染色体 10q22.3-q23.2 缺失综合征
- 婴儿期幼年性息肉病(包括)
细胞遗传学位置:10q23 基因组坐标(GRCh38):10:80,300,001-95,300,000
它代表连续基因缺失综合征(chr10: 81.6-88.9 Mb, NCBI36)。
▼ 说明
10q22.3-q23.2 区域的特征是一组复杂的低拷贝重复序列(LCR),这些重复序列可引起由非等位基因同源重组(NAHR) 介导的各种基因组变化。染色体 10q22.3-q23.2(包括 BMPR1A 基因(601299))的反复缺失与相貌畸形、发育迟缓和多种先天性异常有关。一些向远端延伸包括 PTEN 基因(601728) 的缺失的患者具有更严重的表型,包括婴儿/青少年息肉病、巨头畸形、畸形面部特征和发育迟缓(van Bon 等人的总结,2011)。
▼ 临床特征
阿利曼等人(2010) 报道了 4 名无关的患者,其染色体 10q22.3-q23.2 反复发生间质性缺失,包括 BMPR1A 基因,但不包括 PTEN 基因。所有人都有轻度畸形特征,其中 3 人有发育迟缓。其中三只的喂养也很差,无法茁壮成长。没有人患有息肉病。范邦等人(2011) 指出这些患者的缺失发生在 LCR3 和 LCR4 之间。
范邦等人(2011) 报道了另外 5 名不相关的患者,其 LCR3 和 LCR4 之间存在 10q22.3-q23.2 杂合性间质性反复缺失。三个是新发的,一个是从一位可能未受影响的母亲那里继承的,第五个未知。所有人都缺失了 BMPR1A 基因,但没有一个缺失了 PTEN 基因。所有患者均存在不同程度的发育迟缓,其中 4 名患者存在言语迟缓,并且均具有不同的畸形特征,包括耳位低、距离过远、宽鼻子和鼻梁扁平。其他特征变化较大,包括心房和心室间隔缺损(1 名患者)、宽拇指、拇趾和乳房发育不全(1 名患者)、高腭弓、癫痫发作和 Chiari I 畸形(1 名患者),以及脊柱侧弯、后凸、牛奶咖啡斑和心脏瓣膜反流(1 名患者)。没有人患有息肉病。范邦等人(2011) 假设乳腺发育不全患者涉及 NRG3 基因(605533),心脏缺陷患者涉及 BMPR1A 基因。这些患者是在 30,991 名患有智力低下和/或多种先天性异常的个体中检测到的,频率为 0.016%。
与幼年性息肉病相关的染色体 10q22-q24 缺失
雅各比等人(1997) 报道了一名 3 岁时患有幼年性息肉病和多种先天性异常的患者,其染色体 10q22.3-q24.1 发生了从头间质性缺失。其他临床特征包括身材矮小、手脚短、鼻尖宽、人中长、眼角间距宽、耳朵发育不全、头小和颈部皮肤多余。还有一个小脐疝,斜肌发育不良,双侧腹部横向膨出,胸部和腹部有明显的静脉图案。运动和语言技能发育迟缓。
阿奇等人(1997) 在一名 18 个月大的幼年性息肉病患者中发现了 10q23.2-q24.1 的间质缺失,包括 PTEN 基因。他还患有巨头畸形、面部特征畸形和精神运动迟缓。
德尔纳特等人(2006) 描述了 4 名无亲属关系的婴儿幼年息肉病儿童。这些儿童是包含 PTEN 和 BMPR1A 基因的从头种系缺失的杂合子。一些儿童的消化外特征表明患有班纳扬-莱利-鲁瓦尔卡巴综合征。作者认为,婴儿期幼年性息肉病的临床表现提示 BRRS 或 JPS 的诊断并不令人意外,因为对同时患有 Cowden 综合征和 BRRS 的家族的描述表明,修饰因素会影响 PTEN 基因缺陷的表达。德尔纳特等人(2006)假设婴儿期幼年性息肉病是由这 2 个基因缺失引起的连续基因缺失综合征,并且疾病的严重程度反映了这 2 个抑癌基因之间的合作。
