转录因子 25; TCF25
- 核定位蛋白1; NULP1
- KIAA1049
HGNC 批准的基因符号:TCF25
细胞遗传学位置:16q24.3 基因组坐标(GRCh38):16:89,873,592-89,911,379(来自 NCBI)
▼ 说明
TCF25 是转录因子基本螺旋-环-螺旋(bHLH) 家族的成员,对胚胎发育非常重要(Steen 和 Lindholm,2008)。
▼ 克隆与表达
Kikuno 等人通过对从尺寸分级的成人大脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,(1999)克隆了TCF25,他们将其命名为KIAA1049。 推导的蛋白质含有550个氨基酸。 RT-PCR ELISA 检测到所有组织和所检查的特定脑区域中普遍存在表达。
Olsson 等人通过对不同发育阶段的小鼠肾脏进行 RNA 指纹分析,然后进行 RACE(2002) 克隆了小鼠 Tcf25,他们将其称为 Nulp1。 推导的 625 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 70.9 kD。 Northern印迹分析检测到小鼠胚胎阶段的表达在相应的成年小鼠组织中下降,但成年大脑中的持续水平除外。
蔡等人(2006) 使用保守的 bHLH 序列作为探针,然后进行 5-和 3-prime RACE,通过 EST 数据库筛选克隆了人类 TCF25。 推导的 676 个氨基酸的人蛋白的计算分子量为 76.7 kD,包含 N 端 bHLH 结构域和带有极性和疏水残基的 C 端 DUF654 区域。 TCF25 与其小鼠直系同源物具有 89% 的同一性。 Northern 印迹分析在所有检查的人类胚胎组织中检测到 2.3 kb 的转录物。 免疫荧光研究将 TCF25 定位于细胞核。
Steen 和 Lindholm(2008) 使用 RT-PCR 和免疫印迹分析,分别在人类、小鼠和大鼠肿瘤系中检测到了 TCF25 mRNA 和蛋白质。
▼ 基因功能
Cai 等人使用 GAL4-荧光素酶测定和其他研究(2006) 表明 TCF25 抑制转录,并且转录抑制活性由 DUF654 区域介导,该区域通过增加血清反应因子启动子区域的组蛋白脱乙酰化来发挥作用(SRF; 600589)。
Steen 和 Lindholm(2008) 表明,TCF25 过表达会导致人骨肉瘤 Saos2 细胞死亡增加,DNA 碎片增加。 根据 MTT 测定,过度表达使 N2A 神经母细胞瘤细胞的细胞活力降低 20%。 GST 下拉和免疫共沉淀测定表明,在经历细胞死亡的细胞中,TCF25 优先与 XIAP(300079) 结合。
▼ 基因结构
蔡等人(2006) 确定 TCF25 基因包含 18 个外显子,跨度 37.775 kb。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Kikuno 等人。 Cai等人(1999)将TCF25基因定位到16号染色体。通过基因组序列分析,Cai等人(2006) 将 TCF25 基因定位到染色体 16q24.3。