跨膜蛋白 79; TMEM79
- MATTRIN,小鼠,同系物;MATT
HGNC 批准的基因符号:TMEM79
细胞遗传学位置:1q22 基因组坐标(GRCh38):1:156,282,931-156,292,442(来自 NCBI)
▼ 描述
TMEM79 是一种皮肤屏障相关蛋白(Sasaki et al., 2013)。
▼ 克隆和表达
Sasaki 等人(2013)克隆小鼠Tmem79。推导的 391 个氨基酸蛋白质的计算分子量为 43.4 kD。它具有一个细胞质 N 端结构域,随后是 5 个 C 端跨膜结构域。佐佐木等人(2013) 还鉴定了具有替代第一外显子的小鼠 Tmem79 变体。Northern 印迹分析检测到约 2 kb 转录物在皮肤中的表达最高,其次是睾丸、肾脏、胸腺和肺。在心脏、大脑、脾脏或肝脏中未检测到表达。定量 RT-PCR 证实 Tmem79 在皮肤中表达最高,主要在表皮中。免疫组织化学分析显示,人类和小鼠颗粒层细胞的细胞质中 TMEM79 表达最高,它与跨高尔基体网络的标记物共定位。
桑德斯等人孤立地(2013) 克隆了小鼠 Tmem79,他们将其称为 mattrin,并通过数据库分析,他们鉴定出了人类 mattrin。RT-PCR 对 48 个人体组织检测到广泛的 mattrin mRNA 表达,其中在皮肤中表达较高。免疫组织化学分析在小鼠和人类的表皮颗粒层细胞和毛囊中检测到 mattrin。
▼ 基因结构
Saunders 等人(2013)指出TMEM79基因包含5个外显子。
▼ 测绘
Saunders 等人的地图(2013) 报道 TMEM79 基因定位于染色体 1q23.1。小鼠 Tmem79 基因定位到与人类染色体 1q23.1 具有同线性同源性的 3F1 染色体区域。
▼ 基因功能
Kannan 等人(2011) 在几种前列腺癌和前列腺癌细胞系中鉴定出嵌合转录本,该转录本是由上游 SMG5 基因(610962) 和相反链上下游 TMEM79 基因之间剪接产生的。RT-PCR 还检测了前列腺癌、前列腺癌细胞系和正常前列腺上皮中单个 SMG5 和 TMEM79 基因的表达。然而,在正常前列腺上皮或正常前列腺上皮细胞系中未检测到SMG5-TMEM79嵌合转录物。
▼ 分子遗传学
Saunders 等人使用固定效应模型对来自英国和德国的 4,245 名特应性皮炎(AD;参见 603165)患者和 10,558 名对照者进行荟萃分析(2013) 发现 TMEM79 内 SNP rs6684514 的次要等位基因(A) 对特应性皮炎表现出微小但显着的保护作用(比值比(OR) = 0.91;95% CI = 0.86-0.96;p = 0.001)。随机效应荟萃分析产生了类似的结果(OR = 0.90;95% CI = 0.82-0.98;p = 0.015)。
▼ 动物模型
具有缠结(ma)突变的纯合小鼠会出现类似于人类特应性皮炎的缠结毛发和湿疹,并且它们表现出抓挠行为。佐佐木等人(2013)发现ma/ma小鼠比野生型小鼠表现出更高的跨上皮失水率和更低的角质层水合作用,并伴有组织学变化,例如棘皮症伴白细胞浸润。早在 1 周时就观察到 ma/ma 小鼠的皮肤缺陷。佐佐木等人(2013) 在 ma/ma 小鼠的 Tmem79 基因中发现了 tyr280-to-ter(Y280X) 突变。该突变删除了 Tmem79 蛋白的最后 3 个跨膜结构域。ma/ma小鼠的皮肤显示出分泌到用于形成角质层的颗粒层的蛋白质减少。突变的皮肤还表现出对物理压力的抵抗力降低。ma/ma 表型通过野生型 Tmem79 的转基因表达而逆转。佐佐木等人(2013) 得出结论,TMEM79 是一种皮肤屏障相关蛋白,参与通过层状颗粒分泌系统的分泌。
桑德斯等人孤立地(2013) 将 Tmem79 中的 Y280X 突变鉴定为 ma 突变。与野生型皮肤相比,ma/ma皮肤表现出角化细胞包膜紊乱、角化缺陷、毛发脆弱且聚集且毛囊扭曲、具有广泛病理学的明显皮肤炎症以及IgE水平升高。Ma/ma 小鼠对屋尘螨过敏原的攻击也高度敏感。