小泛素样修饰剂 4; SUMO4
HGNC 批准的基因符号:SUMO4
细胞遗传学位置:6q25.1 基因组坐标(GRCh38):6:149,400,261-149,401,277(来自 NCBI)
▼ 描述
SUMO 基因家族的成员编码小的泛素相关修饰物,这些修饰物标记蛋白质以调节亚细胞定位和/或增强蛋白质稳定性和活性。SUMO4 基因负向调节 NFKB(参见 164011)转录活性。
▼ 克隆和表达
Bohren 等人(2004) 和郭等人(2004) 鉴定了 MAP3K7IP2 基因(605101) 内含子 6 内的 SUMO 相关核苷酸序列。SUMO 相关 DNA 序列称为 SUMO4,编码 95 个氨基酸的蛋白质,与 SUMO2(603042) 蛋白质具有约 87% 的同一性。Bohren 等人通过对来自不同组织的 RNA 进行 RT-PCR 分析(2004)检测到SUMO4主要在成人和胚胎肾脏中表达。郭等人(2004)通过对免疫组织cDNA组的实时PCR分析表明,SUMO4在免疫组织中以不同水平表达,其中在淋巴结和脾中表达最高。
▼ 基因功能
郭等人(2004) 发现 SUMO4 与 IKBA(164008) 结合并负向调节 NF-kappa-B(参见 164011) 转录活性。
博伦等人(2004) 证明 SUMO4 利用 E2 酶 UBC9(601661) 进行苏酰化。Bohren 等人在用 SUMO4 表达载体瞬时转染的肝癌细胞中(2004) 证明,与 val55 相比,携带 met55 变体的 SUMO4 与激活的热休克因子转录因子水平升高相关,并且 NF-κ-B 的水平受到相同程度的抑制。作者证实了 HSF2(140581) 赖氨酸 82 处 DNA 结合域中的单个苏酰化位点。
▼ 基因结构
无内含子的SUMO4基因位于MAP3K7IP2基因(605101)的内含子6内(Bohren等,2004;Guo等,2004)。
▼ 测绘
由于SUMO4 基因包含在MAP3K7IP2 基因中,因此定位到6q25(Bohren 等,2004;Guo 等,2004)。
▼ 分子遗传学
Bohren 等人(2004) 和郭等人(2004) 鉴定了 SUMO4 基因的单核苷酸多态性(SNP),涉及进化上保守的残基(M55V; 608829.0001),该残基与 1 型糖尿病(T1D5; 600320) 易感性相关。
▼ 等位基因变异体(1 个选定示例):.
0001 1 型糖尿病 5
SUMO4、MET55VAL
Bohren 等人(2004) 和郭等人(2004) 鉴定了 SUMO4 基因中的 A 到 G 转变,导致关键 CUE 结构域的进化保守残基发生met55 到 val(M55V) 取代。两组均证明多态性与 1 型糖尿病易感性相关(IDDM5;600320)。
郭等人(2004) 观察到 M55V 取代导致 NF-kappa-B 转录活性增加 5.5 倍,并且 NF-kappa-B 依赖性基因 IL12B(161561) 的表达增加约 2 倍。研究结果表明,一条新途径可能与 1 型糖尿病的发病机制有关。
史密斯等人(2005) 和 Qu 等人(2005) 无法证实 1 型糖尿病与 M55V 突变之间的关联;另一方面,在韩国人群中,Park 等人(2005) 显示 1 型糖尿病患者(62%) 的 GG 和 AG 基因型频率高于对照组(52.1%),相对风险为 1.5(p 小于 0.003)。为了回复这些报告的结果,Wang 等人(2005)表明异质性可能是造成结果差异的原因。他们强调了功能证据的重要性,为易感基因在疾病发病机制中的作用提供支持,并指出了Guo等人的证据(2004) 提出了 55V 变体的 SUMO 化功能降低,这表明 1 型糖尿病患者的频率增加。王等人。