ATP 酶,磷脂转运,10A; ATP10A
- ATP 酶,V 类,10A 型
- ATP酶,V类,10C型; ATP10C
- ATPVC
HGNC 批准的基因符号:ATP10A
细胞遗传学定位:15q12 基因组坐标(GRCh38):15:25,672,240-25,865,143(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
长濑等人(1998) 从大脑中分离出编码 ATP10C 的部分 cDNA,他们将其命名为 KIAA0566。 基于同源性分析,他们预测 ATP10C 可能是一种钙转运 ATP 酶。 RT-PCR 分析检测到广泛表达,在肾脏中表达量最高,其次是肺、脑、前列腺、睾丸、卵巢和小肠。
▼ 测绘
通过辐射杂交分析,Nagase 等人。 Halleck 等(1998) 将 ATP10C 基因对应到 15 号染色体(1999) 基于基因组序列分析,将 ATP10C 基因(他们称之为 ATPVC)对应到染色体 15q11-q13。
小鼠 Atp10a 基因定位于 7 号染色体(Kayashima 等,2003)。
▼ 基因功能
ATP10A 的印记
近端 15 号染色体印记域基因组缺乏母体贡献会导致 Angelman 综合征(AS; 105830),该综合征与神经行为异常相关,包括严重智力低下、共济失调和癫痫。 尽管 AS 患者的 UBE3A 基因(601623) 很少发生突变,该基因编码长期突触增强(LTP) 所需的泛素连接酶,但大多数病例归因于染色体 15q11-q13 的母体从头缺失。 目黑等人(2001) 报道 ATP10C 基因在母体中表达,它定位在导致 AS 的最常见缺失区间内,并且在具有印记突变的 AS 患者以及染色体 15q11-q13 母体缺失的患者中实际上不存在 ATP10C 表达。 他们指出,小鼠 Atp10c 基因缺失的母系遗传会导致体脂增加(Dhar 等人,2000),并且在具有父系单亲二体性的 AS 小鼠模型中始终观察到肥胖表型(Cattanach 等人,1997)。 一部分散发性 AS 患者与类似于 Prader-Willi 综合征的肥胖有关(PWS; 176270)(Gillessen-Kaesbach 等人, 1999)。 目黑等人(2001)推测ATP10C可能是参与磷脂转运的氨基磷脂转位酶。
赫津等人(2001)报道ATP10C位于UBE3A远端200 kb内,并且与UBE3A一样,在人脑中表现出印记的、优先的母体表达。 他们认为 ATP10C 是 15 号染色体相关自闭症和天使综合征表型的候选者。
柏木等人(2003) 证明小鼠 Atp10c 基因在海马和嗅球中显示出组织特异性母体表达,这与印记 Ube3a 表达的区域重叠。 数据表明,中枢神经系统特定区域的 Atp10c 印迹转录本可能与神经系统疾病(包括 AS 和自闭症)有关。
茅岛等人(2003)指出小鼠Atp10a基因位于小鼠7号染色体上印记结构域的边界。RT-PCR检测到Atp10a在所有检查的小鼠组织中表达,其中在脑、肺、脾、白色脂肪组织和皮肤中表达最高。 Atp10a 在所有检查的胚胎和成体组织中均双等位表达。 该基因的启动子区域没有等位基因特异性甲基化,也没有可以控制其表达的反义转录本。 茅岛等人(2003) 得出结论,小鼠 Atp10a 基因逃脱了基因组印记。
Hogart 等人通过对 16 个正常对照脑样本进行 RT-PCR 分析(2008)发现10个(62.5%)表现出双等位基因表达,6个(37.5%)表现出单等位基因表达。 与母体表达印迹基因的预期相反,定量 RT-PCR 显示,由于单亲二体性(PWS-UPD),具有 2 条母体染色体的 PWS 大脑中 ATP10A 转录物显着减少。 此外,具有单等位基因 ATP10A 表达的 PWS-UPD 大脑样本表明,单等位基因表达可能与印记无关。 霍加特等人(2008) 发现性别影响等位基因 ATP10A 表达,因为女性比男性更有可能具有单等位基因 ATP10A 表达(p = 0.0128)。 破坏 SP1(189906) 转录因子结合的启动子多态性可能导致雌性等位基因表达差异。 霍加特等人(2008) 得出结论,ATP10A 的单等位基因表达在人群中是可变的,并且受到性别和常见遗传变异的影响。