前 mRNA 加工因子 6； PRPF6

前体 mRNA 处理因子 6，酿酒酵母，同源物；PRP6
雄激素受体 N 末端结构域反式激活蛋白 1；ANT1
TOM
SNRNP102
20 号染色体开放解读码组 14；C20ORF14

HGNC 批准的基因符号：PRPF6

细胞遗传学位置：20q13.33 基因组坐标（GRCh38）：20:63,981,131-64,033,099（来自 NCBI）

▼ 克隆与表达

Nishikimi 等人通过对从 HeLa 细胞核纯化的 100 kD 蛋白质中的肽进行测序，然后进行 EST 数据库分析和 HeLa 细胞总 RNA 的 RT-PCR（1999）克隆了PRPF6。推导的 941 个氨基酸的蛋白质的计算分子量为 106.9 kD。它包含 19 个四三肽重复（TPR）基序和一个亮氨酸拉链基序。免疫荧光分析证实了该蛋白质的核定位。

马卡洛夫等人孤立地（2000）和尤里耶夫等人（2000）克隆了PRPF6。而马卡洛夫等人（2000）报道了与 Nishikimi 等人相同的 PRPF6 蛋白质结构（1999），尤里耶夫等人（2000）预测该 941 个氨基酸的蛋白质包含一个 N 末端膜锚定区，随后是一个高度带电的近膜结构域和 22 个 TPR 基序。尤里耶夫等人（2000）将 PRF6 称为 TOM，因为它与酿酒酵母和粗糙链球菌的线粒体外膜输入受体（参见 606081）相似。

使用雄激素受体（AR; 313700）的配体孤立激活功能 1（AF-1）结构域作为诱饵，对人皮肤成纤维细胞 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选，Zhao 等人（2002）克隆了 PRPF6，他们将其命名为 ANT1。他们在 ANT1 中鉴定出 19 个 TPR 重复序列、2 个 LxxLL 基序和一个亮氨酸拉链基序。人体组织的 Northern 印迹分析检测到 4.0-kb ANT1 转录物的普遍表达。荧光标记的 ANT1 聚集在剪接因子焦点特征的核斑点中，并在整个细胞核中呈精细网状分布。AR 与 ANT1 共定位于弥散分布的区域，但不在核斑点中。

▼ 基因结构

塔纳科维奇等人（2011）指出 PRPF6 基因包含 21 个外显子。

▼ 测绘

Hartz（2011）根据 PRPF6 序列（GenBank AB019219）与基因组序列（GRCh37）的比对，将 PRPF6 基因对应到染色体 20q13.33。

▼ 基因功能

前 mRNA 剪接体组装中的一个重要步骤是小核核糖核蛋白颗粒（snRNP） U4/U6（参见 180692）和 U5（参见 180691）之间的相互作用，形成 U4/U6.U5 tri-snRNP。马卡洛夫等人（2000）发现人 PRP6 与纯化的 20S U5 snRNP 紧密相关。结合研究表明，PRP6 直接与 U5 snRNP 中的 40-kD（SNRNP40; 607797）/116-kD（EFTUD2; 603892）/220-kD（PRPF8; 607300）蛋白质复合物相互作用。PRP6 还与纯化的 13S U4/U6 snRNP 相互作用。马卡洛夫等人（2000）表明 PRP6 可能充当 U5 和 U4/U6 snRNP 之间的桥接因子。

赵等人使用蛋白质下拉测定和免疫共沉淀实验（2002）表明人 ANT1 以不依赖配体的方式与全长 AR 和 AR AF-1 结构域相互作用，但不与配体依赖性 AR AF-2 结构域相互作用。在 Pull-down 测定中，ANT1 还与糖皮质激素受体（GCCR；138040）相互作用，但不与雌激素受体（ER；参见 133430）相互作用。ANT1 增强 AR 和 GCCR 介导的反式激活活性，但不增强 ER 介导的反式激活活性。ANT1 还对细胞周期蛋白 E（CCNE1; 123837）和 SRC1（NCOA1; 602691）的反式激活功能表现出孤立的累加效应。

通过突变分析，Fan 等人（2006）鉴定了 ANT1 蛋白中的 4 个功能域：N 端核定位信号（NLS）；受体特异性反式激活结构域，很大程度上与 NLS 重叠；核内散斑定位域；AR AF-1 结构域结合结构域位于 TPR 基序 4 至 7 之间。无法定位到核斑点的 ANT1 突变体保留了针对 AR AF-1 的几乎全部反式激活能力。

▼ 分子遗传学

塔纳科维奇等人（2011）在来自分离常染色体显性视网膜色素变性（RP60;613983）的家族的188个先证者中筛选了候选基因PRPF6的所有21个外显子，并鉴定了2个兄弟中高度保守残基的错义突变的杂合性（613979.0001）。作者指出，这是涉及常染色体显性 RP 的第六个剪接因子基因。

▼ 等位基因变异体（1 个选定示例）：

.0001 色素性视网膜炎 60
PRPF6、ARG729TRP

Tanackovic 等人在来自欧洲血统 4 代家庭的 2 名受影响兄弟中分离出常染色体显性遗传性视网膜色素变性（RP60; 613983）（2011）鉴定了 PRPF6 基因外显子 16 中 2185C-T 转变的杂合性，导致高度保守残基处的 arg729 到 trp（R729W）取代。在 1,078 条种族匹配的对照染色体中未发现该突变。来自受影响同胞的永生化淋巴母细胞显示内源性 PRPF6 在细胞核内的异常定位，其中卡哈尔体中蛋白质的积累表明 tri-snRNP 组装或再循环可能受到损害。对 2 个同胞细胞中内源转录物的分析揭示了带有特定剪接信号的前 mRNA 的内含子保留。