富含亮氨酸重复序列和免疫球蛋白样结构域的蛋白质 1; LRIG1
- LIG1
HGNC 批准的基因符号:LRIG1
细胞遗传学定位:3p14.1 基因组坐标(GRCh38):3:66,378,796-66,501,120(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
Nilsson 等人通过寻找与小鼠 Lig1 相似的蛋白质,然后对人脑 cDNA 文库进行 PCR,发现了这一点(2001) 克隆了 LRIG1,他们将其命名为 LIG1。 推导的 1,093 个氨基酸的蛋白质包含一个胞外 N 末端区域,其中有 15 个富含亮氨酸的重复序列和 3 个 C2 型免疫球蛋白样结构域,随后是一个跨膜区域和一个胞质尾部。 LRIG1 有 6 个潜在的 N-糖基化位点。 小鼠和人类 LRIG1 具有 83% 的氨基酸一致性,在细胞外、跨膜和近膜区域具有最高的保守性。 Northern印迹分析检测到约5.5 kb的LRIG1转录本在脑、心脏、肾、骨骼肌、胃和睾丸中大量表达。 定量 RT-PCR 检测到所有检查组织中的表达,其中脑中表达最高。 表达量最低的是脾脏,其表达量比脑低 240 倍。
通过定量 PCR 分析,Guo 等人(2004) 检测到 LRIG1 普遍存在但变化的表达。 肝脏中表达最高,其次是胃和脑,胎盘中表达最低。 对几种小鼠组织的分析表明普遍存在表达,但表达模式与人体组织不同。
▼ 基因功能
通过单细胞表达谱,Jensen 和 Watt(2006) 发现 LRIG1 在富含干细胞的人滤泡间表皮的基底细胞群中表达。 LRIG1的过度表达降低了角质形成细胞的增殖,但不影响干细胞和转运扩增细胞的比例。 siRNA 下调 LRIG1 会增加细胞表面 EGF 受体(131550) 水平,增强下游通路的激活并刺激增殖。 LRIG1 的部分作用是通过负向调节 MYC(190080) 启动子来发挥作用。 Jensen 和 Watt(2006) 提出 LRIG1 将表皮干细胞维持在静止的非分裂阶段,并且 LRIG1 下调会触发增殖。
▼ 基因结构
尼尔森等人(2001) 确定 LRIG1 基因包含 19 个外显子,跨度为 225 kb。
▼ 测绘
作者:FISH,Nilsson 等人(2001) 将 LRIG1 基因定位到染色体 3p14。 郭等人(2004) 将小鼠 Lrig1 基因定位到 6D2 染色体的一个区域,该区域显示出与人类染色体 3p14 的同线性同源性。