SRY框 14; SOX14
- SRY 相关 HMG框 基因 14
- SOX28
HGNC 批准的基因符号:SOX14
细胞遗传学位置:3q22.3 基因组坐标(GRCh38):3:137,764,315-137,766,334(来自 NCBI)
▼ 说明
SRY 相关 HMG框(SOX) 基因编码包含 79 个氨基酸 HMG(高迁移率基团)结构域的 DNA 结合蛋白家族,该结构域与 SRY 蛋白(480000) 的 DNA 结合 HMG 框具有至少 50% 的序列同一性。 根据 HMG 结构域内外的序列相似性,SOX 蛋白分为 6 个亚组。 有关 SOX 基因的更多背景信息,请参阅 SOX1(602148)。
▼ 克隆与表达
Cremazy 等人通过使用旨在扩增 HMG 框相关序列的高度简并寡核苷酸对人类基因组 DNA 进行 PCR,(1998) 鉴定了几种新的 SOX 蛋白,包括 SOX14,他们将其称为 SOX28。 部分 SOX14 序列编码具有 HMG 框样结构域的推导蛋白,与 SRY HMG 框具有 57% 的序列同一性。 与 SRY 的 HMG 框一样,SOX28 的 HMG 框状结构域包含假定的核定位信号。
Arsic 等人通过使用包含 SRY 框的探针筛选基因组文库(1998) 分离了人类 SOX14 基因,该基因包含与部分表征的小鼠 Sox14 基因相同的 HMG 框。 人类 SOX14 基因编码推导的 240 个氨基酸、富含脯氨酸的蛋白质,其中包含多个磷酸化位点和一个潜在的 N-糖基化位点。 该蛋白与 B 亚家族其他 SOX 蛋白的 HMG 框区域具有高度相似性(87% 至 92%),但与 HMG 框之外的蛋白缺乏任何相似性。 Northern 印迹分析揭示了肝源性 HepG2 细胞系中约 1.8 kb SOX14 转录物的表达。 通过 RT-PCR,在胎儿脑、脊髓和胸腺中可检测到表达,在胎儿肾上腺和成人心脏、肝脏、肠道、肾脏和睾丸中表达水平较低。
哈格雷夫等人(2000) 还报道了小鼠和雏鸡 Sox14 的人类直系同源物的克隆和测序。 他们发现,与其他脊椎动物物种的直向同源物相比,人类 SOX14 显示出显着的序列保守性,并且可能反映了这些基因在发育中的大脑和脊髓中的表达。
威尔莫尔等人(2000) 指出 SOX14 基因在核苷酸和氨基酸序列方面与 SOX21(604974) 最相似(Malas 等人,1999)。 威尔莫尔等人(2000) 发现 SOX14 氨基酸序列在人类、小鼠和鸡的直系同源物中高度保守,表明该蛋白质在脊椎动物发育中发挥着重要作用。 SOX14 在发育中的鸡肢的神经管和顶端外胚层嵴中表达。 威尔莫尔等人(2000) 指出 SOX14 是唯一已知在顶外胚层脊中表达的 SOX 基因,顶外胚层脊是指导胚胎肢芽生长的结构。
▼ 基因结构
威尔莫尔等人(2000) 指出 SOX14 和 SOX21 基因似乎都是由单个外显子编码的。 阿尔西克等人(1998)确定SOX14基因是无内含子的。
▼ 测绘
通过荧光原位杂交(FISH),Arsic 等人(1998) 将 SOX14 基因定位到染色体 3q22-q23。 通过辐射杂交分析,他们将基因 3.46 cR 定位到 D3S1549 远端和 D3S1576 近端。 Hargrave 等人使用辐射混合绘图和 FISH(2000) 将 SOX14 基因定位于 3q23 标记 D3S1576 附近。 通过 FISH,Wilmore 等人(2000) 将 SOX14 基因定位到 3q,并通过筛选一组 YAC 克隆进一步缩小分配范围。 他们发现 SOX14 基因定位于 3q23 上的 1.15 Mb YAC,靠近眼睑裂、上睑下垂、内眦赘皮综合征(BPES; 110100) 和莫比斯综合征(MBS2; 601471) 的位点。