簇蛋白样蛋白 1; CLUL1
HGNC 批准的基因符号:CLUL1
细胞遗传学位置:18p11.32 基因组坐标(GRCh38):18:596,988-650,182(来自 NCBI)
▼ 说明
CLUL1 编码类似于簇蛋白的视网膜蛋白(CLU; 185430)(Zhang et al., 2000)。
▼ 克隆与表达
张等人(2000) 克隆了犬科动物 Clul1,它编码 338 个氨基酸的蛋白质。 人CLUL1蛋白与犬蛋白有70%的氨基酸同一性,其N端比人CLUL1短128个氨基酸。 Canine Clul1 与来自各种哺乳动物的凝聚素具有 22% 至 28% 的氨基酸同一性。 Clul1 包含一个信号肽,预计可将成熟蛋白靶向内质网(ER),以及多个 N-糖基化位点、磷酸化位点和 N-肉豆蔻酰化位点。 Northern blot分析显示,Clul1在犬视网膜中表达最高,但RT-PCR在脑和肝脏中检测到低水平。 与未受影响的狗相比,患有进行性视锥杆变性的狗的 Clul1 mRNA 显着降低。
张等人(2003) 从视网膜 cDNA 文库中克隆了全长人类 CLUL1,并鉴定了犬科动物 Clul1 剪接变体,其编码的蛋白质的长度和结构与人类 CLUL1 相似。 推导的人和犬蛋白分别含有 466 和 465 个氨基酸,并且均具有 N 端信号肽、二分核定位信号和 C 端 ER 保留信号。 人类和犬类蛋白质具有大约 73% 的氨基酸同一性。 犬类 Clul1 基因的表达受到发育调节,其表达水平与视网膜分化平行。 蛋白质印迹分析显示仅在犬和小鼠视网膜中存在 55 kD 蛋白质。 原位杂交揭示了感光细胞内段的 Clul1 转录本。 在光适应视网膜中,Clul1 也被发现存在于视锥细胞的外节中。 在暗适应视网膜中,在锥蒂和二级神经元之间的接触区域发现了表达。
▼ 基因结构
张等人(2003) 确定 CLUL1 基因包含 9 个外显子,跨度约为 35 kb。
▼ 测绘
通过辐射混合分析,Zhang 等人(2000) 将 CLUL1 基因定位到染色体 18p。
通过数据库分析,Zhang 等人(2003) 将 CLUL1 基因定位到染色体 18p11.3。