BCL6 核心抑制子样 1; BCORL1
HGNC 批准的基因符号:BCORL1
细胞遗传学位置:Xq26.1 基因组坐标(GRCh38):X:129,980,284-130,058,080(来自 NCBI)
▼ 说明
BCORL1 基因编码与 II 类组蛋白乙酰转移酶和脱乙酰酶相互作用的转录辅阻遏物(Schuurs-Hoeijmakers 等人总结,2013)。
▼ 克隆与表达
Pagan 等人使用全长 BRCA1(113705) 作为诱饵,对睾丸 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选(2007) 鉴定了一种新的部分 cDNA,他们将其命名为 BCORL1。他们组装了全长 BCORL1 cDNA 和更长的剪接变体,命名为 BCORL1a,分别编码推导的 1,711 个和 1,785 个氨基酸的蛋白质。BCORL1 包含假定的二分核定位信号、串联锚蛋白重复序列和经典的 CTBP(参见 602618)结合基序 PXDLS。BCORL1 与 BCOR 蛋白(300485) 具有同源性,BCOR 蛋白是 BCL6(109565) 转录阻遏蛋白的转录辅阻遏蛋白。人类和小鼠 BCORL1 蛋白大约 80% 相同。人体组织的 Northern blot 分析检测到 BCORL1 在睾丸和前列腺中表达最高,在淋巴细胞和脾脏中表达中等,以及在许多其他组织中的低表达。针对该蛋白质产生的抗体显示出大约 200 kD 的条带,与较短的亚型一致。BCORL1-GFP 融合蛋白在细胞核中表现出独特的定位。
▼ 基因结构
帕甘等人(2007) 确定 BCORL1 基因包含 13 个外显子(或 14 个,取决于可变剪接),跨度约为 75 kb。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Pagan 等人(2007) 将 BCORL1 基因定位到染色体 Xq25-q26.1。
▼ 基因功能
帕甘等人(2007) 证明 BCORL1 在与 DNA 结合时可以充当辅阻遏物。BCORL1 与 II 类组蛋白脱乙酰酶(HDAC4,605314;HDAC5,605315;HDAC7,606542)相互作用,表明它们参与其作为辅阻遏物的功能。BCORL1 通过 PXDLS 基序与 CTBP 辅阻遏物相互作用,并影响 CTBP 靶点 E-钙粘蛋白(192090) 的抑制。BCORL1 不与 BCL6 相互作用。
Junco 等人使用细菌 2 杂交系统(2013) 发现 PCGF1(610231) 和 PCGF3(617543) 的 C 端泛素样折叠结构域与 BCOR(300485) 和 BCORL1 的 C 端结构域相互作用。
▼ 分子遗传学
Schuurs-Hoeijmakers 等人的 2 名荷兰兄弟患有 Shukla-Vernon 综合征(SHUVER; 301029),他们的父母无关(2013) 在 BCORL1 基因中发现了一个半合子错义突变(N820S; 300688.0001)。该变异是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,是遗传自未受影响的母亲。Schuurs-Hoeijmakers 等人(2013) 指出 BCORL1 基因在大脑或神经元组织中表达。没有对该变体进行功能研究。该家庭是 19 个接受外显子组测序的智力障碍非近亲家庭之一。
Shukla 等人在来自 3 个患有 SHUVER 家庭的 5 名男孩中(2019) 发现了 BCORL1 基因(300688.0002-300688.0004) 中的半合子错义突变。这些突变是通过全外显子组测序发现的,遗传自未受影响或有轻微症状(例如学习障碍)的母亲。没有进行变异的功能研究和患者细胞的研究。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):
.0001 舒克拉-弗农综合征
BCORL1,ASN820SER
在 2 名荷兰兄弟(W07-1601 家族)中,父母无关,患有 Shukla-Vernon 综合征(SHUVER; 301029),Schuurs-Hoeijmakers 等人(2013) 在 BCORL1 基因中鉴定出半合子 c.2459A-G 转换(c.2459A-G,NM_021946.4),导致高度保守残基处的 asn820 到 Ser(N820S)取代。该变异是通过外显子组测序发现并经桑格测序证实的,是遗传自未受影响的母亲。该突变存在于不到 1% 的 dbSNP(版本 134)样本中,以及不到 1% 的 672 个内部外显子组中。Schuurs-Hoeijmakers 等人(2013) 指出 BCORL1 基因在大脑或神经元组织中表达。没有对该变体进行功能研究。患者面部特征粗糙,肌张力低下。
.0002 舒克拉-弗农综合征
BCORL1,VAL782GLU
Shukla 等人对一名患有 Shukla-Vernon 综合征(SHUVER; 301029) 的 15 岁男孩(患者 1)进行了研究(2019) 在 BCORL1 基因中发现了一个半合子 c.2345T-A 颠换(c.2345T-A, NM_021946.4),导致假定的 DNAse 超敏区域中的保守残基发生 val782-to-glu(V782E) 取代。该突变是通过全外显子组测序发现的,遗传自患有学习障碍、焦虑症和多动症的母亲。在 gnomAD 数据库中,在 1 名半合子个体中发现了该变异。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
.0003 舒克拉-弗农综合征
BCORL1,SER496PHE
Shukla 等人对一名患有 Shukla-Vernon 综合征(SHUVER; 301029) 的 7 岁男孩(患者 2)进行了研究(2019) 在 BCORL1 基因中发现了一个半合子 c.1487C-T 转换(c.1487C-T, NM_021946.4),导致高度保守的残基处出现 ser496 到 phe(S496F) 的取代。通过全外显子组测序发现的这种突变遗传自患有慢性疼痛和关节过度活动的母亲。在 gnomAD 数据库中未找到该变体。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。
.0004 舒克拉-弗农综合征
BCORL1,PRO32LEU
Shukla 等人在 3 名同胞(家庭 3)中,出生于无血缘关系的印度父母,患有 Shukla-Vernon 综合征(SHUVER; 301029)(2019) 在 BCORL1 基因中发现了一个半合子 c.95C-T 转换(c.95C-T, NM_021946.4),导致在假定的 DNAse 超敏区域中的高度保守残基处发生 pro32 到 leu(P32L) 的取代。该突变是通过全外显子组测序发现并经桑格测序证实的,是从母亲那里遗传的。在 gnomAD 数据库中未找到该变体。没有进行变体的功能研究和患者细胞的研究。