RNA 结合基序蛋白,X 染色体; RBMX
- 异质核核糖核蛋白 G;HNRNPG
本条目中代表的其他实体:
- RNA 结合基序蛋白、X 染色体、RETROGENE、包括;RBMXRT,包含
- RNA 结合基序蛋白,X 染色体,假基因 1,包含;RBMXP1,包含
HGNC 批准的基因符号:RBMX
细胞遗传学定位:Xq26.3 基因组坐标(GRCh38):X:136,869,192-136,880,725(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
勒科尼亚特等人(1992) 克隆了编码核 43-kD 糖蛋白的 cDNA,被鉴定为 G hnRNP 蛋白。他们将基因命名为 HNRPG。HNRPG cDNA 与 RBMY1A1 有 60% 同源性。
马泽拉特等人(1999) 分离并测序了 2 个 Rbmx 小鼠 cDNA 克隆,他们将其命名为 Rbmx1 和 Rbmx2,具有不同的 3 引物末端。RT-PCR 显示两种 Rbmx 转录物均普遍表达。马泽拉特等人(1999) 得出结论,基于内含子序列的缺失,小鼠 Hnrpg 基因是源自 Rbmx 的反座子。
▼ 基因功能
人类 Y 染色体上的基因分为两类,具有不同的进化起源。具有避免失活的 X 同源物的广泛表达的单拷贝基因(XY 共享基因)源自古老的原始 XY 染色体对。没有X同源物的睾丸特异性多拷贝基因源自常染色体,并且由于其男性特异性功能而在“自私的Y”上积累。RBMY 基因家族中的基因副本(参见 RBMY1A1, 400006)是候选精子发生基因,因为它们存在于人类 Yq 上的所有 3 个无精子症因子(AZF) 缺失区间,这些区域与少精子症或无精子症相关(Vogt 等,1997)。Delbridge 等人在人类和有袋动物中证明了 Y 遗传的 RBMY 基因的活性 X 遗传同源物(1999) 和 Mazeyrat 等人在小鼠中的研究(1999)。德尔布里奇等人(1999) 指出,像 X 和 Y 染色体上的其他基因对(例如,DFFRX/DFFRY;参见 400005)一样,RBMX 保留了广泛的功能,而 RBMY 在精子发生中进化出了男性特有的功能。因此,RBMY1A1 远不属于“第二类”睾丸特异性元件,而是一个不同的 XY 共享基因。
维纳布尔斯等人(2000) 使用酵母 2-杂交系统表明 RBMY 基因产物 hnRNPG 和一种新的睾丸特异性相关基因(称为 hnRNPG-T)与 Tra2-β(TRA2B; 602719) 相互作用,Tra2-β 是一种普遍存在但在睾丸中高表达的前 mRNA 剪接激活剂。RBMY 基因产物和 Tra2-β 共定位于人精母细胞核的 2 个主要结构域中。与 RBMY 基因产物的蛋白质相互作用结构域一起孵育,抑制了含有与 Tra2-β 结合的必需增强子的特定前 mRNA 底物的体外剪接。RBM 的 RNA 结合域影响 5-prime 剪接位点选择。作者得出结论,hnRNPG 蛋白家族参与前 mRNA 剪接,并假设 RBM 可能参与精母细胞中 Tra2-β 依赖性剪接。
使用体内剪接测定,Hofmann和Wirth(2002)将HNRNPG及其旁系同源物rbm识别为剪接因素,它促进了SMN2(601627)外显子7. HNRNPG和HNRNPG和RBM非特定型RNA,但直接与Htra2-β2-β2-β2-β2-β-srike Intion Itctions srne Interiaction。 SMN2外显子7前MRNA。使用 hnRNPG 的缺失突变体,作者证明了 hnRNPG 与 Htra2-β1 的特异性蛋白质-蛋白质相互作用,该相互作用介导 SMN2 外显子 7 的包含,而不是 hnRNPG 与 SMN 前 mRNA 的非特异性相互作用。这些反式作用剪接因子对内源性 SMN2 转录本也有效,并增加了内源性 SMN 蛋白水平。作者提出了一个模型,说明这些剪接因子如何调节外显子 7 mRNA 的加工。
