TCL1 上游神经分化相关 RNA; TUNAR

• TCL1上游神经元相关RNA； TUNA
• 长基因间非编码 RNA 617； LINC00617
• lincRNA TUNAR

HGNC 批准的基因符号：TUNAR

细胞遗传学位置：14q32.2 基因组坐标（GRCh38）：14:95,876,391-95,925,570（来自 NCBI）

▼ 说明

长非编码 RNA（lncRNA），例如 TUNAR，是参与基因表达的超过 200 个核苷酸的调节 RNA。 LncRNA 由 RNA 聚合酶转录、5-引物加帽、剪接和聚腺苷酸化（Lin 等人总结，2014）。

▼ 克隆与表达

林等人（2014） 从 CCE 小鼠胚胎干细胞（mESC） 系中克隆了小鼠 Tunar，他们将其称为 Tuna、linc86023 或 Megamind。 RACE、Northern blot 和数据库分析揭示了 2 个金枪鱼剪接变体，分别含有 3,181 和 2,876 个核苷酸。 数据库分析揭示了人类直向同源物，它在 H1 人类 ESC 以及来自青少年和成人大脑的神经元（而非非神经元）细胞核中活跃转录。 对 15 种小鼠组织、胚胎和细胞进行的定量 RT-PCR 分析发现，Tuna 在成年大脑和脊髓中的表达最高，而在成年眼睛、mESC 和 15 天小鼠胚胎中的表达要低得多。 TUNA 在人类小脑中也高表达，在整个成人和胎儿大脑以及成人睾丸中表达较低。 微阵列分析显示 TUNA 在人类大脑的几个区域中表达，但在新皮质中没有表达。 在丘脑中检测到最高表达。 金枪鱼富集于 mESC 的核部分，但也在细胞质部分中发现。

▼ 基因功能

林等人（2014） 发现，操纵金枪鱼在 mESC 中的表达会影响整体基因表达，与细胞分化、增殖、细胞死亡和神经发生有关的基因发生显着变化。 金枪鱼与 Ptbp1（600693）、Hnrnpk（600712） 和 Ncl（164035） 形成 RNA-多蛋白复合物。 该复合物在 Sox2（184429）、Nanog（607937） 和 Fgf4（164980） 的启动子处特异性富集。 mESC 中金枪鱼的敲低会降低多能性相关的 Nanog 和 Oct4（POU5F1; 164177） mRNA 的表达，而金枪鱼过表达会增加这些基因的表达并促进细胞增殖。 TUNA 的敲低也阻断了 H9 人类 ESC 的神经分化。

▼ 基因结构

林等人（2014）确定TUNAR基因含有2个外显子。

▼ 测绘

通过基因组序列分析，Lin 等人（2014） 将 TUNAR 基因对应到染色体 14q32。 他们将小鼠 Tunar 基因定位到 12F1 号染色体上。

▼ 动物模型

林等人（2014） 发现吗啉介导的斑马鱼金枪鱼敲低会损害它们对触摸的反应。