11 号染色体开放解读码组 54; C11ORF54
- PTD012
HGNC 批准的基因符号:C11orf54
细胞遗传学位置:11q21 基因组坐标(GRCh38):11:93,741,671-93,764,748(来自 NCBI)
▼ 克隆与表达
曼杰塞蒂等人(2006) 报道称 C11ORF54 基因(他们称之为 PTD012)产生 6 个剪接变体。 其中一种较长的亚型包含 315 个氨基酸,在小鼠、鱼类、苍蝇、真菌和线虫中具有直向同源物。
▼ 基因功能
曼杰塞蒂等人(2006) 发现,当在大肠杆菌中表达时,人 PTD012 的重组 315 个氨基酸同工型显示出针对乙酸对硝基苯酯的酯水解酶活性,形成硝基苯酚酯和乙酸酯。 PTD012没有表现出碳酸酐酶或羧肽酶活性。
▼ 生化特征
通过检查重组人 PTD012 的晶体结构,Manjasetty 等人(2006) 得出结论,蛋白质在溶液中以单体形式存在。 PTD012呈大致球形,由20个β链和4个α螺旋组成,直径约为45埃。 九条反向平行 β 链形成了一个 β 螺旋区域,其结构与蛋白激酶 A 调节亚基的 cAMP 结合域(PRKAR1A;188830) 相似。 PTD012 和 PRKAR1A 的这个区域也有一个 HxH 基序,预计可以协调锌。 PTD012 的锌结合位点结合取自结晶缓冲液的乙酸盐分子。 曼杰塞蒂等人(2006) 指出乙酸盐是 PTD012 水解对硝基苯乙酸盐的产物,表明与锌结合的乙酸盐可能代表酶-产物复合物。
▼ 测绘
Hartz(2014) 根据 C11ORF54 序列(GenBank AF092133) 与基因组序列(GRCh37) 的比对,将 C11ORF54 基因对应到染色体 11q21。