FYVE、RhoGEF 和 PH 结构域蛋白 3; FGD3
- 锌指 FYVE 结构域蛋白 5; ZFYVE5
HGNC 批准的基因符号:FGD3
细胞遗传学位置:9q22.31 基因组坐标(GRCh38):9:92,947,522-93,036,235(来自 NCBI)
▼ 说明
FGD3 预计可作为 CDC42(116952) 的鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF),控制肌节蛋白细胞骨架动力学和细胞膜丝状伪足的形成(Pasteris 等人,2000)。
▼ 克隆与表达
巴斯德里斯等人(2000) 从脾 cDNA 文库中克隆了小鼠和人 FGD3。 推导的 733 个氨基酸的小鼠蛋白包含一个 N 端 RhoGEF 结构域,随后是一个 血小板-白细胞C 激酶底物 同源(PH) 结构域、一个 FYVE 结构域和靠近 C 端的第二个 PH 结构域。 PH 结构域预计在细胞信号传导中发挥作用,FYVE 结构域预计与磷脂酰肌醇 3-磷酸结合。 Fgd3 与 Fgd1(300546) 具有高度的结构域相似性,但缺少 Fgd1 N 末端富含脯氨酸的区域。 Northern 印迹分析检测到 5.0 kb Fgd3 转录物在成年小鼠大脑、脾脏、肺和骨骼肌中强烈表达,但在心脏、肝脏、肾脏或睾丸中没有表达。 在这些小鼠组织中还观察到了 5.4 kb 的转录物。 在所检查的所有胚胎小鼠阶段均观察到 5.0-kb 转录物,其中在胚胎第 11 天表达最高。
▼ 基因功能
巴斯德里斯等人(2000) 发现小鼠 Fgd3 在瑞士 3T3 细胞中显微注射后产生显着且快速的丝状伪足延伸诱导。 Fgd3 不会诱导应力纤维或明显的片状伪足的形成,与 Fgd1 类似,Fgd1 充当 Cdc42 的 GEF。
▼ 测绘
Pasteris 等人通过人仓鼠杂交组 PCR 和辐射杂交分析(2000) 将 FGD3 基因定位到染色体 9q22。 他们将小鼠 Fgd3 基因定位到 13 号染色体的近端,该基因与人类染色体 9q22 具有同源性。
Hartz(2017) 根据 FGD3 序列(GenBank AK000004) 与基因组序列(GRCh38) 的比对,将 FGD3 基因对应到染色体 9q22.31。