CASK-相互作用蛋白 1; CASKIN1
- KIAA1306
HGNC 批准的基因符号:CASKIN1
细胞遗传学定位:16p13.3 基因组坐标(GRCh38):16:2,177,180-2,196,605(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从尺寸分级的人胎脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,(2000)克隆了KIAA1306。 推导的蛋白质与 KIAA1139(CASKIN2; 612185) 具有 34% 的序列同一性。 RT-PCR ELISA 在所有测试组织中检测到 KIAA1306 高或中度表达,其中在胎儿和成人脑、肺和肝脏中表达最高。
Tabuchi 等人通过使用 CASK(300172) N 端 CaM 激酶结构域的 GST 融合蛋白(质膜的衔接蛋白)对大鼠脑蛋白进行亲和纯化(2002) 分离出一种新的 180-kD 蛋白质。 通过数据库分析,他们确定了 KIAA1306(CASKIN1) 是编码该蛋白的 cDNA,以及大鼠和小鼠的同源物以及高度相关的人类 CASKIN2。 Caskin 蛋白在进化上高度保守。 每个都具有多结构域结构,其中 N 末端有 6 个锚蛋白重复序列、一个 SH3 结构域和 2 个不育 α 基序(SAM) 结构域,C 末端包含一个长的富含脯氨酸的序列和一个短的保守结构域。 Caskin1 蛋白含有 1,432 个氨基酸。 大鼠组织的 Northern 印迹分析检测到 Caskin1 的大脑特异性表达。 对大鼠脑切片的免疫细胞化学实验表明,Caskin1 主要定位于神经纤维,并在突触区域富集。
▼ 基因功能
Tabuchi 等人使用免疫沉淀实验(2002) 确定 Caskin1 与 Mint1(602414) 一样,在大脑中与 CASK 稳定结合。 亲和层析实验确定 Caskin1 与 CASK 在 神经元表面蛋白-1(600565) 的固定胞质尾部共组装,表明 CASK 和 Caskin1 覆盖了 神经元表面蛋白s 和其他细胞表面蛋白的胞质尾部。 详细的作图研究表明,Caskin1 和 Mint1 与 CASK N 端 CaM 激酶结构域上的同一位点结合,并相互竞争 CASK 结合。 GST 下拉实验表明,CASK 与 Caskin1 和 Velis 形成三方复合体(参见 603380),类似于 CASK-Mint1-Veli 复合体。 与 CASK 结合的 Caskin1 序列在 Caskins 1 和 2 之间保守性较差,GST-Caskin2 融合实验表明 Caskin2 不与 CASK 结合。
▼ 测绘
Gross(2017) 根据 CASKIN1 序列(GenBank AF451977) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 CASKIN1 基因对应到染色体 16p13.3。