溶质载体家族22(有机阳离子转运体),成员16; SLC22A16
- FLY-LIKE 假定转运蛋白 2; FLIPT2
- 肉碱转运蛋白2; CT2
HGNC 批准的基因符号:SLC22A16
细胞遗传学位置:6q21 基因组坐标(GRCh38):6:110,424,687-110,476,613(来自 NCBI)
▼ 说明
有机离子转运蛋白,例如 SLC22A16,转运各种医学和生理学上重要的化合物,包括药物、毒素、激素、神经递质和细胞代谢物。 这些转运蛋白也称为两亲性溶质促进剂(ASF)。
▼ 克隆与表达
Enomoto 等人通过使用大鼠 Oat1(607582) 作为查询来搜索 EST 数据库,然后筛选睾丸 cDNA 文库(2002)克隆了SLC22A16,他们将其命名为CT2。 推导的 543 个氨基酸的蛋白质包含 12 个跨膜结构域和多个 N-糖基化和磷酸化位点。 N 和 C 末端朝向细胞质。 SLC22A16 与 OAT1、OCTN2(603377) 和 OCT1(602607) 分别具有 36%、37% 和 38% 的氨基酸同一性。 Northern印迹分析检测到仅在睾丸中表达的2.1和1.8 kb转录物。 免疫组织化学分析在支持细胞中检测到 SLC22A16,但在生发细胞或间质组织中未检测到。 在附睾中,SLC22A16在附睾小管主细胞的管腔膜中表达,表达仅限于附睾头和体部区域。 在传出导管、睾丸网和精子的管腔膜中也检测到微弱的染色。
通过在 EST 数据库中搜索与 ASF 家族成员相似的序列,然后对肾脏 cDNA 文库进行 PCR,Eraly 和 Nigam(2002) 克隆了 SLC22A16,并将其命名为 FLIPT2。 推导的 547 个氨基酸的蛋白质包含 12 个跨膜结构域。 Eraly 和 Nigam(2002) 指出,他们的 SLC22A16 cDNA 编码的蛋白质与 Enomoto 等人描述的蛋白质不同(2002)在N末端,他们认为这2个序列可能是剪接变体。 Northern 印迹分析在所有检查的成体组织中检测到 2.4-kb 和 4.4-kb SLC22A16 转录物的低表达。 肾脏、大脑和肌肉中的表达最高。 2.4-kb 转录本在白细胞中占主导地位,4.4-kb 转录本在肌肉中占主导地位。 在其他组织中,两种变体的表达水平相当。 RT-PCR(而非 Northern blot 分析)在所有检查的胎儿组织中检测到 SLC22A16 的表达。
▼ 基因功能
通过爪蟾卵母细胞的功能表达,Enomoto 等人(2002) 证明 SLC22A16 支持放射性标记肉碱的摄取。 它不转移有机阳离子转运蛋白或有机阴离子转运蛋白的几种典型底物。 L-和D-肉碱的转移都是饱和的。 当细胞外Na(+)被Li(+)取代时,摄取仅减少至50%,表明转运并不完全依赖于细胞外Na(+)。 随着 pH 从 5.5 增加到 8.5,传输增加。 流出不受细胞外左旋肉碱的反式刺激,表明SLC22A16介导的肉碱渗透是通过促进扩散而不是通过交换机制发生的。 肉毒碱相关分子的竞争实验表明,转移具有相对特异性。 在左旋肉碱合成的前体中,只有甜菜碱表现出抑制作用。 几种左旋肉碱类似物的使用揭示了 SLC22A16 和 OCTN2 识别的底物之间细微的物理化学差异。
▼ 基因结构
榎本等人(2002) 确定 SLC22A16 基因包含 10 个外显子,跨度 51.5 kb。 外显子 1 未翻译。 Eraly 和 Nigam(2002) 确定 SLC22A16 基因包含 8 个外显子,长度约为 61.7 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析和 FISH,Enomoto 等人(2002) 将 SLC22A16 基因定位到染色体 6q21-q22.1。 Eraly 和 Nigam(2002) 通过基因组序列分析将 SLC22A16 基因定位到染色体 6q21。