ 基因结构
法国等人(2003)确定NUT基因含有7个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,French 等人(2003) 将 NUT 基因对应到染色体 15q13。
Stumpf(2021) 根据 NUTM1 序列(GenBank AF482429) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 NUTM1 基因对应到染色体 15q14。
▼ 细胞遗传学
t(15;19)(q13;p13.1) 易位导致年轻人中线器官出现罕见、侵袭性和致命性癌症。 通过对 2 个受影响肿瘤的易位进行序列分析,French 等人(2003) 确定易位是相同的,并导致 BRD4(608749) 的外显子 10 与 NUT 的外显子 2 框内融合。 致癌融合蛋白包含 BRD4 的 N 端序列,包括 2 个溴结构域、2 个核定位信号(NLS)、一个 ET 结构域和一个富含丝氨酸的区域,后面是几乎整个 NUT 序列,包括一个 C 端 NLS。 该融合蛋白仅缺少前 5 个 NUT 残基。 Northern 印迹分析在 t(15;19) 阳性癌细胞系中检测到 6.4 kb 融合转录物。 未检测到 NUT/BRD4 转录本。