萨尔维亚蒂等人(2006) 报道了一名 10 号染色体间质性缺失的患者,与 Delnatte 等报道的患者相比,其表型明显更温和(2006)。她有轻度畸形特征和发育迟缓。她第一次轻度直肠出血发生在 5 岁时。6 岁时进行的结肠镜检查发现整个结肠长有多个(超过 15 个)息肉。切除病变的组织学与幼年息肉相符。高分辨率核型检测发现染色体 10q23 存在间质性缺失。Salviati 等人的病人(2006) 不具有婴儿幼年息肉病的任何特征,即2岁前发病、严重出血、腹泻、蛋白质丢失性肠病、缺乏营养和直肠脱垂。此外,仅在结肠中发现息肉。她也没有表现出考登综合征或 BRR 综合征的典型临床症状。在对 Salviati 等人的回复中(2006),桑拉维尔等人(2006) 认为 Salviati 等人的患者的研究结果(2006) 与 Delnatte 等人提供的解释一致(2006),假设某种机制增加了剩余染色体上一些关键基因的表达水平,纠正了 10q22.3-q23 区域的单倍体不足并导致表型减弱。
门科等人(2008) 报道了另外 4 名不相关的患者,其 10q23 微缺失包含 BMPR1A 和 PTEN 基因。临床表型有所不同,但通常包括精神运动迟缓、大头畸形、面部畸形和儿童早期发病的症状性幼年息肉病。其中两名患者有上消化道受累的记录。其他可变特征包括先天性心脏缺陷、肌张力低下和腭裂。只有1名患者在2岁之前出现息肉病,当时症状严重需要结肠切除术,另一名患者病程不寻常,25岁时死于转移性直肠癌。FISH 和多重连接依赖性探针扩增(MLPA) 显示缺失大小范围为 2.88 至 4.26 Mb。这 4 名患者和之前报道的患者中删除的共同区域为 1.47 Mb,包括至少 10 个已知基因。缺失大小与发病年龄或疾病严重程度之间没有明确的相关性。门科等人(2008) 的结论是,与 10q23 缺失相关的表型不仅限于严重的婴儿幼年性息肉病,还包括儿童期发病的巨头畸形、发育迟缓、轻度胃肠道症状以及可能的早发性结直肠癌。
巴博维奇等人(2010) 报道了一名患有婴儿息肉病、大头畸形、精神运动发育迟缓和肌张力低下的女孩,这些症状与染色体 10q23.2-q23.31 的 2.5 Mb 缺失有关。14 岁时,她患上了双侧卵巢粘液性囊腺瘤,这是一种此前未曾被描述与染色体 10q23 缺失有关的肿瘤性疾病。作者还指出,患者的扁桃体上有明显的息肉,这可以作为诊断线索。
范邦等人(2011) 报道了一名患者(患者 6)的染色体 10q22.3-q23.3 发生了 4.7-Mb 的间质缺失,包括 BMPR1A 和 PTEN 基因并涉及 LCR4。该患者患有幼年性息肉病、大头畸形和多动症。她在 LCR3 处也有 2 个较短的拷贝数丢失区域。
染色体 10q22-q23 缺失
范邦等人(2011) 报道了 2 名不相关的患者,其染色体 10q22.3-q23.3 区域存在小间质性缺失。一名患者(患者 7)的 GRID1 基因(610659) 存在 0.2 Mb 的基因内缺失。他患有多种先天性异常,包括膈膨出、睾丸未降、心脏缺陷和畸形特征,但发育正常。另一名患者(患者 8)在 LCR 区域之外有 30 kb 的缺失。他患有发育迟缓、自闭症、失语和癫痫发作。他继承了父亲的删除;尽管一些家庭成员患有精神疾病,但在该患者及其父亲中发现的基因内缺失并没有在家庭的其他成员中分离。
▼ 细胞遗传学
染色体 10q22.3-q23.1 反复缺失
巴尔丘尼内等人(2007) 描述了 Arch 等人报告的患者(1997) 和另外 2 名患者因染色体 10q22-q23 缺失而出现认知和行为异常。他们建议将 10q22.3-q23.32 区域添加到受重复重排影响的基因组区域列表中。他们将每个家族中的断点与位于缺失附近的复杂低拷贝重复序列(LCR)的组织联系起来。其中 2 个家族的断点位于 LCR3 和 LCR4 内,而 Arch 等人的家族中的缺失(1997) 去除了端粒 LCR4,并具有复杂的非连续结构。巴尔丘尼内等人(2007) 提出该区域的 LCR 增加了对染色体重排的敏感性。
染色体 10q22.3-q23.2 重复
范邦等人(2011) 还报告了 3 名患者,包括 2 名同胞,染色体 10q22.3-q23.2 重复,涉及 LCR3 和 LCR4。所有人都具有发育迟缓和可变的畸形特征。这对兄弟姐妹从一位未受影响的母亲那里继承了重复基因。另外三名患者在该区域有非复发性重复,不涉及 LCR3 和 LCR4;1 名患有发育迟缓并伴有畸形特征,1 名仅具有畸形特征,第三名具有多种先天性异常。