真核翻译起始因子 4B; EIF4B
HGNC 批准的基因符号:EIF4B
细胞遗传学位置:12q13.13 基因组坐标(GRCh38):12:53,006,455-53,042,214(来自 NCBI)
▼ 说明
真核翻译起始因子 4B(eIF4B) 促进 mRNA 与 43S 起始复合物结合,该复合物由与 eIF2、GTP 和 Met-tRNA 三元复合物结合的 40S 核糖体亚基组成,由 eIF3 稳定(参见第 66 页;603915)。 eIF4F 是一种异源三聚体蛋白,与 mRNA 帽结构结合,并与 eIF4B 结合,被认为可以解开 mRNA 5 引物非翻译区的二级结构,以促进核糖体结合。 除了其 RNA 结合活性外,eIF4B 还可刺激 eIF4A(602641)(eIF4F 的一个组成部分)的 ATP 酶和 RNA 解旋酶活性(Methot 等人(1996))。
▼ 克隆与表达
Milburn等人通过基于HeLa细胞eIF4B的部分蛋白序列,用简并寡核苷酸探针筛选胎儿肝脏文库(1990)分离出编码人eIF4B的部分cDNA。 他们使用部分 cDNA 筛选骨肉瘤文库,并回收了对应于 2 个不同转录物的额外 cDNA,这些转录物具有相同的编码区,但 3 引物末端长度不同。 Northern 印迹分析显示,eIF4B 在人类细胞系中表达为 4.4-和 2.3-kb mRNA。 米尔本等人(1990) 确定这 2 种 mRNA 的不同之处在于交替利用多腺苷酸化信号。 预测的 611 个氨基酸的 eIF4B 蛋白在 N 末端附近包含一个共有 RNA 结合位点(RNP-CS),一个富含天冬氨酸、精氨酸、酪氨酸和甘氨酸(富含 DRYG)的中心结构域,以及一个含有大量极性残基的 C 末端区域。 作者认为,高极性 DRYG 区域可能是 SDS-PAGE 检测到的 eIF4B 异常迁移的原因:该因子的预测分子量为 70 kD,但表观分子量为 80 kD。 哺乳动物细胞中 eIF4B 的过度表达会抑制翻译。 Southern blot分析表明人类基因组中存在多个eIF4B基因或假基因。
▼ 基因功能
方法等人(1994) 确定 RNA 识别基序(RRM)/RNP-CS 和 C 端 RNA 结合区对于 eIF4B 功能至关重要。 方法等人(1996) 证明 eIF4B 的 DRYG 结构域介导自我关联以及与 eIF3 的 p170(602039) 亚基的相互作用。 他们提出,eIF4B 通过结合 mRNA 和 18S 核糖体 RNA,充当 mRNA 和 40S 核糖体亚基之间的桥梁。 eIF4B 和 eIF3 之间的直接相互作用(在 mRNA 结合之前存在于 43S 起始复合物上)提供了 mRNA 和核糖体之间的额外连接。
Garcia-Garcia 等人使用单分子测定法(2015) 发现,当 eiF4A 与 2 个辅助蛋白 eIF4G(600495) 和 eIf4B 复合时,可发挥三磷酸腺苷依赖性持续性解旋酶的作用。 无论辅助因子组合如何,易位均以 11 +/- 2 个碱基对的离散步骤发生。 加西亚-加西亚等人(2015) 得出的结论是,他们的发现支持翻译起始的无记忆逐步机制,并表明 DEAD框 解旋酶家族的其他成员可能也具有类似的因子依赖性持续过程。