尿素1B; UPK1B
HGNC 批准的基因符号:UPK1B
细胞遗传学位置:3q13.32 基因组坐标(GRCh38):3:119,173,598-119,205,143(来自 NCBI)
▼ 说明
哺乳动物膀胱上皮的不对称单位膜(AUM)被认为参与强化和稳定尿路上皮顶端表面,从而防止膀胱扩张期间细胞破裂。 AUM 的主要蛋白质成分是 UPK1A(611557)、UPK1B、UPK2(611558) 和 UPK3(UPK3A; 611559)(Yu et al., 1994)。
▼ 克隆与表达
于等人(1994) 克隆了编码牛 Upk1a 和 Upk1b 的 cDNA,发现它们与 4 次跨膜(4TM) 或四跨家族中的蛋白质同源。 该家族的成员包括 CD37(151523)、CD53(151525)、CD63(155740) 和 CD151(602243),是包含 4 个预测跨膜结构域(TMD) 的整合膜蛋白。 Upk1a 和 Upk1b 的 TMD 3 和 4 通过长亲水环连接,其中包含 6 个高度保守的半胱氨酸残基和一个潜在的 N-糖基化位点。 于等人(1994) 指出所有 UPK 都具有较大的外质结构域但非常小的细胞质结构域。
芬奇等人(1997)通过PCR克隆了编码人UPK1B的部分长度cDNA。 该 693 bp cDNA 与牛 Upk1b 具有 91% 的同源性。
Lobban 等人使用 RT-PCR(1998) 发现 UPK1B 在所有检查的正常人尿路上皮细胞系中表达。 原位杂交显示正常人尿路上皮的浅层和中上层细胞中均存在 UPK1B。 在检查的非尿路上皮组织中未检测到表达。 与其他尿斑蛋白的表达相反,UPK1B 在肿瘤性尿路上皮中表达,并在中分化的移行细胞癌(TCC) 中高表达。
使用基于牛 Upk3 的引物,Yuasa 等人(1998) 从正常人膀胱总 RNA 中克隆了 UPK1B。 推导的蛋白质含有287个氨基酸。 RT-PCR 在正常和癌性尿路上皮组织中检测到 UPK1B 和 UPK3。 这两种基因也在 3 名转移性 TCC 患者的外周血中检测到,但在 9 名非转移性 TCC 患者或 3 名健康志愿者的外周血中均未检测到。
▼ 基因结构
奥尔斯堡等人(2002) 确定 UPK1B 基因包含 8 个外显子,跨度 31 kb。 外显子 1 是非编码的,内含子 1 跨度为 13 kb。 启动子区域包含 CAATT 框和 AP1(参见 JUN;165160)、AP4(600743)和 SP1(189906)的结合位点,但没有 TATA 框。 规范的 Poly(A) 信号和非规范的 Poly(A) 信号分别位于 ATG 下游约 17.5 和 18.4 kb 处。
▼ 测绘
通过放射性同位素原位杂交,Finch 等人(1997) 将 UPK1B 基因对应到 3q13.3-q21。 韦伯等人(1999) 将小鼠 Upk1b 基因定位到 16 号染色体。