分泌载体膜蛋白3; SCAMP3

  • PROPIN1

HGNC 批准的基因符号:SCAMP3

细胞遗传学位置:1q22 基因组坐标(GRCh38):1:155,255,981-155,262,360(来自 NCBI)

▼ 克隆与表达

辛格尔顿等人(1997) 通过与显示与 SCAMP1(606911) 同源的 EST 杂交,从 HeLa 细胞 cDNA 文库中获得了部分 SCAMP3 cDNA 克隆。 他们使用限制性消化和 PCR 扩增来克隆全长 cDNA。 SCAMP3 编码推导的 347 个氨基酸的蛋白质,计算分子量为 38.3 kD。 该蛋白与 SCAMP1 和 SCAMP2(606912) 具有相同的结构特征,包括亮氨酸拉链样片段、富含脯氨酸的元件、包含 4 个假定跨膜结构域的扩展中央核心、极性片段和富含丙氨酸的 C 末端。 SCAMP3 与 SCAMP1 和 SCAMP2 分别具有 57% 和 56% 的整体序列同一性,与小鼠同源物具有 89% 的同一性。 最分歧的区域位于 N 末端。 Northern印迹分析检测到1.4-kb SCAMP3转录物,在心脏和骨骼肌中表达最高,在胎盘和胰腺中表达中等,在脑、肺、肝脏和肾脏中表达较低。 HeLa 细胞中的免疫荧光定位显示,点状染色在细胞外周富集,并与 SCAMP1 和 SCAMP2 存在一定程度的共定位。 温菲尔德等人(1997) 在所有检查的组织和 8 个大脑区域中发现 1.5 至 1.6 kb 转录物的表达相当。

▼ 基因结构

温菲尔德等人(1997) 确定 SCAMP3 基因(他们称之为 PROPIN1)包含 9 个外显子,跨越 6.4 kb 的基因组 DNA。

▼ 测绘

温菲尔德等人(1997) 通过对对应到 1q21 的 YAC 克隆进行序列分析,将 SCAMP3 基因对应到染色体 1q21。