锚蛋白重复结构域蛋白 17; ANKRD17

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HGNC 批准的基因符号:ANKRD17

细胞遗传学位置:4q13.3 基因组坐标(GRCh38):4:73,073,376-73,258,798(来自 NCBI)

▼ 说明

ANKRD17 是细胞周期蛋白 E(CCNE1; 123837)/CDK2(116953) 的下游效应子,可正向调节细胞周期进程(Deng et al., 2009)。ANKRD17 还与介导细菌和病毒免疫反应的分子相互作用(Wang 等人,2012;Menning 和 Kufer,2013)。

▼ 克隆与表达

Deng 等人使用 TAP 标签纯化(2009) 确定 ANKRD17 是 CCNE1/CDK2 的底物。预测的 2,352 个氨基酸的 ANKRD17 蛋白在其 N 端一半包含 15 和 10 个锚蛋白重复序列​​,随后是核输出信号、核定位信号、KH 结构域和 RxL 基序。RT-PCR 分析检测到人体组织中普遍存在的表达。免疫印迹分析显示人类细胞中的核表达和染色质结合。质谱分析鉴定出丝氨酸磷酸化位点位于位置 1791、1794 和 2150。

▼ 基因功能

Deng 等人使用体外激酶测定(2009)表明ANKRD17的磷酸化是由CCNE1/CDK2介导的。ANKRD17 的过度表达促进了人类 U2OS 细胞的细胞周期进程。使用短干扰 RNA(siRNA) 处理可阻止 U2OS 细胞进入 S 期,并阻止 CDC6(602627) 和 PCNA(176740) 加载到染色质上。对转染的 293T 细胞进行免疫沉淀分析表明,ANKRD17 还与参与 DNA 复制的蛋白质相互作用,包括 MCM3(602693)、MCM5(602696)、MCM7(600592)、CDC6 和 PCNA。邓等人(2009) 得出结论,ANKRD17 是 CCNE1/CDK2 的重要下游效应子,可正向调节 G1/S 转变。

RIGI(DDX58;609631)样受体(RLR)是感知病毒 RNA 并触发免疫反应的细胞内分子。王等人(2012) 发现 ANKRD17 与 RLR RIGI、MDA5(606951) 和 VISA(MAVS; 609676) 相互作用。在转染的 293T 细胞中,ANKRD17 的过表达增强了这些分子的信号传导以及 IRF3(603734) 和 NFKB(164011) 的激活以及 IFNB(147640) 的转录。ANKRD17 的敲低会损害 RLR 信号传导。王等人(2012) 得出结论,ANKRD17 是 RLR 信号通路的正调节因子。

Menning 和 Kufer(2013) 表明 ANKRD17 N 末端结构域在人类细胞中结合 NOD2(605956)。敲低和过表达分析表明,ANKRD17 在功能上参与了不同人类细胞系中 NOD2 和 NOD1(605980) 介导的细菌反应。Menning 和 Kufer(2013) 得出结论,ANKRD17 在先天抗菌免疫途径中发挥作用。

▼ 测绘

邓等人(2009) 指出 ANKRD17 基因对应到染色体 4q13.3。

▼ 细胞遗传学

Chopra 等人在一名患有 Chopra-Amiel-Gordon 综合征(CAGS; 619504) 的患者(个体 6)中(2021) 通过阵列 CGH 鉴定了包含 ANKRD17 在内的 7 个基因的从头杂合 1.16-Mb 缺失。该区域的其他 6 个基因在突变时与疾病遗传的常染色体隐性模式相关(ADAMTS3, 605011;ALB, 103600;AFP, 104150),或者未知与疾病相关(COX18, 610428;AFM, 104150;RASSF6, 612620)。乔普拉等人(2021) 因此认为 ANKRD17 是患者表型最有可能的候选基因。

▼ 分子遗传学

Chopra 等人对来自 32 个 Chopra-Amiel-Gordon 综合征家庭的 34 名患者进行了研究(2021) 鉴定了 ANKRD17 基因中的杂合突变(参见例如 615929.0001-615929.0005)。这些突变包括 21 个截短或规范剪接位点突变、9 个错义突变、1 个框内插入缺失和 1 个包括其他基因的杂合微缺失。29 名患者的突变被证明是从头发生的,1 名患者(615929.0004) 遗传自受影响的父母,1 名患者遗传自具有低水平嵌合性 ANKRD17 突变的父母。3 名患者的父母遗传未确定。一对同卵双胞胎因错义突变(A377T)而杂合,具有不一致的表型。分子模型表明,大多数错义突变破坏了锚蛋白重复序列​​的稳定性。

▼ 等位基因变异体(5 个精选示例):

.0001 乔普拉-艾米尔-戈登综合征
ANKRD17,IVS11AS,AC,-2

在一名患有 Chopra-Amiel-Gordon 综合征(CAGS; 619504) 的阿尔及利亚妇女(个体 1)中,Chopra 等人(2021) 在 ANKRD17 基因的内含子 11 中发现了一个从头杂合的 c.1958-2A-C 转变(c.1958-2A-C,NM_032217.4),预计会导致剪接异常。该突变通过三重全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。gnomAD 数据库中不存在该突变。未进行功能研究。

.0002 乔普拉-艾米尔-戈登综合征
ANKRD17,GLY1364ALA

在一名患有 Chopra-Amiel-Gordon 综合征(CAGS; 619504) 的 4 岁印度男孩(个体 2)中,Chopra 等人(2021) 在 ANKRD17 基因的外显子 22 中鉴定出从头杂合的 c.4091G-C 颠换(c.4091G-C,NM_032217.4),导致锚蛋白重复中的保守残基处发生 gly1364 至 ala(G1364A) 取代。该突变通过三重全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。gnomAD 数据库中不存在该突变。未进行功能研究。

.0003 乔普拉-艾米尔-戈登综合征
ANKRD17,4-BP DEL,NT4341

Chopra 等人在一名患有 Chopra-Amiel-Gordon 综合征(CAGS; 619504) 的 5 岁女孩(个体 3)中(2021) 在 ANKRD17 基因的外显子 24 中发现了一个从头杂合的 4 bp 缺失(c.4341_4344del, NM_032217.4),预计会导致移码和提前终止(Gln1448LeufsTer12)。该突变是通过三重全外显子组测序鉴定出来的,并且在 gnomAD 数据库中不存在。未进行功能研究。

.0004 乔普拉-艾米尔-戈登综合征
ANKRD17,GLU875TER

Chopra 等人在患有 Chopra-Amiel-Gordon 综合征(CAGS; 619504) 的母子(个体 11 和 12)中(2021) 鉴定了 ANKRD17 外显子 15 中 c.2623G-T 颠换(2623G-T, NM_032217.4) 的杂合性,导致 glu875 到 ter(E875X) 取代。该突变经全外显子组测序鉴定并经桑格测序证实,但在 gnomAD 数据库中不存在。未进行功能研究。

.0005 乔普拉-艾米尔-戈登综合征
ANKRD17,1-BP DUP,NT5756

Chopra 等人在一名患有 Chopra-Amiel-Gordon 综合征(CAGS; 619504) 的患者(个体 14)中(2021) 在 ANKRD17 基因的外显子 29 中发现了一个从头杂合的 1-bp 重复(c.5756dup, NM_032217.4),预计会导致移码和提前终止(Ala1920SerfsTer)。该突变通过三重全外显子组测序进行鉴定,并通过桑格测序进行确认。gnomAD 数据库中不存在该突变。未进行功能研究。