二磷酸异戊二烯合酶,亚基 1; PDSS1

  • 茄烷基二磷酸合成酶,小鼠,同系物;SPS
  • 转移-异戊二烯基转移酶;TPT
  • 聚异戊二烯焦磷酸合成酶
  • COQ1,酿酒酵母,同系物;COQ1

HGNC 批准的基因符号:PDSS1

细胞遗传学定位:10p12.1 基因组坐标(GRCh38):10:26,697,701-26,746,798(来自 NCBI)

▼ 说明

反式异戊二烯转移酶是一种微粒体酶,可延长辅酶 Q 或辅酶q10的异戊二烯侧链,在线粒体内的氧化磷酸化、清除自由基以及细胞信号传导的氧化还原控制中发挥作用。有关辅酶 Q 生化作用的综述,请参见 Crane(2001)。

▼ 克隆与表达

通过在 EST 数据库中搜索 S. pombe Dps1 的同源物,Saiki 等人(2005) 鉴定了人类 PDSS1,他们将其称为 DPS1。预测的 415 个氨基酸蛋白与其小鼠同源蛋白 Sps1 具有 82% 的同一性,并包含 7 个保守结构域和反式异戊二烯基二磷酸合酶典型的 DDxxD 基序。

▼ 基因功能

阿佩尔克维斯特等人(1994) 综述了大鼠肝脏反戊二烯基转移酶的特征及其在辅酶 Q 合成中的作用。大鼠酶的最佳底物是反式香叶基焦磷酸,并且在较小程度上是全反式香叶基香叶基焦磷酸。Tpt 的活性不依赖于去污剂或细胞质蛋白的存在,依赖于 Mn(2+),最适 pH 值为 8。Tpt 定位于微粒体囊泡的细胞质表面。

斋木等人(2005) 发现人 DPS1 和 DLP1(PDSS2; 610564) 在大肠杆菌中的表达导致 Q10 辅酶q10和癸烯醇的产生,而小鼠 Sps1 和 Dlp1 的表达产生 Q9 辅酶q10和茄尼醇。蛋白质印迹分析表明蛋白质以异四聚体的形式表达。人和小鼠蛋白的异源组合在大肠杆菌中的表达产生了 Q9 和 Q10,表明 DPS1/Sps1 和 DLP1/Dlp1 都参与确定辅酶q10侧链。虽然人DPS1和小鼠Sps1可以补充缺乏Dps1的粟酒裂殖酵母,但人DLP1和小鼠Dlp1都不能补充缺乏Dlp1的粟酒裂殖酵母。斋木等人(2005) 得出结论,DPS1 和 DLP1 都是生成十异戊二烯二磷酸合酶所必需的。

▼ 测绘

斋木等人(2005) 指出 PDSS1(DPS1) 基因对应到染色体 10p12.1。

▼ 分子遗传学

罗蒂格等人(2000) 确定了患有多组织辅酶 Q10 缺乏症的患者。患者的细胞提取物中十异戊二烯二磷酸浓度非常低,这与 TPT 缺乏症一致。然而,无法鉴定 TPT cDNA 中的突变。正常成纤维细胞和类淋巴母细胞系中的信使 RNA 水平非常低,无法与 CoQ10 缺陷细胞进行比较。罗蒂格等人(2000)表明致病突变要么位于 TPT 基因的其他位置,要么位于参与 TPT 活性调节的另一个基因中。

莫莱特等人(2007) 报道了一个摩洛哥近亲家庭,其中 2 名同胞患有 COQ10 缺乏症 2(COQ10D2; 614651),表现为一种多系统疾病,包括早发性耳聋、视神经萎缩、轻度智力低下、周围神经病变、肥胖、网状青斑和心脏瓣膜病。酶学分析显示醌依赖性氧化磷酸化活性较低,添加醌后氧化磷酸化活性恢复证实了COQ10缺乏。纯合性作图和候选基因分析鉴定出 PDSS1 基因中的纯合突变(D308E; 607429.0001)。用含有与人 D308E 相对应的突变的酵母 Coq1 转化缺乏 Coq1 的酵母,会导致呼吸培养基上的生长缺陷。

Vasta 等人在患有 COQ10D2 的女婴中(2012) 鉴定了 PDSS1 基因中的复合杂合错义突变(R221X, 607429.0002 和 S370R, 607429.0003)。这些突变是通过对一组与线粒体功能相关的基因进行测序来鉴定的。

在 2 名埃及姐妹中,由近亲父母所生,携带 COQ10D2,Nardecchia 等人(2021) 发现了 PDSS1 基因中的纯合错义突变(Q245H; 607429.0004)。通过全外显子组测序鉴定出的突变与家族中的疾病分离。

Bellusci 等人在一名患有 COQ10D2 的男孩中(2021) 鉴定了 PDSS1 基因中错义(V239G; 607429.0005) 和无义(R395X; 607429.0006) 突变的复合杂合性。

