β-珠蛋白基因座转录 3,非编码; BGLT3
- 长非编码 RNA BGL3
- 长链非编码RNA BGL3
- LINC01083
HGNC 批准的基因符号:BGLT3
细胞遗传学位置:11p15.4 基因组坐标(GRCh38):11:5,244,554-5,245,546(来自 NCBI)
▼ 说明
长非编码 RNA(lncRNA) BGLT3 是慢性粒细胞白血病(CML; 608232) 中 BCR(151410)-ABL(189980) 介导的细胞转化的调节因子(Guo et al., 2015)。
▼ 克隆与表达
使用 cDNA 微阵列分析,Guo 等人(2015) 鉴定出 BGLT3 是人类 K562 CML 细胞中存在的一种 lncRNA,其表达在 BCR-ABL 沉默后上调。 通过 RT-PCR,他们克隆了 BGLT3,它没有蛋白质编码潜力。 Northern 印迹分析在 K562 细胞中检测到 3.67 kb 的转录物。
▼ 基因功能
使用 Northern blot 分析,Guo 等人(2015) 证实通过沉默 BCR-ABL,K562 细胞中 BGLT3 表达上调。 伊马替尼治疗也上调 BGLT3 表达。 与对照组相比,表达 BGLT3 的 K562 白血病细胞的活力和存活率降低。 伊马替尼以依赖于 BGLT3 存在的方式诱导 K562 细胞凋亡。 与对照细胞相比,注射表达BGLT3的K562细胞的小鼠显示出较慢的肿瘤生长,并且经受BCR-ABL沉默的K562细胞没有肿瘤生长。 BGLT3 的表达还抑制转基因小鼠的原发性骨髓转化。 计算和实验分析确定 BGLT3 是 MIR17(609416)、MIR20A(609420)、MIR20B(300950)、MIR93(612984)、MIR106A(300792) 和 MIR106B(612983) 的靶标,这些 microRNA 抑制 PTEN(601728) mRNA,并用其BGLT3 共享 mRNA 反应元件序列。 PTEN 的过表达或敲低分别与 BGLT3 表达的增加或减少相关,表明这些分子相互交叉调节。 BCR-ABL 转化的白血病细胞的细胞因子孤立生长需要 MYC(190080) 的沉默,作者发现 MYC 增加了 K562 细胞中的 BGLT3 水平。 郭等人(2015) 得出结论,BCR-ABL 通过 MYC 依赖性 DNA 甲基化抑制 BGLT3 表达,并且 BCR-ABL 介导的细胞转化需要 BGLT3 肿瘤抑制因子的沉默。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Guo 等人(2015) 将 BGLT3 基因定位到染色体 11p15.4,位于 HBG1 基因(142200) 和 HBBP1 假基因之间。