LSM6 蛋白; LSM6

HGNC 批准的基因符号：LSM6

细胞遗传学位置：4q31.22 基因组坐标（GRCh38）：4:146,175,702-146,204,435（来自 NCBI）

▼ 说明

基于与 Sm 蛋白家族的序列同源性，在多种生物体中鉴定出 Sm 样蛋白（参见 SNRPD2；601061）。Sm 样蛋白含有 Sm 序列基序，该基序由 2 个区域组成，该区域由折叠为环的可变长度接头分隔开。Sm 样蛋白被认为形成存在于 tri-snRNP 颗粒中的稳定异聚体，这对于前 mRNA 剪接很重要。

▼ 克隆与表达

在寻找人类 Sm 样蛋白时，Achsel 等人（1999） 分离了纯化的（U4/U6.U5） tri-snRNP 中存在的蛋白质，并分离了 7 个 Sm 样蛋白质，他们将其命名为 LSm2-LSm8。他们使用部分肽序列进行数据库搜索，对 EST 克隆进行了鉴定和测序。他们利用 HeLa cDNA 文库 PCR 扩增获得的额外序列，组装了 LSM2-LSM8 的全长 cDNA 序列。

萨尔加多-加里多等人（1999） 搜索了 Sm 蛋白的数据库序列，并鉴定了酵母中 16 个潜在的 Sm 相关基因以及人类和古细菌中的一些 Sm 相关基因。利用 Sm 结构域的多重序列比对，他们构建了酵母、人类和古细菌 Sm 和 Sm 样蛋白的系统发育树。

▼ 基因功能

Achsel 等人使用电子显微镜（1999） 观察到纯化的 LSm 蛋白形成异聚体，即使在没有 RNA 的情况下也稳定，并表现出与 Sm 核心 RNP 结构相似的甜甜圈形结构。他们证明纯化的 LSm 异聚体在 U6 snRNA 的 3 引物末端 U 束上特异性结合。他们还表明，LSm 蛋白在体外促进 U4/U6 RNA 双链体的形成，并得出结论，LSm 蛋白可能在 U4/U6 snRNP 形成中发挥作用。

Salgado-Garrido 等人使用免疫沉淀实验（1999） 得出结论，酵母中存在与 RNA 结合的 7 个 Sm 样蛋白的复合物。Lsm2-Lsm8 共沉淀 U4、U5 和 U6 snRNA，并直接与游离 U6 snRNP 中存在的 U6 snRNA 结合。此外，还发现酵母 Lsm2-Lsm7 蛋白与前 RNase P RNA 相关，但与成熟 RNase RNA 无关。Salgado-Garrido 等人利用人体细胞提取物的免疫沉淀实验（1999）表明LSM3和LSM4蛋白与含有U6 snRNA的snRNP复合物特异性相关。萨尔加多-加里多等人（1999） 得出结论，Sm 和 Sm 样蛋白在至少 2 个具有深层进化起源的功能保守复合体中组装。

Salgado-Garrido 等人通过破坏酵母中的 Sm 和 Sm 样基因（1999） 得出结论，编码与 U6 snRNA（Lsm2-8） 直接相关的 Sm 样蛋白的基因的破坏产生了可变的表型。Lsm2、Lsm3、Lsm4 和 Lsm8 对于营养生长至关重要。Lsm5、Lsm6 和 Lsm7 对于生长不是必需的；然而，它们的破坏导致生长缓慢，尤其是在高温下。在含有 Lsm5、Lsm6 和 Lsm7 破坏的菌株中，U6 snRNA 的水平大幅降低。Lsm1和Lsm9对于营养生长是可有可无的，但Lsm1对于30度的最佳营养生长是必需的，并且对温度敏感。

英格芬格等人（2002） 确定人类 LSM1 至 LSM7，但不表达 LSM8，在 HeLa 细胞的细胞质灶内表达。病灶还含有脱帽酶（DCP1/2） 和核酸外切酶 XRN1（607994）。野生型和突变型 LSM 蛋白的共表达以及荧光共振能量转移表明，LSM 蛋白形成了类似于酵母中发现的复合物。英格芬格等人（2002） 得出结论，焦点包含部分或完全组装的用于降解 mRNA 的机器。

Kittler 等人使用核糖核酸内切酶制备的短干扰 RNA（esiRNA） 文库（2004） 鉴定了细胞分裂所需的 37 个基因，其中之一是 LSM6。这 37 个基因包括几个剪接因子，敲低这些剪接因子会产生有丝分裂纺锤体缺陷。此外，还发现一种假定的核输出终止子可以在敲除后加速细胞增殖和有丝分裂进展。

▼ 测绘

国际辐射混合测绘联盟将 LSM6 基因定位到 4 号染色体（stSG50602）。