纳西姆等人(2003) 表明 HNRNPG 和剪接激活蛋白 TRA2B 对几个外显子的掺入具有相反的作用,并且两者都能够充当激活剂或阻抑剂。HNRNPG 通过特定序列发挥作用,抑制人慢骨骼 α-原肌球蛋白(TPM3;191030) 的骨骼肌特异性外显子(SK),并刺激替代非肌肉外显子的包含。HNRNPG 与外显子的结合被 TRA2B 拮抗。这两种蛋白质对肌营养不良蛋白(300377) 假外显子也具有相反的作用。该外显子在患者心肌中的掺入水平高于骨骼肌,导致 X 连锁扩张型心肌病。与 HNRNPG 共转染抑制了心脏成肌细胞中的掺入,而 TRA2B 则增加了骨骼肌成肌细胞中的掺入。
Munschauer 等人使用 RNA 反义纯化和定量质谱相结合的方法(2018) 发现 NORAD(617037) 与 DNA 损伤反应的一个组成部分 RBMX 相互作用,并包含转录组中最强的 RBMX 结合位点。蒙绍尔等人(2018) 证明 NORAD 控制 RBMX 组装核糖核蛋白复合物的能力,他们将其称为 NORAD 激活的核糖核蛋白复合物-1(NARC1),其中包含已知的基因组不稳定拓扑异构酶 I 抑制剂(TOP1; 126420)、ALYREF(604171) 和 PRPF19(608330)-CDC5L(602868) )复杂。NORAD 或 RBMX 耗尽的细胞表现出染色体分离缺陷频率增加、复制叉速度降低以及细胞周期进程改变,它们代表与 TOP1 和 PRPF19-CDC5L 功能机械相关的表型。反式表达 NORAD 可以挽救 NORAD 耗尽引起的缺陷,但当 NORAD 中的 RBMX 结合位点被删除时,挽救效果会显着受损。蒙绍尔等人(2018) 得出的结论是,他们的结果表明 NORAD 和 RBMX 之间的相互作用对于 NORAD 功能很重要,并且 NORAD 是组装以前未知的拓扑异构酶复合物 NARC1 所必需的,这有助于维持基因组稳定性。
▼ 测绘
德尔布里奇等人(1999) 通过 FISH 将 RBMX 基因定位到人类 Xq26。Mazeyrat 等人通过对人/小鼠杂交细胞系进行 PCR 分析(1999) 证明了 HNRPG 同源结构基因到人类 X 染色体的定位。通过 FISH,他们将小鼠 Rbmx 基因定位到 XA3-XA5,该区域与人类 Xq26 具有同源性。马泽拉特等人(1999) 将 Hnrpg 逆转录子(他们将其重命名为 Rbmxrt)定位于小鼠 14 号染色体。
假基因
勒科尼亚特等人(1992)通过放射性原位杂交将HNRPG基因定位到染色体6p12。德尔布里奇等人(1999) 发现 6p12 上的 HNRPG 基因座代表一个经过加工的假基因,并认为该拷贝和其他与 1、4、9、11 号染色体和 X 染色体上的 HNRPG cDNA 具有核苷酸同源性的无内含子拷贝很可能是通过从人类 X 染色体上的 RBMY 样序列逆转录转座而衍生的。他们认为,HNRPG cDNA 的错误定位可能是由于 cDNA 克隆与 6 号染色体上经过加工的假基因优先杂交而发生的。Delbridge 等人(1999) 提议将 HNRPG 基因座更名为 RBMXP1。
▼ 分子遗传学
Shashi 等人最初报道,在患有 X 连锁智力发育障碍 11(MRXS11;300238) 家族的所有受影响男性中(2000),沙什等人(2015) 在 RBMX 基因(300199.0001) 中发现了一个半合子截短突变。该突变是通过全外显子组测序发现的,并通过桑格测序证实。未对患者细胞进行功能研究和研究。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):
.0001 智力发育障碍,X 连锁,综合症 11(1 个家族)
RBMX,23-BP DEL,EX9
在来自 X 连锁综合征型智力发育障碍 11(MRXS11;300238)家族的所有受影响男性中,最初由 Shashi 等人报道(2000),沙什等人(2015) 在 RBMX 基因的外显子 9 中发现了一个半合子 23-bp 缺失,导致移码和提前终止。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,它与家族中的疾病分离,并且在外显子组测序项目数据库或 1,300 名对照中未发现。未对患者细胞进行功能研究和研究。