RAS 相关 GTP 结合蛋白 B; RRGB
- RAGB
HGNC 批准的基因符号:RRAGB
细胞遗传学定位:Xp11.21 基因组坐标(GRCh38):X:55,717,749-55,758,774(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
舒尔曼等人(1995) 克隆了大鼠和人 RAGB 的 2 个剪接变体。 全长 374 个氨基酸的 RAGB(L) 蛋白与 RAS(HRAS; 190020) 相似,与 RAGA(612194) 高度相似。 它包含磷酸盐/镁结合基序 PM1、PM2 和 PM3,以及鸟嘌呤核苷酸结合基序 G1 和 G2。 相对于较短的蛋白质 RAGB(S),RAGB(L) 在 PM2 和 PM3 之间插入了 28 个密码子。 相对于 RAGA,RAGB 的 N 末端包含 33 个氨基酸的延伸。 Northern印迹分析检测到大鼠脑、睾丸、肾上腺和胸腺中2个转录物的弱表达。 PCR 分析显示大鼠 Ragb 普遍表达,但仅在大脑中表达长变体。 PCR 分析检测到了人类 RAGB 的两种变体。
▼ 基因功能
舒尔曼等人(1995) 发现重组 Ragb 结合不可水解的 GTP 类似物,但它缺乏内在的 GTP 酶活性。 虽然 Ragb(l) 不结合 GTP,但删除 Ragb(l) 中的 84-bp 插入片段允许 GTP 结合。
多蛋白 mTORC1 蛋白激酶复合物(参见 601231)是响应胰岛素、能量水平和氨基酸而促进生长的通路的核心组成部分,并且在常见癌症中失调。 桑卡克等人(2008) 发现 Rag 蛋白是 4 个相关小鸟苷三磷酸酶(GTPase) 家族(RAGA、RAGB、RAGC(608267) 和 RAGD(608268))以氨基酸敏感的方式与 mTORC1 相互作用,并且是氨基酸激活 mTORC1 途径所必需的。 与三磷酸鸟苷组成型结合的 Rag 突变体与 mTORC1 强烈相互作用,其在细胞内的表达使 mTORC1 途径对氨基酸剥夺具有抵抗力。 相反,鸟苷二磷酸结合的 Rag 突变体的表达阻止了氨基酸对 mTORC1 的刺激。 桑卡克等人(2008) 得出的结论是,Rag 蛋白不会直接刺激 mTORC1 的激酶活性,而是像氨基酸一样,促进 mTOR 细胞内定位到也包含其激活剂 RHEB 的隔室(601293)。
巴-佩莱德等人(2013) 确定八聚体 GATOR(针对 RAG 的 GTP 酶激活蛋白(GAP) 活性)复合物是向 mTORC1 发出氨基酸充足信号的途径的关键调节因子。 GATOR 由 2 个子复合体 GATOR1 和 GATOR2 组成。 抑制 GATOR1 亚基 DEPDC5(614191)、NPRL2(607072) 和 NPRL3(600928) 使 mTORC1 信号传导对氨基酸剥夺具有抵抗力。 相反,抑制 GATOR2 亚基 MIOS(615359)、WDR24(620307)、WDR59(617418)、SEH1L(609263) 和 SEC13(600152) 可抑制 mTORC1 信号传导,并且上位性分析表明 GATOR2 负向调节 DEPDC5。 GATOR1对RAGA和RAGB具有GAP活性,其成分在人类癌症中发生突变。 在 GATOR1 失活突变的癌细胞中,mTORC1 过度活跃并且对氨基酸饥饿不敏感,并且此类细胞对雷帕霉素(一种 mTORC1 抑制剂)过敏。 因此,Bar-Peled 等人(2013) 得出的结论是,他们已经确定了 RAG GTPases 的一个关键负调节因子,并揭示了与其他 mTORC1 调节因子一样,RAG 功能在癌症中可能会失调。
Jewell 等人使用敲低 HEK293 细胞和敲除小鼠胚胎成纤维细胞(2015) 发现亮氨酸激活溶酶体 mTORC1 需要功能性 RAGA 和 RAGB。 相比之下,谷氨酰胺激活溶酶体 mTORC1 需要 ARF1(103180)。
▼ 测绘
Hartz(2015) 根据 RRAGB 序列(GenBank AL831926) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 RRAGB 基因对应到染色体 Xp11.21。