APOBEC1 补充因子； A1CF

ACF
APOBEC1 刺激蛋白； ASP

HGNC 批准的基因符号：A1CF

细胞遗传学位置：10q11.23 基因组坐标（GRCh38）：10:50,799,408-50,885,665（来自 NCBI）

▼ 说明

A1CF 是催化蛋白 APOBEC1（600130）所需的一种 RNA 结合蛋白，用于载脂蛋白 B（APOB; 107730）转录物的 C 到 U 编辑（Mehta 等人，2000）。

▼ 克隆与表达

Mehta 等人通过数据库分析和人类 cDNA 阵列筛选（2000）克隆了 A1CF，他们将其称为 ACF。推导的 586 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 64.2 kD。 ACF 的 N 末端区域包含 3 个不相同的 RNA 识别基序（RRM）。 ACF 的 C 末端区域包含一簇 6 个 RG 二肽。 Northern 印迹分析在人类肝脏、肾脏和胰腺中检测到 9.5 和 2.2 kb 的 ACF 转录本。 PCR分析表明ACF在大多数人体组织中都有不同程度的表达。

莱勒克等人（2000）从大鼠肝细胞核中纯化了 A1cf，他们将其称为 Asp，作为 Apobec1 刺激蛋白。他们使用 PCR 从人类肝脏 cDNA 文库和人类小肠 cDNA 池中克隆了 2 个 ASP 剪接变体。与肝脏来源的 cDNA 相比，肠来源的 cDNA 缺少 24 个核苷酸。预测的蛋白质含有 586 和 594 个氨基酸，计算分子量分别为 64.3 和 65.2 kD。 ASP 包含 3 个 N 端 RNA 结合结构域（RBD）和一个假定的 C 端双链 RBD，以及一个假定的 N 端核定位信号和 2 个假定的酪氨酸磷酸化位点。 Northern blot 分析在人类肝脏和肾脏中检测到约 2.0 和 8.0 kb 的 ASP 转录本。

通过对人类肝脏、小肠和肾脏的基因组序列分析和 PCR，Henderson 等人（2001）鉴定了多种 ACF 剪接变体，包括 Lellek 等人报道的变体（2000）在外显子 12 中包含或缺乏 24 个核苷酸。这些变体显示出组织特异性表达。

▼ 基因结构

亨德森等人（2001）确定 A1CF 基因跨度约为 80 kb，包含 15 个外显子。外显子 1 至 3 是非编码的。外显子 1 的上游区域包含一个假定的 TATA 框和多个转录因子结合位点。

▼ 测绘

通过数据库分析，Henderson 等人（2001）将 A1CF 基因定位到染色体 10q，位于标记 D10S604 和 D10S220 之间。

舞蹈等人（2002）报道 A1CF 基因定位于染色体 10q11.21。

▼ 基因功能

Mehta 等人使用重组蛋白进行紫外线交联和免疫沉淀实验（2000）表明人 ACF 与 APOBEC1 相互作用，结合 APOB mRNA，并补充 APOBEC1 以进行 APOB 的特定 C 到 U 编辑。 APOBEC1 和 ACF 对 APOB mRNA 的编辑依赖于编辑位点下游的 11 核苷酸锚定序列。在大鼠肝脏提取物中，仅通过免疫耗竭 Acf 即可消除外源 APOB 的编辑，但可以通过添加 Acf 和 Apobec1 来恢复。体内分析证实了体外结果，因为 Acf 和 Apob mRNA 在大鼠肝癌细胞系的核提取物中相互作用。

通过重组蛋白分析，Lellek 等人（2000）表明 ASP 和 APOBEC1 在体外有效地重建 APOB mRNA 编辑。在大鼠肝脏中，Asp 还与 Ksrp（603445）相关，但单独重组 KSRP 无法刺激 APOBEC1 编辑 APOB mRNA。作者认为 KSRP 可能赋予编辑酶复合物稳定性。

通过体外分析，Henderson 等人（2001）发现大约 10% 到 25% 的人类 ACF 香料变体编码非功能性蛋白质。对人类结肠癌衍生细胞系以及胎儿和成人小肠的 mRNA 的检查表明，观察到的 APOB mRNA 编辑发育增加不太可能是由 ACF 转录增加引起的。

舞蹈等人（2002）表明，包含或缺乏外显子 12 中 24 个核苷酸的 ACF 变体的产物同时在肝细胞和肠细胞中表达，并支持同等水平的 APOB mRNA 编辑。

▼ 动物模型

布兰克等人（2005）发现杂合性敲除 Acf 的小鼠健康且具有生育能力，但它们的内源性 Apob RNA 编辑活性出现组织特异性增加。小鼠中 Acf 的纯合缺失导致胚胎死亡，可能是由于囊胚生长的发育缺陷导致植入前失败。为了支持这些发现，表达 Apobec1 的大鼠肝癌细胞和原代鼠肝细胞以及不表达 APOBEC1 的人 HepG2 肝癌细胞中的 Acf 敲低导致细胞凋亡。作者得出结论，ACF 在细胞存活中发挥着孤立于 APOBEC1 的作用，特别是在早期胚胎发育过程中。