琥珀酸脱氢酶复合物组装因子 1; SDHAF1
HGNC 批准的基因符号:SDHAF1
细胞遗传学位置:19q13.12 基因组坐标(GRCh38):19:35,995,187-35,996,311(来自 NCBI)
▼ 说明
琥珀酸脱氢酶(SDH) 复合体,或线粒体呼吸链的复合体 II,由 4 个单独的亚基组成(参见 SDHA,600857)。SDHAF1 对于 SDH 组装至关重要,但在体内并不与复合物发生物理关联(Ghezzi et al., 2009)。
▼ 克隆与表达
Ghezzi 等人使用基因组 DNA 的 PCR 技术(2009)克隆了全长SDHAF1。推导的 115 个氨基酸蛋白具有 N 端线粒体靶向序列和参与 Fe-S 代谢的蛋白质特征的 LYR 基序。Northern 印迹分析在所有检查的组织中均检测到 SDHAF1。表位标记的 SDHAF1 定位于转染的 COS-7 和 HeLa 细胞中的线粒体。蛋白质印迹分析和亚细胞分级分离表明 SDHAF1 驻留在线粒体基质中,并且线粒体靶向信号在导入线粒体后不会被去除。
▼ 基因结构
盖齐等人(2009) 确定 SDHAF1 基因包含单个外显子。
▼ 测绘
通过连锁和基因组序列分析,Ghezzi 等人(2009) 将 SDHAF1 基因定位到染色体 19q12-q13.2。
▼ 分子遗传学
Ghezzi 等人在患有线粒体复合物 II 缺陷 2 型(MC2DN2; 619166) 的意大利和土耳其家庭的受影响成员中(2009) 鉴定了 SDHAF1 基因中的不同纯合突变(分别为 G57R, 612848.0001 和 R55P, 612848.0002)。
Ohlenbusch 等人在 5 名 MC2DN2 患者中(2012) 鉴定出 SDHAF1 基因中的纯合突变:Ghezzi 等人报道的土耳其大家族的另外 2 名成员中存在 G57R 突变(2009);Brockmann 等人之前报道过一名挪威男孩的 Q8X(612848.0003)(2002);和巴勒斯坦姐妹的G57E(612848.0004)。
▼ 等位基因变异体(4 个选定示例):
.0001 线粒体复合物 II 缺陷,核 2 型
SDHAF1,GLY57ARG
Ghezzi 等人在患有线粒体复合物 II 缺陷核型 2(MC2DN2; 619166) 的意大利家庭的受影响成员中(2009) 鉴定了 SDHAF1 基因中的纯合 c.169G-C 颠换,导致 gly57 到 arg(G57R) 的取代。在 660 名欧洲或 150 名土耳其对照者中未发现该突变。对患者细胞的生化研究表明 SDH 残留活性为 20% 至 30%。G57R 突变成纤维细胞系中野生型 SDHAF1 的表达导致 SDH 恢复。Bugiani 等人此前曾报道过这个家庭(2006)。
.0002 线粒体复合物 II 缺陷,核 2 型
SDHAF1,ARG55PRO
在患有线粒体复合物 II 缺陷核型 2(MC2DN2; 619166) 的土耳其近亲家庭的受影响成员中,Ghezzi 等人(2009) 鉴定出 SDHAF1 基因中的纯合 c.164G-C 颠换,导致 arg55 到 pro(R55P) 取代。在 660 名欧洲或 150 名土耳其对照者中未发现该突变。布罗克曼等人此前曾报道过这个家庭(2002)。
奥伦布什等人(2012) 鉴定了 2 名土耳其血统的德国姐妹(患者 1 和 2,A 族)患有 MC2DN2 和纯合 R55P 突变,她们属于 Ghezzi 等人报道的大谱系的一部分(2009)。父母是近亲和杂合的突变。这对同胞分别在 18 个月和 11 岁时死亡,他们患有白质脑病、脑部 MR 波谱上的琥珀酸峰升高,并且成纤维细胞中呼吸复合物 II 活性降低。18 个月时死亡的同胞的肌肉中呼吸复合物 II 活性也降低。
.0003 线粒体复合物 II 缺陷,核 2 型
SDHAF1,GLN8TER
Ohlenbusch 等人在一名患有线粒体复合物 II 缺陷核型 2(MC2DN2; 619166) 的 16 岁挪威男孩(患者 3,B 族)中进行了研究(2012) 在 SDHAF1 基因中鉴定出纯合 c.22C-T 转换(GenBank NC_000019.9),导致 gln8 到 ter(G8X) 替换。该突变与家庭中的疾病分离。Brockmann 等人之前曾报道过该患者(2002)。
.0004 线粒体复合物 II 缺陷,核 2 型
SDHAF1,GLY57GLU
Ohlenbusch 等人在 2 名姐妹中(患者 4 和 5,家庭 C)为巴勒斯坦近亲父母所生,患有线粒体复合物 II 缺陷核型 2(MC2DN2;619166)(2012) 在 SDHAF1 基因中鉴定出纯合的 c.170G-A 转换(GenBank NC_000019.9),导致高度保守的残基处发生 gly57-to-glu(G57E) 取代。