ER 1 中的非传统圈套; USE1

  • ER 1 中的非常规圈套,S. Cerevisiae,同源物
  • 造血干细胞/祖细胞蛋白 MDS032; MDS032
  • p31

HGNC 批准的基因符号:USE1

细胞遗传学位置:19p13.11 基因组坐标(GRCh38):19:17,215,357-17,219,829(来自 NCBI)

▼ 说明

SNARE 是定位于内膜系统并在内膜系统中发挥作用的膜蛋白,膜之间的对接和融合发生在该系统中。 USE1 是一种定位于内质网(ER) 和 ER-高尔基体中间室的 SNARE,参与溶酶体功能的维持(Okumura et al., 2006)。

▼ 克隆与表达

Okumura 等人使用基于荧光定位、逆转录病毒介导的表达克隆和信号序列陷阱(2006) 鉴定了一种小鼠克隆 D12,其在内质网和细胞质中表达。 作者随后从小鼠骨髓肥大细胞 cDNA 文库中分离出全长 D12,并指出存在 D12 的 EST 序列变体,其中一些包含编码额外 Ser 残基的 CAG 插入。 D12 包含 2 个预测的卷曲螺旋结构域、一个 C 端跨膜结构域、一个与突触蛋白 N 端结构域弱相似的区域以及一个与 t-SNARE 基序弱相似的区域。 D12 与酵母 Use1p/Slt1p 表现出弱同源性,与人蛋白 MDS032 具有 84.9% 的同一性。 MDS032 不包含 D12 的前 11 个氨基酸,并且在内部区域(D12 残基 139-164)内显示出较低的同源性。 荧光分析和细胞分级分析表明,D12 定位于 ER 和 ER-高尔基体中间室。

▼ 基因功能

Okumura 等人使用免疫沉淀法(2006) 表明 D12 是一种 SNARE 蛋白,可与 突触融合蛋白-18(606046)、Sec22b(604029)、α-SNAP(603215) 和 VAMP7 结合,从而表明 D12 与参与早期和后高尔基体分泌器以及内体-溶酶体转运的 SNARES 相互作用。 免疫荧光和 siRNA 测定表明,D12 的过表达或敲低均不影响 ER、高尔基体或 ER-高尔基体中间区室结构,表明 D12 不调节早期分泌途径中的膜转移。 然而,通过浓缩核染色质、半胱天冬酶-3(600636) 激活和 BAX(600040) 构象变化测量,D12 敲低确实诱导细胞凋亡。 此外,D12 下调导致脂褐素颗粒快速出现,表明溶酶体降解酶对线粒体的降解受损。 与此一致的是,共聚焦显微镜和 D12 缺陷细胞的分级显示,高尔基体后转移和溶酶体蛋白酶组织蛋白酶-D(116840) 的成熟受损。

▼ 测绘

Gross(2019) 根据 USE1 序列(GenBank BC006005) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 USE1 基因对应到染色体 19p13.11。