SPRY4 INTRONIC 转录 1,非编码; SPRY4IT1
- 长非编码 RNA SPRY4IT1
- lncRNA SPRY4IT1
- SPRIGHTLY
HGNC 批准的基因符号:SPRY4-IT1
细胞遗传学位置:5q31.3 基因组坐标(GRCh38):5:142,317,619-142,318,321(来自 NCBI)
▼ 说明
SPRY4IT1 是源自 SPRY4 基因内含子的长非编码 RNA(lncRNA)(607984)(Khaitan et al., 2011)。
▼ 克隆与表达
凯坦等人(2011)报道SPRY4IT1是从SPRY4基因的第二个内含子转录的687个核苷酸的未剪接的多腺苷酸化lncRNA。 SPRY4IT1 区域在灵长类动物基因组之外并不保守,并且在小鼠中未检测到 EST 表达。 计算方法预测了 SPRY4IT1 二级结构中的几个长发夹,这些长发夹在 31 种真兽类哺乳动物的直系同源序列中不显着保守。 对 20 个人体组织(不包括皮肤)进行的定量 RT-PCR 显示,SPRY4IT1 在胎盘、肾脏和肺中表达最高,在脑、子宫颈、肝脏、小肠和气管中表达较低,在其余组织中几乎没有表达。 RNA-FISH显示SPRY4IT1主要定位于转染的人黑色素瘤细胞的细胞质中,在细胞核中也有一些点状定位。
▼ 基因功能
通过微阵列和定量 RT-PCR,Khaitan 等人(2011) 发现与黑色素细胞对照系相比,黑色素瘤细胞系中 SPRY4IT1 的上调。 与黑色素细胞对照相比,黑色素瘤患者样本中 SPRY4IT1 的表达也上调。 通过人黑色素瘤细胞中的小干扰 RNA 敲低 SPRY4IT1,会导致细胞生长缺陷、侵袭和迁移能力下降以及细胞凋亡增加。 通过划痕实验,黑色素瘤细胞中 SPRY4IT1 的过度表达增加了迁移速度。
▼ 测绘
Gross(2017) 根据 SPRY4IT1 序列(GenBank NR_131221) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 SPRY4IT1 基因对应到染色体 5q31.3。
凯坦等人(2011) 报道 SPRY4IT1 位于 SPRY4 基因的内含子 2 内。