赖氨酸甲基转移酶5B； KMT5B
- 杂色抑制子 4-20，果蝇，1 的同源物；SUV420H1
- 赖氨酸特异性甲基转移酶 5B
- SU（VAR）4-20，果蝇，同源物，1
- CGI85
HGNC 批准的基因符号：KMT5B
细胞遗传学位置：11q13.2 基因组坐标（GRCh38）：11:68,154,863-68,213,648（来自 NCBI）
▼ 说明
SUV420H1 和相关酶 SUV420H2（613198） 充当组蛋白甲基转移酶，可特异性地将核小体组蛋白 H4（参见 602822）在赖氨酸 20（K20） 上三甲基化（Schotta 等人，2004）。
▼ 克隆与表达
Twells 等人通过对 11 号染色体的 IDDM4（600319） 区域进行测序，然后进行数据库分析（2001） 克隆了 SUV420H1，他们将其称为 CGI85。推导的蛋白质含有384个氨基酸。
肖塔等人（2004） 克隆小鼠 Suv420h1。推导的 876 个氨基酸的蛋白质包含一个 N 端 SET 结构域和 3 个在其他物种的 Suv420h 直向同源物中保守的附加区域。荧光标记的 Suv420h1 定位于转染的小鼠胚胎成纤维细胞（MEF） 的中心周异染色质。
▼ 基因功能
Schotta 等人利用 RNA 干扰（2004） 表明，MEF 中三甲基化组蛋白 H4K20 的中心周积累需要 Suv420h1 和 Suv420h2。三甲基化 H3K9（参见 602810）的积累不受影响。分离的 Suv420h1 和 Suv420h2 的 SET 结构域对核小体表现出强甲基转移酶活性，但对重组组蛋白八聚体仅具有弱活性，对肽和游离组蛋白没有活性。使用针对单甲基化、二甲基化和三甲基化 H4K20 的抗体进行蛋白质印迹分析表明，Suv420h1 和 Suv420h2 产物富集三甲基化 H4K20。
▼ 基因结构
特韦尔斯等人（2001） 确定 SUV420H1 基因至少包含 10 个跨度 24 kb 的外显子。
▼ 测绘
通过对 BAC 和 PAC 克隆的分析，Twells 等人（2001） 将 SUV420H1 基因对应到染色体 11q13。
▼ 分子遗传学
Iossifov 等人在 7 名患有常染色体显性智力发育障碍 51（MRD51; 617788） 的无关患者中（2014） 和 Stessman 等人（2017） 鉴定了 KMT5B 基因中的 7 个不同的杂合变体（参见，例如 610881.0001-610881.0003）。其中 4 个变体被归类为“可能的基因破坏”（LGD） 事件，例如无义变体或移码变体，另外 3 个变体是预计有害的错义变体。其中五个变体被证明是从头发生的。一种错义变异是母系遗传的，没有母亲的临床信息，并且无法从另一名患者获得父母 DNA 来确定分离。其中 3 个变异是私人变异，仅在受影响的患者（家庭）中发现，另外 4 个变异被归类为“极其罕见”。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。这些患者是从超过 11,730 名患有自闭症谱系障碍、智力障碍和/或发育迟缓的患者中确定的，涉及 7 个国家和 4 大洲的 15 个中心。作者使用单分子分子倒置探针（smMIP） 对这些患者样本中的 208 个候选基因进行了测序，并通过桑格测序证实了这一结果。LGD 和 KMT5B 基因错义突变的结果具有统计学意义。Iossifov 等人之前曾报道过其中三名患者（患者 5、6 和 7）（2014）作为自闭症大型基因研究的一部分。智力障碍和/或发育迟缓涉及 7 个国家和 4 个大洲的 15 个中心。作者使用单分子分子倒置探针（smMIP） 对这些患者样本中的 208 个候选基因进行了测序，并通过桑格测序证实了这一结果。LGD 和 KMT5B 基因错义突变的结果具有统计学意义。Iossifov 等人之前曾报道过其中三名患者（患者 5、6 和 7）（2014）作为自闭症大型基因研究的一部分。智力障碍和/或发育迟缓涉及 7 个国家和 4 个大洲的 15 个中心。作者使用单分子分子倒置探针（smMIP） 对这些患者样本中的 208 个候选基因进行了测序，并通过桑格测序证实了这一结果。LGD 和 KMT5B 基因错义突变的结果具有统计学意义。Iossifov 等人之前曾报道过其中三名患者（患者 5、6 和 7）（2014）作为自闭症大型基因研究的一部分。LGD 和 KMT5B 基因错义突变的结果具有统计学意义。Iossifov 等人之前曾报道过其中三名患者（患者 5、6 和 7）（2014）作为自闭症大型基因研究的一部分。LGD 和 KMT5B 基因错义突变的结果具有统计学意义。Iossifov 等人之前曾报道过其中三名患者（患者 5、6 和 7）（2014）作为自闭症大型基因研究的一部分。
