Sentrin 特异性蛋白酶家族,成员 8; SENP8
- NEDD8 特异性蛋白酶 1; NEDP1
- 脱氧核苷酶 1; DEN1
HGNC 批准的基因符号:SENP8
细胞遗传学位置:15q23 基因组坐标(GRCh38):15:72,114,257-72,143,691(来自 NCBI)
▼ 说明
NEDD8(603171) 是一种泛素样蛋白,可与多种泛素连接酶的 滞蛋白(参见 CUL1;603134)亚基缀合。 这种缀合称为 neddylation,是获得最佳泛素连接酶活性所必需的。 需要 NEDD8 特异性 Deneddylases,例如 NEDP1 或 DEN1,在 C 端二甘氨酸基序处加工 NEDD8 前肽,并从 滞蛋白 中去除 NEDD8(Gan-Erdene 等,2003)。
▼ 克隆与表达
Mendoza 等人在数据库中搜索与酵母 Ulp1 相似的序列,然后对肾脏 cDNA 文库进行 PCR(2003)克隆了NEDP1。 推导的 212 个氨基酸的蛋白质包含一个半胱氨酸蛋白酶结构域,两侧是短的 N 端和 C 端延伸。 PCR分析显示NEDP1广泛表达,其中在肾脏和胰腺中表达最高。
吴等人(2003) 基于 DEN1 对 CUL1 底物去甲基化的能力,从 HeLa 细胞中纯化了 DEN1。 通过搜索与 DEN1 胰蛋白酶片段相似的序列,然后对胎儿脑 cDNA 文库进行 PCR,他们克隆了 DEN1。 蛋白质印迹分析检测到纯化的蛋白质的表观分子量为 24 kD。
▼ 基因功能
门多萨等人(2003) 证实细菌中表达的重组 NEDP1 在二甘氨酸基序中的第二个甘氨酸之后加工 NEDD8 前体蛋白,但它不加工 SUMO1(601912) 或泛素(参见 191339)。 NEDP1 对全长 SUMO1、SUMO2(603042) 或 SUMO3(602231) 没有活性。 抑制和诱变研究表明 NEDP1 是一种半胱氨酸蛋白酶。 NEDP1 在体外将 NEDD8 从 CUL2(603135) 中解偶联,在体内将 NEDD8 从修饰后的 CUL4A(603137) 中解偶联。
吴等人(2003) 在体外 Pull-down 测定中确定重组 DEN1 结合 NEDD8,但与 SUMO1 和泛素的结合要低得多。 他们表明,DEN1 将 NEDD8 前体蛋白加工成成熟蛋白,并且 DEN1 解偶联超尼德基化的 CUL1。
甘额尔德尼等人(2003) 发现 DEN1 催化 NEDD8 底物水解的速率远高于其催化泛素底物的速率。 它不催化 SUMO1 底物的水解。
▼ 测绘
国际辐射混合测绘联盟将 NEDP1 基因定位到 15 号染色体(SGC33966)。