泛素特异性蛋白酶 45; USP45

HGNC 批准的基因符号:USP45

细胞遗传学位置:6q16.2 基因组坐标(GRCh38):6:99,432,324-99,515,769(来自 NCBI)

▼ 说明

USP45 通过调节异二聚体 XPF(ERCC4; 133520)-ERCC1 DNA 修复核酸内切酶 ERCC1 亚基(126380) 的泛素化来控制细胞 DNA 损伤反应(Perez-Oliva et al., 2015)。

▼ 克隆与表达

Quesada 等人通过在数据库中搜索与 USP 家族成员相似的序列,然后进行 PCR 分析(2004)克隆了人类USP45。预测的蛋白质具有 N 末端锌指泛素结合(ZNF-UBP) 结构域,随后是包含 cys 框、QQD 框和 USP 酶特征的 his 框的催化结构域。Northern 印迹分析检测到 5.0 kb USP45 转录物在人体组织中广泛表达,其中在卵巢、脾脏和骨骼肌中表达最高。

佩雷斯-奥利瓦等人(2015) 报道称,814 个氨基酸的人 USP45 蛋白包含一个 N 末端 ZNF-UBP 结构域,后面是一个肽酶结构域。

易等人(2019) 分析了人眼组织中的 USP45 mRNA 表达,观察到视神经、巩膜和视网膜中的水平较高,而脉络膜、晶状体和视网膜色素上皮(RPE) 中的水平相对较低。他们发现小鼠出生后视网膜发育过程中Usp45的表达逐渐减少,这表明USP45可能在视网膜的早期发育中发挥作用。在人视网膜中,免疫染色显示USP45主要定位于视锥细胞内段,并在较小程度上定位于视杆细胞内段和RPE,在周边视网膜的内核层中观察到弱染色。在斑马鱼眼睛中,usp45主要存在于感光细胞的内节,与人类视网膜中的分布相似。

▼ 测绘

Gross(2019) 根据 USP45 序列(GenBank BC150648) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 USP45 基因对应到染色体 6q16.2。

▼ 基因功能

克萨达等人(2004) 表明重组人 USP45 可以从测试蛋白中去除泛素。

通过免疫共沉淀和酵母 2 杂交分析,Perez-Oliva 等人(2015)发现人USP45的N端61个氨基酸与ERCC1相互作用。USP45 在体外和体内均使 ERCC1 去泛素化,并且 ERCC1 去泛素化需要 USP45 与 ERCC1 的关联。USP45 促进暴露于 DNA 损伤剂的 U2OS 骨肉瘤细胞的存活,并诱导由 ERCC1-XPF 核酸内切酶控制的 DNA 损伤反应。USP45 不是通过稳定 ERCC1 表达来发挥作用,而是通过调节 ERCC1 向 DNA 损伤位点的募集来发挥作用。USP45 定位于 DNA 损伤剂和受控修复引起的 DNA 损伤。活细胞荧光分析表明,USP45 募集到损伤位点是快速、短暂的,且不依赖于 ERCC1-XPF。

Yi 等人在 2 例患有 Leber 先天性黑蒙(LCA19;618513)的中国儿童中进行了研究(2019) 分别鉴定了 USP45 基因中影响剪接的错义突变(R312Q; 618439.0001) 和无义突变(K546X; 618439.0002) 的纯合性。

▼ 动物模型

易等人(2019) 研究了用反义吗啉代(MO) 寡核苷酸处理的斑马鱼幼虫,该寡核苷酸靶向 usp45 内含子 9 和外显子 10 之间的受体剪接位点,该位置与人 USP45(618439.0001) 中的 c.935G-A 突变相似。受精后 72 小时,96.25% 的 MO 处理斑马鱼幼虫的眼睛尺寸有所减小,而对照组的这一比例仅为 16.25%,并且 87.84% 的 morphant 鱼通过注射野生型 usp45 mRNA 获救。此外,免疫染色显示,与对照组相比,受精后 5 天,MO 处理的斑马鱼幼虫中的绿色视锥细胞明显减少。作者得出结论,usp45 在光感受器发育中发挥着重要作用。易等人(2019) 还观察到,与野生型小鼠相比,Usp45 敲除纯合小鼠的暗视和明视视网膜电图反应严重降低。与斑马鱼的结果类似,免疫染色显示 20 周时 Usp45 -/- 小鼠的绿色视锥细胞明显少于野生型小鼠。

▼ 等位基因变异体(2 个选定示例):

.0001 LEBER 先天性黑蒙 19(1 名患者)
USP45,ARG312GLN

在一名患有 Leber 先天性黑蒙(LCA19; 618513) 的 9 岁中国男孩(家庭 1)中,Yi 等人(2019) 鉴定了 USP45 基因中 c.935G-A 转变(c.935G-A, NM_00108048.1) 的纯合性,导致 arg312 到 gln(R312Q) 取代,预计会影响剪接。他未受影响的父母是该变异的杂合子,而在 3,011 名患有其他遗传性眼病的内部先证者中未发现该变异。作者指出,该突变很罕见,ExAC 数据库中的总体等位基因频率为 0.00008863,并表示此前尚未报道过该位点的纯合突变。

.0002 意义不明的变体
USP45,LYS456TER

根据 Hamosh(2019) 对 gnomAD 数据库的审查,该变体被归类为意义不明的变体。

在一名患有 Leber 先天性黑蒙(见 618513)的 3 个月大的中国女孩(家庭 2)中,Yi 等人(2019) 鉴定了 USP45 基因外显子 14 中 c.1636A-T 颠换(c.1636A-T, NM_00108048.1) 的纯合性,导致 lys546 至 ter(K546X) 取代。她未受影响的父母是该变异的杂合子,而在 3,011 名患有其他遗传性眼病的内部先证者中未发现该变异。作者指出,c.1636A-T 变体很罕见,在 ExAC 数据库中总体等位基因频率为 0.0005;然而,Hamosh(2019) 发现 GnomAD 数据库中 282,556 个等位基因中的 137 个等位基因和 2 个纯合子中存在 K546X 突变(2019 年 7 月 24 日)。