关联待确认

Jurkute 等人在 6 名无关的视网膜色素变性/视网膜营养不良患者(RP/RD;参见 268000) 中进行了研究(2022) 通过全基因组测序鉴定了 PDSS1 基因(NM_014317.5) 中的双等位基因突变。仅在家族 3(GC3635) 中进行亲本突变分离。一名患者(家族 4)具有纯合突变(c.1118_1120dup;Val373_Gln374insLeu)。另外5名患者存在复合杂合突变。家族1(GC3635)的突变为c.368A-G、E123G和c.18G-A、W6X。家族2(GC25311)中的突变为c.232C-A、H78N和c.866G-A、G296R。在 3 名患者(家族 3、5 和 6(ARRP195))中发现了 c.589A-G、K197E 突变,反式突变可能具有功能丧失突变(分别为 c.722-2A-G、c.468-25A-G、c.893dup)。患者血细胞中的 mRNA 分析表明 c. 722-2A-G 突变导致外显子 7 和 8 或外显子 8 中的替代剪接受体的跳过,而 c.468-25A-G 导致包含替代外显子。K197E 突变存在于 gnomAD 数据库中,次要等位基因频率为 0.001454,并在 1 个个体中观察到纯合性。其中 5 名患者患有色素性视网膜炎,4 号家族的患者患有视网膜营养不良。家庭1、家庭2、家庭3、家庭4的患者有听力损失。

▼ 等位基因变异体(6 个精选示例):

.0001 辅酶 Q10 缺乏症,初级,2
PDSS1,ASP308GLU

在一个摩洛哥近亲家庭中,一对儿子和女儿患有辅酶 Q10 缺乏症 2(COQ10D2;614651),Mollet 等人(2007) 在 PDSS1 基因的外显子 10 中发现了纯合的 977T-G 颠换,导致 asp308-to-glu(D308E) 取代。COQ10缺乏在这些患者中表现为多系统疾病,包括早发性耳聋、轻度智力低下、视神经萎缩、周围神经病变、肥胖、网状青斑和心脏瓣膜病。三个未受影响的兄弟要么像他们的父母一样是杂合子,要么是野生型等位基因的纯合子。

.0002 辅酶 Q10 缺乏症,原发性,2
PDSS1,ARG221TER

Vasta 等人在一名患有辅酶 Q10 缺乏症 2(COQ10D2;614651)的女婴中(2012) 鉴定了 PDSS1 基因中的复合杂合突变,c.661C-T 转换(c.661C-T,NM_014317),导致 arg221 到 ter(R221X) 取代,以及 c. 1108A-C 颠换,导致 Ser370 到 arg(S370R;607429.0003) 的取代。通过对一组与线粒体功能相关的基因进行测序来鉴定这些突变,并通过桑格测序进行确认。患者的白细胞辅酶Q10水平明显降低。

.0003 辅酶 Q10 缺乏症,初级,2
PDSS1,SER370ARG

为了讨论 PDSS1 基因中的 c.1108A-C 颠换,导致 Ser370 到 arg(S370R) 的取代,Vasta 等人在辅酶 Q10 缺乏症 2(COQ10D2; 614651) 患者的复合杂合状态下鉴定了这种转换(2012),参见 607429.0002。

.0004 辅酶 Q10 缺乏症,原发性,2
PDSS1,GLN245HIS

Nardecchia 等人在 2 名埃及姐妹中发现了辅酶 Q10 缺乏症 2(COQ10D2;614651),她们是近亲结婚所生(2021) 鉴定了 PDSS1 基因中 c.735G-T 颠换(c.735G-T,NM_014317.5)的纯合性,导致保守位点处的 gln245 到 his(Q245H)替换。该突变是通过全外显子组测序鉴定出来的,并与家族中的疾病分开。gnomAD 数据库中不存在该突变。

.0005 辅酶 Q10 缺乏症,初级,2
PDSS1,VAL239GLY

Bellusci 等人在一名患有辅酶 Q10 缺乏症 2(COQ10D2; 614651) 的男孩中(2021) 鉴定了 PDSS1 基因中的复合杂合突变:c.716T-G 颠换(c.716T-G,NM_014317.3),导致 val239 到 gly 取代,以及 c.1183C-T 转换,导致 arg395 到 ter(R395X;607429.0006)取代。

.0006 辅酶 Q10 缺乏症,原发性,2
PDSS1,ARG395TER

为了讨论 PDSS1 基因中的 c.1183C-T 转变(c.1183C-T,NM_014317.3),导致 arg395 到 ter(R395X)取代,Bellusci 等人在辅酶 Q10 缺乏 2(COQ10D2;614651)患者中以复合杂合状态鉴定出这种转变(2021),参见 607429.0005。