含 2-酮戊二酸和铁依赖性加氧酶结构域的蛋白质 1； OGFOD1

HGNC 批准的基因符号：OGFOD1

细胞遗传学定位：16q13 基因组坐标（GRCh38）：16:56,451,524-56,479,104（来自 NCBI）

▼ 说明

OGFOD1 属于 2-氧化戊二酸依赖性加氧酶家族，可催化多种生物氧化，包括小分子和蛋白质的羟基化以及组蛋白和 DNA/RNA 的去甲基化（Singleton 等，2014）。

▼ 克隆与表达

通过 HeLa 细胞 RNA 的 Northern 印迹分析，Wehner 等人（2010） 在 3 kb 处检测到一个主要的 OGFOD1 转录物，在 2.3 kb 处检测到一个次要条带。 预计这两个转录物均编码计算质量为 63 kD 的蛋白质。 免疫荧光显微镜将 OGFOD1 定位于 HeLa 细胞核，并具有弥散的细胞质染色。 Western blot分析检测到4条OGFOD1条带，表观分子质量范围为68至95 kD。 主要蛋白质条带的表观分子量为 72 kD。

斋藤等人（2010） 报道推导的 542 个氨基酸的 OGFOD1 蛋白具有假定的 N 末端核定位信号，后跟脯氨酰 4-羟化酶（参见 176710）结构域。 545 个氨基酸的小鼠直系同源物与人类 OGFOD1 具有超过 80% 的同一性。 Northern印迹分析检测到小鼠大脑中的表达最高，其次是肝脏、肾脏、心脏、肺和睾丸。

▼ 基因功能

细胞通过下调翻译来应对应激，这通常是通过 EIF2A（609234） 的磷酸化来完成，导致形成含有磷酸化 EIF2A、其他受抑制的翻译因子和 40S 核糖体亚基的应激颗粒。 韦纳等人（2010） 发现 OGFOD1 与应激颗粒成分的子集相互作用，包括 G3BP1（608431）、USP10（609818）、CAPRIN1（601178）、YB1（NSEP1; 154030） 以及应激和未应激 HeLa 细胞中的核糖体。 过表达和敲低研究表明，G3BP1 可以稳定 OGFOD1。 OGFOD1 还与 G3BP1 一起参与调节 EIF2A 磷酸化以及从亚砷酸盐诱导的应激中恢复的细胞中恢复翻译。 OGFOD1 或 G3BP1 的过度表达导致未应激和亚砷酸盐应激细胞中磷酸-EIF2A 的丰度增加，并在应激期间加速细胞凋亡。 相反，OGFOD1或G3BP1的敲低会降低磷酸-EIF2A的含量，并导致从应激中恢复的细胞中多聚核糖体的积累更快。 OGFOD1 与 EIF2A 激酶 HRI（EIF2AK1；613635） 相互作用，后者也定位于应激颗粒。 韦纳等人（2010） 得出结论，在亚砷酸盐诱导的应激细胞中，OGFOD1 在调节 EIF2A 的翻译和 HRI 介导的磷酸化中发挥促凋亡作用。

斋藤等人（2010） 发现 OGFOD1 的敲除增加了人类 Nalm6 白血病细胞在缺血条件下的活力。 微阵列和定量 RT-PCR 显示 OGFOD1 上调了预测的线粒体 F1-ATP 酶组装因子 ATPAF1（608917） 的表达。 OGFOD1 中的铁结合残基是 ATPAF1 上调所必需的。

辛格尔顿等人（2014） 将人 OGFOD1 鉴定为脯氨酰羟化酶，可修饰小核糖体亚基蛋白 RPS23（603683） 核糖体解码中心的保守脯氨酰残基（pro62）。 OGFOD1 与羟基化 RPS23 底物形成稳定的约 100 kD 复合物。 人类细胞系中 OGFOD1 的抑制或缺失会导致细胞类型依赖性诱导翻译应激途径，包括应激颗粒的形成、磷酸化 EIF2A 含量增加、翻译停滞和生长受损。 这些缺陷以及 RPS23 羟基化可以通过野生型 OGFOD1 来补充，但不能通过失活的 asp157 至 ala（D157A） 突变体来补充。 辛格尔顿等人（2014） 确定 Wehner 等人报道的高分子量 OGFOD1 蛋白（2010） 是抗 SDS-PAGE 的 OGFOD1-RPS23 复合物。 辛格尔顿等人（2014） 得出结论，OGFOD1 在调节蛋白质翻译和细胞生长中发挥着核心作用。

▼ 基因结构

斋藤等人（2010） 确定 OGFOD1 基因包含 13 个外显子，跨度约为 26 kb。

▼ 测绘

斋藤等人（2010） 报道人类 OGFOD1 基因定位于染色体 16q13。