DNA 交联修复蛋白 1A; DCLRE1A
- SNM1,酿酒酵母,同系物; SNM1
-SNM1,酿酒酵母,A的同源物; SNM1A - KIAA0086
HGNC 批准的基因符号:DCLRE1A
细胞遗传学位置:10q25.3 基因组坐标(GRCh38):10:113,834,724-113,854,393(来自 NCBI)
▼ 说明
DNA 链间交联可防止链分离,从而物理阻断 DNA 的转录、复制和分离。 DCLRE1A 是参与链间交联修复的几个进化保守基因之一(Dronkert 等,2000)。
▼ 克隆与表达
Nagase 等人通过对从大小分级的人未成熟骨髓细胞系 cDNA 文库中获得的克隆进行测序,(1995) 克隆了 DCLRE1A,他们将其称为 KIAA0086。 推导的 1,040 个氨基酸蛋白在 192 个氨基酸中与酿酒酵母 DNA 修复蛋白 Snm1 具有 33.3% 的同一性。 Northern印迹分析检测到除外周血白细胞外的所有组织和细胞系中的表达。
德朗克特等人(2000) 确定人类 DCLRE1A(他们称之为 SNM1)在其 N 端半部包含一个核定位信号和一个锌指基序,在其 C 端半部包含与各种物种的 SNM1 样蛋白共享的 8 个基序。 荧光标记的 SNM1 定位于转染的人成纤维细胞和中国仓鼠卵巢细胞的细胞核,但被排除在核仁之外。
Richie 等人使用 Northern blot 分析(2002) 在所有检查的组织中检测到 4.5-kb SNM1 转录物,其中在胰腺和大脑中表达最高。 荧光标记的 SNM1 以 3 种不同的模式定位于单个转染的 HeLa 和人乳腺癌细胞的细胞核:弥漫性核染色、多个核灶或 1 或 2 个较大的核体。
▼ 基因功能
德朗克特等人(2000) 发现过表达人类 SNM1 的细胞在引入 SNM1 几天后经历了与细胞凋亡一致的形态变化。
里奇等人(2002) 发现细胞暴露于电离辐射或链间交联剂会改变 SNM1 核定位的模式。 在这些条件下,表现出 SNM1 体的细胞数量减少,而具有 SNM1 灶的细胞数量增加。 免疫荧光研究表明,SNM1 在暴露于电离辐射之前和之后与 53BP1(TP53BP1;605230) 共定位,并且共免疫沉淀测定证实了这种相互作用。 电离辐射后形成的 SNM1 病灶在很大程度上与 MRE11(MRE11A; 600814) 形成的病灶一致,并在较小程度上与 BRCA1(113705) 形成的病灶一致,但与 RAD51(179617) 形成的病灶不同。 SNM1 形成焦点不需要 ATM(607585)。
▼ 基因结构
Demuth 和 Digweed(1998) 确定 DCLRE1A 基因包含 9 个外显子,长度约为 20 kb。 上游区域包含 GC 框,但没有 TATA 框,并具有 1 个 SP1(189906) 位点、3 个 AP1(参见 JUN;165160)位点、4 个 AP4(TFAP4;600743)位点和 1 个 NFKB(参见 164011)位点。
▼ 测绘
通过检查一组人类-啮齿动物杂交细胞系,Nagase 等人(1995) 将 DCLRE1A 基因定位到 10 号染色体。
▼ 动物模型
德朗克特等人(2000) 发现 Snm1 -/- 小鼠能够存活并具有生育能力,并且没有表现出重大异常,但与野生型小鼠相比,它们对丝裂霉素 C 过敏。 Snm1 -/- 小鼠胚胎干细胞的生长速度与野生型干细胞相当,但它们对丝裂霉素 C 的敏感性高出 2 倍。突变型和野生型干细胞对其他 DNA 链间交联剂、紫外线照射和伽马照射表现出相同的敏感性。