SHP2 相互作用跨膜接头蛋白 1; SIT1
HGNC 批准的基因符号:SIT1
细胞遗传学定位:9p13.3 基因组坐标(GRCh38):9:35,649,294-35,650,930(来自 NCBI)
▼ 正文
T 细胞激活需要刺激 T 细胞受体(TCR;参见 186880)-CD3(参见 CD3Z;186780)复合物,然后招募一系列细胞内信号蛋白(例如 GRB2(108355) 和 PLCG1(172420))。 介导细胞外受体和细胞内信号传导通路之间相互作用的是接头蛋白,例如 LAT(602354) 和 TRIM(604962)。
▼ 克隆与表达
Marie-Cardine 等人通过对已用 TRIM 共纯化的 30/40-kD 二硫键连接的同二聚糖蛋白进行胰蛋白酶肽序列分析,然后搜索 EST 数据库,(1999) 鉴定了一种编码 196 个氨基酸的推导蛋白质的 cDNA,他们将其命名为 SIT。 序列分析预测SIT具有假定的22个氨基酸的疏水前导肽、含有潜在的N-糖基化位点和可能参与链间二硫键的半胱氨酸残基的18个氨基酸的胞外结构域、20个氨基酸的跨膜结构域和含有多个潜在的磷酸化位点的136个氨基酸的胞内部分。 SIT 还包含 6 个酪氨酸残基,其中 5 个可能参与磷酸化后 Src(190090) 同源性 2(SH2) 结构域介导的蛋白质-蛋白质相互作用。 SIT 的细胞质部分具有潜在的基于免疫受体酪氨酸的抑制基序(ITIM),表明可能与 SHP1(PTPN6; 176883) 或 SHP2(PTPN11; 176876) 相互作用。 蛋白质印迹分析表明,SIT 表达为约 40 kD 的蛋白质,通过糖苷内切酶处理可将其减少至约 20 kD。 Northern 印迹分析检测到胸腺中大约 1.6 kb SIT 转录物的强表达,而脾脏和淋巴结中检测到较低的表达。 在外周血白细胞、骨髓和T细胞系中检测到弱表达,但在单核细胞系中未检测到表达。 免疫荧光显微镜和免疫沉淀分析定位了细胞膜中过度表达的 SIT。 蛋白质印迹分析表明,SIT 是 Src 蛋白激酶 FYN(137025) 和 LCK(153390) 以及 ZAP70(176947) 的底物。 研究表明,过表达的 SIT 通过磷脂酶 C 上游的机制(参见 PLCG1;172420)充当激活 T 细胞核因子(NFAT;参见 600489)转录活性的负调节因子,并且 SIT 通过 ITIM 将 SHP2 而不是 SHP1 募集到细胞膜上。
▼ 基因结构
胡本纳等人(2001) 确定 SIT 基因包含 5 个外显子,跨度为 1.8 kb 的基因组 DNA。 SIT 启动子表现出强大的转录活性和普遍存在的和淋巴特异性转录因子的潜在结合位点。
▼ 测绘
作者:FISH,Hubener 等人(2001) 将 SIT1 基因定位到染色体 9p13-p12。