高迁移率组框 3; HMGB3
- 高迁移率组蛋白 4;HMG4
- 非组酮染色体蛋白 HMG4
- 染色体蛋白、非组酮、HMG4
- HMG2A
HGNC 批准的基因符号:HMGB3
细胞遗传学位置:Xq28 基因组坐标(GRCh38):X:150,980,507-150,990,771(来自 NCBI)
▼ 说明
HMGB3 属于高迁移率族(HMG) 蛋白超家族。与 HMG1(163905) 和 HMG2(163906) 一样,HMGB3 包含 DNA 结合 HMG 框结构域,属于 HMG 框亚家族。HMG 框亚家族的成员被认为在 DNA 复制、核小体组装和转录中发挥着重要作用(Wilke 等,1997;Nemeth 等,2006)。
▼ 克隆与表达
Wilke 等人使用直接 cDNA 选择来鉴定位于人类染色体 Xq28 中的基因(1997) 克隆了编码鸡 Hmg2a 的人类同源物的 cDNA。预测的 199 个氨基酸的人类蛋白质分别与鸡 Hmg2a、人 HMG1 和人 HMG2 具有 97%、88% 和 86% 的同一性。与 HMG1 和 HMG2 一样,人 HMG2A 包含 2 个 HMG 框重复序列和一个酸性 C 末端结构域。Northern 印迹分析显示,HMG2A 主要在胎盘中以 1.2-和 1.7-kb mRNA 的形式表达。威尔克等人(1997) 还鉴定了对应于小鼠 HMG2a 同源物的 EST。
Vaccari 等人孤立地(1998) 分离出与 HGM2A 相对应的小鼠和人类 cDNA,他们将其称为 HMG4。他们报告称,推导出的小鼠和人类蛋白质含有 200 个氨基酸,并且相似度达到 97%。Northern blot 和 RT-PCR 分析表明,小鼠 Hmg4 转录物在胚胎中比在成人组织中丰富得多。
内梅特等人(2003)发现Hmgb3优先在小鼠造血干细胞(HSC)中表达,并且在成年小鼠骨髓细胞中表达。
▼ 测绘
威尔克等人(1997) 鉴定了染色体 Xq28 上的 HMGB3 基因。
▼ 基因功能
Nemeth 等人通过将含有 Hmgb3 的逆转录病毒引入小鼠骨髓细胞中(2003) 发现 Hmgb3 的强制表达抑制 B 细胞和骨髓分化。他们得出结论,HMGB3 蛋白水平的下调是骨髓细胞和 B 细胞分化的重要一步。
Yanai 等人使用下拉分析(2009) 发现小鼠 HMGB 蛋白与所有免疫原性核酸结合,亲和力和免疫原性之间存在相关性。Hmgb1 -/- 和 Hmgb2 -/- 小鼠细胞在 I 型干扰素和炎症细胞因子诱导方面存在缺陷,DNA 或 RNA 旨在激活胞质核酸感应受体。Hmgb1、Hmgb2 和 Hmgb3 表达被小干扰 RNA 抑制的小鼠细胞的转录因子 Irf3(603734) 和 Nfkb(参见 164011)的激活也受到损害。HMGB 的缺乏还导致 Toll 样受体 3(Tlr3; 603029)、Tlr7(300365) 和 Tlr9(605474) 的同源核酸(分别为 dsRNA、ssRNA 和低甲基化 DNA)的激活较差。柳井等人。
▼ 分子遗传学
在一个分离 X 连锁小眼球综合征的家族中(MCOPS13; 300915),Scott 等人(2014) 在 HMGB3 基因(300193.0001) 中发现了一个 2 bp 插入,该插入通过患者及其未患病母亲的 Sanger 测序得到证实。对 13 名无血缘关系的小眼症男性患者进行 HMGB3 桑格测序,结果显示没有进一步的突变。
▼ 动物模型
内梅特等人(2006) 指出,缺乏 Hmgb3 的小鼠(Hmgb3 -/Y 小鼠)具有正常数量的 HSC,能够更新和造血再生,但它们的共同淋巴祖细胞(CLP) 和共同骨髓祖细胞(CMP) 较少。内梅特等人(2006) 发现野生型和 Hmgb3 -/Y CLP 和 CMP 在体外同样增殖和分化,但 Hmgb3 -/Y HSC 表现出典型 Wnt(参见 WNT1;164820)信号通路的组成型激活,这与 Dvl1(601365)(一种正 Wnt 调节因子)表达的增加相对应。受到 5-氟尿嘧啶处理应激的 Hmgb3 -/Y 小鼠比野生型小鼠恢复功能性 HSC 的速度更快,并且比恢复 CLP 和 CMP 的速度更快。内梅特等人(2006) 提出,Hmgb3 -/Y 小鼠中 Wnt 信号传导的增加可能使 HSC 恢复更快。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 小眼症,综合症 13(1 个家族)
HMGB3,2-BP INS,477TA
在一名来自缅因州亲属的受影响男性中,孤立出 X 连锁缺损性小眼畸形、小头畸形、身材矮小和智力障碍(MCOPS13; 300915),最初由 Goldberg 和 McKusick(1971) 报道,Scott 等人(2014) 在 HMGB3 基因的外显子 4 中发现了一个 2 bp 插入(c.477_478insTA),导致移码,预计会导致提前终止密码子(Lys161IlefsTer54)。该家庭中另外 3 名受影响的男性成员无法进行分子分析。该突变也存在于患者未受影响的母亲身上。