胞囊复合物成分 6B; EXOC6B

  • SEC15,酿酒酵母,B 的同源物; SEC15B
  • KIAA0919

HGNC 批准的基因符号:EXOC6B

细胞遗传学定位:2p13.2 基因组坐标(GRCh38):2:72,175,984-72,826,033(来自 NCBI)

▼ 说明

在酵母和大鼠中,Sec15 是靶向胞吐作用所需的多蛋白复合物的一部分。

▼ 克隆与表达

Nagase 等人通过对从大小分级的脑 cDNA 文库中获得的克隆进行测序(1999) 克隆了 SEC15B,他们将其命名为 KIAA0919。 推导的蛋白质含有710个氨基酸,mRNA的3引物非翻译区含有4个MIR序列。 SEC15B 在 668 个氨基酸中与大鼠 Sec15 具有 69.2% 的氨基酸同一性。 RT-PCR ELISA 在大多数组织和测试的特定成人大脑区域中检测到低至中等表达。 在睾丸、卵巢和杏仁核中检测到最高表达。 在骨骼肌、胰腺、脾脏、胎儿肝脏和胎儿大脑中检测到很少或没有表达。

▼ 测绘

通过辐射杂交分析,Nagase 等人(1999) 将 SEC15B 基因对应到 2 号染色体。

▼ 基因功能

布莱莫拉等人(2001) 确定大鼠脑突触体 Sec15b 作为外囊复合体的一部分以 GTP 依赖性方式与 RalA(179550) 相关。

▼ 分子遗传学

Girisha 等人在 2 名患有脊椎干骺端发育不良和多发关节脱位的兄弟中(SEMDJL3; 618395)(2016) 鉴定了 EXOC6B 基因中的无义突变(Y302X; 607880.0001) 的纯合性,他们未受影响的表亲父母是杂合子。

Campos-Xavier 等人有 2 个患有 SEMDJL3 的姐妹(2018) 鉴定了 EXOC6B 基因(607880.0002) 内约 220 kb 缺失的纯合性。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):

.0001 脊柱外骺端发育不良伴关节松弛,3 型
EXOC6B、TYR302TER

Girisha 等人在 2 名患有脊椎干骺端发育不良和多发关节脱位的兄弟中(SEMDJL3; 618395)(2016) 鉴定了 EXOC6B 基因中 c.906T-A 颠换(c.906T-A, NM_015189.1) 的纯合性,导致 tyr302-to-ter(Y302X) 取代。 他们未受影响的表亲父母是突变杂合子。 该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,但 ExAC 数据库中不存在该突变。

.0002 脊柱外骺端发育不良伴关节松弛,3 型
EXOC6B、219,248-BP DEL、EX9-20DEL

2 名姐妹患有脊椎骨骺发育不良和多发性关节脱位(SEMDJL3; 618395),最初由 Spranger 等人报道(2006)(患者 2 和 3),Campos-Xavier 等人(2018) 鉴定了 EXOC6B 基因中 219,248 bp 缺失(c.915+20070_2197-135947del, NM_0013217333.1) 的纯合性,将内含子 8 连接到内含子 20,并删除 22 个外显子中的 12 个(外显子 9-20,包括在内),同时保留从外显子 8 到外显子的阅读框21. 该缺失预测 EXOC6B 蛋白的氨基酸 305 至 732(Gly305_Gln732del) 的丢失。 通过 array-CGH 鉴定缺失。