钙稳态内质网蛋白; CHERP

HGNC 批准的基因符号：CHERP

细胞遗传学位置：19p13.11 基因组坐标（GRCh38）：19:16,517,893-16,542,436（来自 NCBI）

▼ 说明

CHERP 是一种参与调节前 mRNA 选择性剪接的核蛋白（Lin-Moshier 等，2013；Sasaki-Osugi 等，2013）。

▼ 克隆与表达

拉普兰特等人（2000） 从人红白血病（HEL） 细胞表达库中克隆了 CHERP。 推导的 884 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 100 kD。 它包含 2 个跨膜结构域、一个聚谷氨酰胺束、一个富含丝氨酸/精氨酸（SR） 的结构域、几个假定的磷酸化位点和一个 C 端内质网（ER） 保留基序。 Northern 印迹分析在人脑、胎盘、肺、肝、肾、胰腺、心肌和骨骼肌以及培养的巨核细胞 HEL 和 Dami 细胞中检测到 4.2 kb CHERP 转录本。 在心肌和骨骼肌中也检测到了 6.4 kb 的转录物。 免疫定位显示 CHERP 分布在 HEL 细胞的整个细胞质区域。

通过生物信息学分析，Lin-Moshier 等人（2013） 确定人类 CHERP 包含一个 N 端 SURP/SWAP 结构域，随后是一个 RNA 聚合酶 II（POLR2A; 180660） C 端结构域（CTD） 相互作用结构域（CID）、一个富含 SR 的结构域和一个 C 端 G 补丁基序。 作者在 CHERP 中没有发现跨膜结构域的证据。 免疫荧光和活细胞成像表明人类 CHERP 定位于核斑点。

▼ 基因功能

拉普兰特等人（2000） 发现 CHERP 的敲除抑制细胞内 Ca（2+） 动员并减少 HEL 细胞的增殖。

通过截断分析，Lin-Moshier 等人（2013） 证明 CHERP 的 C 末端区域对于指导 CHERP 的核靶向是必要且充分的。 免疫沉淀和质谱分析表明 CHERP 与核蛋白相互作用，包括 SR140（U2SURP; 617849）。 CHERP 的敲低导致 HEK293 细胞中 SR140 表达水平降低。

通过免疫沉淀和活细胞成像分析，Sasaki-Osugi 等人（2013） 发现 ALG2（607905） 与 CHERP 相互作用，并以 Ca（2+） 依赖性方式在核斑点处短暂积累。 Western blot 分析表明 CHERP 富含 SR 的区域在其 Ser 残基处被组成型磷酸化。 删除分析显示 CHERP 的富含脯氨酸的区域（PRR） 包含多个 ALG2 结合位点，并参与与磷酸化 RNA 聚合酶 II 的相互作用。 RNA 免疫沉淀测定表明 CHERP 与 IP3R1（ITPR1; 147265） RNA 物理相关，并且 CHERP 或 ALG2 的敲低改变了 HT1080 细胞中 IP3R1 前 mRNA 的剪接模式。

▼ 测绘

拉普兰特等人（2000） 报道 CHERP 基因定位于染色体 19p13.1。