跨膜9超家族,成员2; TM9SF2
- p76
HGNC 批准的基因符号:TM9SF2
细胞遗传学位置:13q32.3 基因组坐标(GRCh38):13:99,501,471-99,564,047(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
内体是细胞内的酸性区室,参与内吞途径中蛋白质的分选。 从质膜内吞的蛋白质通过网格蛋白包被的囊泡转运至早期内体,然后通过晚期内体转运至溶酶体或再循环至细胞表面。 为了应对内体的低 pH 值,内吞蛋白会发生影响其命运的结构变化。 因此,内体的pH值以及内体膜中的离子转位蛋白对于内体功能很重要。 Diaz 等人使用酵母 2-杂交系统来识别优先与 RAB9(300284) 活性形式相互作用的蛋白质(1997)分离出编码TM9SF2的部分人类cDNA。 Schimmoller 等人通过使用部分 TM9SF2 cDNA 片段筛选 Jurkat T 细胞 cDNA 文库(1998)分离出含有TM9SF2全长编码序列的cDNA,他们将其称为p76。 推导的 663 个氨基酸的 TM9SF2 蛋白的计算分子量为 76 kD。 TM9SF2 包含一个推定的信号序列、一个亲水性 N 端区域和 9 个预测的 C 端跨膜结构域。 作者证明,TM9SF2 在膜内采用 I 型拓扑,其亲水性 N 末端面向管腔。 TM9SF2 与酿酒酵母 Emp70 蛋白具有 35% 的氨基酸序列同一性。 通过间接免疫荧光显微镜观察,重组 TM9SF2 似乎定位于核内体,因为它与转铁蛋白受体(190010) 和一些甘露糖 6-磷酸受体明显共定位; 在质膜或高尔基体中未检测到 TM9SF2。 Northern印迹分析在所有测试的人体组织中检测到约3.2-kb的TM9SF2转录物,其中在胰腺中表达最高,在肾脏中高表达,在心脏、脑、骨骼肌和胎盘中表达较低,在肺和肝脏中表达最低。 席莫勒等人(1998) 表明 TM9SF2 充当内体离子通道或小分子转运蛋白。
▼ 测绘
Gross(2014) 根据 TM9SF2 序列(GenBank BC110656) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 TM9SF2 基因对应到染色体 13q32.3。