La 核糖核蛋白 6,翻译调节因子; LARP6

  • La 核糖核蛋白结构域家族,成员 6
  • ACHERON; ACHN

HGNC 批准的基因符号:LARP6

细胞遗传学定位:15q23 基因组坐标(GRCh38):15:70,829,130-70,854,157(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

通过使用差异筛选方案,Valavanis 等人(2007) 发现了 LARP6 基因,该基因与烟草天蛾(Manduca sexta) 结束从蛹到成虫的变态过程时节间肌肉的程序性细胞死亡有关。 他们将基因命名为 Acheron(Achn),以希腊神话中通往死者王国的河流命名。 通过筛选与 Manduca Achn 具有高度序列同一性的序列的人海马 cDNA 文库,然后进行 RT-PCR,他们组装了全长人 ACHN cDNA。 ACHN 编码推导的 491 个氨基酸蛋白,具有 3 个 N 端狼疮抗原(La) 重复序列、一个酰胺化位点、核定位和输出信号、一个推定的 RNA 识别基序、推定的磷酸化和糖基化位点以及 3 个 SP 重复序列。 人类蛋白质与曼杜卡和小鼠蛋白质的相似度分别为 46% 和 94%。 小鼠组织的 RT-PCR 分析显示 Achn 在脑中表达最高,在心脏、骨骼肌和睾丸中强表达,在胸腺、脾和肾中表达较低。 凝胶迁移率研究表明 Achn 蛋白经过翻译后修饰。

▼ 基因功能

瓦拉瓦尼斯等人(2007) 引用了未发表的研究,证明 Achn 是控制多个谱系(尤其是肌肉)分化的关键调节蛋白。 体外 C2C12 成肌细胞或斑马鱼胚胎中 Achn 的丢失导致无法形成多核肌管。 瓦拉瓦尼斯等人(2007) 得出结论,Achn 是一种调节蛋白,可能介导多种发育和稳态过程。

通过酵母的功能表征,Hussain 等人(2013) 证明全长人类 LARP4(618657)、LARP6 和 LARP7(612026) 不是 tRNA 介导的抑制因子,尽管它们的 La 模块(即 La 基序(LAM) 和相邻的 RNA 识别基序(RRM))单独具有孤立于稳定的前 tRNA 3 引物末端保护的抑制活性。 相反,LARP4、LARP6 和 LARP7 是 RNA 伴侣,其活性孤立于 UUU-3-prime-OH 结合,并且集中在 RRM 周围以及紧邻 RRM 下游的序列。 La 模块的 tRNA 介导的抑制活性与伴侣活性相关,因为 LAM 充当辅助结构,帮助将 RNA 募集到相邻的 RRM。

▼ 基因结构

瓦拉瓦尼斯等人(2007) 确定 ACHN 基因至少包含 2 个外显子,跨度约为 22.6 kb。

▼ 测绘

通过序列分析,Valavanis 等人(2007) 将 ACHN 基因对应到染色体 15q23。