Faundes 等人在 2 名不相关的 MRD51 患者中（2018） 在 KMT5B 基因（610881.0004 和 610881.0005） 中发现了新的杂合功能丧失变异。这些患者是从破译发育障碍（DDD） 研究中接受外显子组测序的 4,293 名三人组中确定的。通过基于通路的方法选择 KMT5B 基因进行研究，重点关注参与组蛋白赖氨酸甲基化/去甲基化的候选基因。这些变体根据几个大型数据库进行了筛选，包括 ExAC、1000 基因组计划和外显子组测序计划。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究，但预计这两种变体都会导致功能丧失和单倍体不足。
▼ 等位基因变异体（5 个精选示例）：
.0001 智力发育障碍，常染色体显性遗传 51
KMT5B，1-BP DEL，NT725
Stessman 等人对一名患有常染色体显性遗传性智力发育障碍 51（MRD51; 617788） 的 10 岁瑞典女孩（患者 2，2135-09D）进行了研究（2017） 在 KMT5B 基因中发现了一个从头杂合的 1-bp 缺失（c.725del, NM_017635.4），导致移码和提前终止（Leu242HisfsTer30）。候选基因测序发现突变，并经桑格测序证实；它被认为是一种私人突变，仅发生在该患者身上。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究，但预计该变异会导致功能丧失。
.0002 智力发育障碍，常染色体显性遗传 51
KMT5B，2-BP DEL，NT1557
Stessman 等人对一名患有常染色体显性智力发育障碍 51（MRD51; 617788） 的 7 岁瑞典男孩（患者 3，1895-11D）进行了研究（2017） 在 KMT5B 基因中发现了一个从头杂合的 2-bp 缺失（c.1557_1558del, NM_017635.4），导致移码和提前终止（Asn520SerfsTer33）。候选基因测序发现突变，并经桑格测序证实；它被认为是一种私人突变，仅发生在该患者身上。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究，但预计该变异会导致功能丧失。
.0003 智力发育障碍，常染色体显性遗传 51
KMT5B，TRP264SER
Stessman 等人在一名患有常染色体显性智力发育障碍 51（MRD51; 617788） 的 14 岁男孩（患者 5，SSC_11519.p1）中（2017） 报道了 KMT5B 基因中的从头杂合 c.791G-C 颠换（c.791G-C, NM_017635.4），导致 trp264 到 Ser（W264S） 取代。候选基因测序发现突变，并经桑格测序证实；它被认为是一种“极其罕见”的突变。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。Iossifov 等人之前曾报道过该患者（2014）作为自闭症大型基因研究的一部分，其中没有提供临床细节。
.0004 智力发育障碍，常染色体显性遗传 51
KMT5B，1-BP DEL，219C
Faundes 等人在一名患有常染色体显性智力发育障碍 51（MRD51; 617788） 的 13 岁女孩中（2018） 在 KMT5B 基因中发现了一个从头杂合的 1-bp 缺失（c.219delC, NM_017635.4），预计会导致移码和提前终止（Ala74ProfsTer10）。该突变是通过外显子组测序发现的。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究，但预计该变异会导致功能丧失和单倍体不足。
.0005 智力发育障碍，常染色体显性遗传 51
KMT5B，ARG187TER
Faundes 等人在一名患有常染色体显性智力发育障碍 51（MRD51; 617788） 的 19 岁男性中（2018） 在 KMT5B 基因中发现了一个从头杂合的 c.559C-T 转换（c.559C-T, NM_017635.4），导致 arg187 到 ter（R187X） 取代。该突变是通过外显子组测序发现的。没有进行该变异的功能研究和患者细胞的研究，但预计该变异会导致功能丧失和单倍体不足。
