DEAH框解旋酶33; DHX33
- DEAH框 多肽 33
HGNC 批准的基因符号:DHX33
细胞遗传学定位:17p13.2 基因组坐标(GRCh38):17:5,440,916-5,469,054(来自 NCBI)
▼ 说明
RNA 解旋酶 DEAD/DEAH 框家族的成员(例如 DHX33)通过水解 ATP 或其他三磷酸核苷(NTP) 来修饰 RNA 的高阶结构。 这些酶在 RNA 转录、RNA 编辑、前 mRNA 剪接、核糖体生物发生和 RNA 衰变中发挥作用(Zhang 等人总结,2011)。
▼ 克隆与表达
核糖体 RNA(rRNA) 由 RNA 聚合酶 I(参见 POLR1B;602000)转录为 47S 多顺反子前体,加工成成熟的 18S、5.8S 和 28S rRNA。 张等人使用 RNA 干扰筛选来识别干扰人成纤维细胞中 rRNA 转录的 DDX/DHX 酶(2011) 鉴定出 DHX33。 推导的蛋白质包含 N 端 ATP/NTP 结合结构域、中心 ATP/NTPase 结构域、C 端解旋酶和 ATP/NTP 水解依赖性底物相互作用基序。 对人乳腺癌细胞系以及人和小鼠成纤维细胞的分级分离以及免疫组织化学分析表明,DHX33 主要定位于核仁标记物,部分定位于核质中。 在细胞周期中核仁分散后,DHX33 跟随核仁蛋白到达核仁组织区域。
▼ 基因功能
张等人(2011) 发现人类细胞系中 DHX33 的敲低会抑制 rRNA 转录和加工,减小核仁大小,引起核仁应激,并启动 p53(TP53; 191170) 依赖性应激反应,包括细胞周期停滞和 p21(CDKN1A; 116899) 的诱导。 突变分析表明 DHX33 催化结构域内的 lys94(K94) 对于 rRNA 转录至关重要。 DHX33 缺陷减少了大 RNA 聚合酶亚基 RPA194(POLR1A; 616404) 向 rDNA 位点的募集,并减少了 RNA 聚合酶 I 活性所需的 UBF(UBTF; 600673) 磷酸化。 在人类细胞系中,野生型 DHX33(而非具有 K94 突变的 DHX33)的过度表达会刺激 47S 合成。 DHX33 的过度表达及其假定的 DNA 结合域的缺失也减少了 rRNA 的合成。 对人乳腺癌细胞的染色质免疫沉淀分析表明,DHX33 与 RPA194 一样,占据整个 rDNA 启动子和转录区域,并且结合需要 DHX33 的 DNA 结合基序。 DHX33 还用 UBF 进行免疫沉淀。 张等人(2011) 得出结论,DHX33 在细胞生长和 rRNA 合成中起着关键作用。
▼ 测绘
Hartz(2011) 根据 DHX33 序列(GenBank AL359945) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 DHX33 基因定位到染色体 17p13.2。