SCY1 样蛋白 3; SCYL3
- SCY1,酿酒酵母,同源物,3
- 与 Ezrin C 端结构域相关的蛋白质; PACE1
HGNC 批准的基因符号:SCYL3
细胞遗传学位置:1q24.2 基因组坐标(GRCh38):1:169,849,630-169,894,266(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Sullivan 等人使用 ezrin(VIL2; 123900) 作为诱饵,对肾脏 cDNA 文库进行酵母 2 杂交筛选,然后进行文库筛选以及 5-prime 和 3-prime RACE(2003)克隆了全长PACE1。 推导的 688 个氨基酸的蛋白质包含一个 N 端肉豆蔻酰化共有序列,随后是一个蛋白激酶结构域、2 个由反平行 α 螺旋对组成的串联排列的 HEAT 基序,以及一个 C 端埃兹蛋白结合结构域。 他们还鉴定出编码推导的 742 个氨基酸的蛋白质的剪接变体,该蛋白质在 HEAT 重复序列和埃兹蛋白结合域之间含有额外的 54 个氨基酸。 EST数据库分析表明PACE1在乳腺癌细胞和成人结肠中表达。 内源性和转染的 PACE1 的免疫荧光染色和共聚焦显微镜检测到 2 个不同的细胞区室、片状伪足和高尔基体的细胞质面中有精细的点状细胞质染色和富集。 在板状伪足中,转染的 PACE1 与内源性和转染的埃兹蛋白共定位。 PACE1 与高尔基体标记的共定位需要 N 末端肉豆蔻酰化信号。
▼ 基因功能
通过酵母 2-杂交分析,Sullivan 等人(2003) 确定 PACE1 的 C 末端结构域与埃兹蛋白的 C 末端 α 螺旋结构域相互作用。 生化分析表明 PACE1 具有相关的而非内在的蛋白激酶活性。
▼ 基因结构
沙利文等人(2003)确定PACE1基因包含14个外显子。
▼ 测绘
通过基因组序列分析,Sullivan 等人(2003) 将 PACE1 基因定位到染色体 1q23.3-q23.4。